ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Sorghum bicolor chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008602	ATT	4	111	123	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_008602	CAG	4	1206	1217	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	118614472
3	NC_008602	CTT	4	7273	7283	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_008602	TAT	6	7735	7753	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
5	NC_008602	GAA	4	9471	9482	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_008602	TTG	4	11804	11814	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	118614478
7	NC_008602	TAA	4	18550	18560	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_008602	ATA	4	21471	21481	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_008602	CTA	4	21808	21819	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_008602	AGA	4	22890	22901	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	118614482
11	NC_008602	AGA	4	29994	30005	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	118614484
12	NC_008602	ATT	4	32548	32560	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_008602	ATT	4	33416	33427	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_008602	GTT	5	34217	34231	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	118614486
15	NC_008602	TGC	4	35130	35141	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	118614487
16	NC_008602	TAT	5	39077	39090	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_008602	ATG	4	41266	41276	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	118614491
18	NC_008602	GCA	4	43164	43175	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	118614492
19	NC_008602	AAG	4	45268	45279	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	157011954
20	NC_008602	GAA	4	49267	49277	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_008602	ATA	4	49287	49297	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_008602	TTC	4	63176	63187	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	118614505
23	NC_008602	ATA	4	65417	65427	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_008602	TTA	4	65950	65961	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_008602	CTT	5	67780	67793	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
26	NC_008602	TCA	4	70294	70305	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	118614537
27	NC_008602	AGA	4	76979	76990	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	118614537
28	NC_008602	TAT	4	78036	78046	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	118614537
29	NC_008602	TTC	4	81503	81515	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	118614537
30	NC_008602	TTC	4	81975	81986	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	118614537
31	NC_008602	CTT	4	83102	83113	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118614537
32	NC_008602	AAT	4	83611	83623	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	118614537
33	NC_008602	ATA	4	92016	92026	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	118614537
34	NC_008602	TAC	4	93835	93846	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	118614537
35	NC_008602	AAG	4	107332	107343	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	118614550
36	NC_008602	CAA	4	112462	112472	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	118614550
37	NC_008602	TTA	4	113293	113303	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	118614550
38	NC_008602	TTG	4	113747	113757	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	118614550
39	NC_008602	ATT	4	115402	115412	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	118614550
40	NC_008602	TTC	5	115578	115592	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	118614550
41	NC_008602	GTA	4	130642	130653	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	118614550

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Sorghum bicolor chloroplast