ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Hordeum vulgare subsp. vulgare chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008590	CAG	4	1212	1223	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	118430368
2	NC_008590	GAA	4	8725	8736	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008590	TTG	4	11025	11035	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	118430374
4	NC_008590	TAT	4	17466	17476	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_008590	ATA	4	19297	19307	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_008590	AGA	4	20715	20726	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	118430378
7	NC_008590	AAC	4	23371	23382	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	118430379
8	NC_008590	AAT	4	25059	25070	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	118430379
9	NC_008590	ATT	4	30265	30278	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_008590	GTT	5	31948	31962	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	118430382
11	NC_008590	TGC	4	32673	32684	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	118430383
12	NC_008590	CTA	4	40335	40346	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	118430388
13	NC_008590	AGT	4	43252	43262	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	118430389
14	NC_008590	TAA	4	48271	48283	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_008590	TAA	4	50799	50810	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008590	GAA	4	59025	59035	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_008590	TTC	4	61238	61249	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	118430400
18	NC_008590	TTA	4	63847	63858	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_008590	AAT	4	64188	64199	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008590	AAG	4	64783	64795	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_008590	TTC	5	65706	65720	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
22	NC_008590	AGA	4	74852	74863	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	118430432
23	NC_008590	TAT	5	75909	75922	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	118430432
24	NC_008590	ATT	4	76498	76508	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	118430432
25	NC_008590	CTT	5	81051	81064	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	118430432
26	NC_008590	TTC	4	82166	82176	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	118430432
27	NC_008590	TAC	4	90527	90538	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	118430432
28	NC_008590	CAA	4	109497	109507	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	118430445
29	NC_008590	GTA	4	127596	127607	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	118430445

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Hordeum vulgare subsp. vulgare chloroplast