ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Agrostis stolonifera chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008591	CAG	4	1213	1224	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	118430282
2	NC_008591	TAA	4	8364	8374	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_008591	GAA	4	8764	8775	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_008591	TTG	4	11056	11066	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	118430288
5	NC_008591	TAT	4	15075	15085	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_008591	CCA	4	18463	18474	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
7	NC_008591	ATA	4	19082	19092	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_008591	AGA	4	20507	20518	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	118430292
9	NC_008591	AAC	4	23168	23179	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	118430293
10	NC_008591	AAT	4	24856	24867	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	118430293
11	NC_008591	AAG	4	28069	28079	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	118430294
12	NC_008591	GAA	4	28191	28202	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	118430294
13	NC_008591	ATT	4	29994	30006	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_008591	GTT	5	31674	31688	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	118430296
15	NC_008591	TGC	4	32362	32373	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	118430297
16	NC_008591	GCA	4	40355	40366	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	118430302
17	NC_008591	AAG	4	42513	42524	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	118430303
18	NC_008591	AGT	4	42920	42930	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	118430303
19	NC_008591	ATA	4	46512	46524	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_008591	CTT	4	48032	48043	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_008591	GAA	4	58850	58862	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_008591	GAA	4	58866	58876	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_008591	TTC	4	61059	61070	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	118430315
24	NC_008591	TTA	4	63779	63790	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_008591	AGA	4	74797	74808	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	118430347
26	NC_008591	TAT	4	75855	75865	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	118430347
27	NC_008591	ATT	4	76444	76454	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	118430347
28	NC_008591	TAT	5	79296	79310	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	118430347
29	NC_008591	TTC	4	82107	82117	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	118430347
30	NC_008591	TAC	4	90575	90586	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	118430347
31	NC_008591	AAG	4	104201	104212	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	118430361
32	NC_008591	TAA	4	105263	105273	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	118430361
33	NC_008591	CAA	5	106108	106123	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	118430361
34	NC_008591	CAA	4	109530	109540	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	118430361
35	NC_008591	AAT	4	110133	110144	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	118430361
36	NC_008591	AAT	4	110324	110335	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	118430361
37	NC_008591	TAT	4	110358	110370	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	118430361
38	NC_008591	TAA	4	115747	115757	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	118430361
39	NC_008591	GTA	4	127611	127622	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	118430361

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Agrostis stolonifera chloroplast