Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Thalassiosira pseudonana chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008589GGT418771888120 %33.33 %66.67 %0 %8 %118411096
2NC_008589ACC4666566751133.33 %0 %0 %66.67 %9 %118411100
3NC_008589TAA4769277041366.67 %33.33 %0 %0 %7 %118411102
4NC_008589CAG4986398741233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %118411104
5NC_008589ATT413401134121233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_008589GGT41649016501120 %33.33 %66.67 %0 %8 %118411112
7NC_008589TTG41697716988120 %66.67 %33.33 %0 %8 %118411112
8NC_008589GAA417009170201266.67 %0 %33.33 %0 %8 %118411112
9NC_008589TAT417700177101133.33 %66.67 %0 %0 %9 %118411113
10NC_008589ATT418651186621233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411113
11NC_008589ATT420541205521233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411118
12NC_008589TTA422024220351233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411121
13NC_008589TGG42687726888120 %33.33 %66.67 %0 %8 %118411125
14NC_008589TAA429165291751166.67 %33.33 %0 %0 %9 %118411127
15NC_008589TAT430116301271233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411127
16NC_008589AGA431770317811266.67 %0 %33.33 %0 %8 %118411127
17NC_008589ATT432776327871233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411128
18NC_008589ATT438865388751133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
19NC_008589TGT44135041361120 %66.67 %33.33 %0 %8 %118411134
20NC_008589GGT44149541506120 %33.33 %66.67 %0 %8 %118411134
21NC_008589TTA443301433121233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411136
22NC_008589TAT543692437051433.33 %66.67 %0 %0 %7 %118411136
23NC_008589TTA444764447741133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
24NC_008589TTG44530845319120 %66.67 %33.33 %0 %8 %118411138
25NC_008589TAT446848468591233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_008589CAA447867478781266.67 %0 %0 %33.33 %8 %118411141
27NC_008589CCA447953479641233.33 %0 %0 %66.67 %8 %118411141
28NC_008589AAT449336493461166.67 %33.33 %0 %0 %9 %118411142
29NC_008589TAA451111511221266.67 %33.33 %0 %0 %8 %118411146
30NC_008589ATA451898519081166.67 %33.33 %0 %0 %9 %118411148
31NC_008589TAT452371523821233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411148
32NC_008589ATT453420534311233.33 %66.67 %0 %0 %8 %193735617
33NC_008589GTG45347953490120 %33.33 %66.67 %0 %8 %193735617
34NC_008589CTT45420654217120 %66.67 %0 %33.33 %8 %193735617
35NC_008589TAT458383583931133.33 %66.67 %0 %0 %9 %118411156
36NC_008589ATG559380593941533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %118411156
37NC_008589TCA461283612941233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %118411163
38NC_008589TTA461739617511333.33 %66.67 %0 %0 %7 %118411164
39NC_008589ATT464904649151233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411168
40NC_008589TTG46632366333110 %66.67 %33.33 %0 %9 %118411170
41NC_008589ATT471937719481233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
42NC_008589ATT472889728991133.33 %66.67 %0 %0 %9 %118411173
43NC_008589AGA573298733121566.67 %0 %33.33 %0 %6 %118411173
44NC_008589AAT473545735561266.67 %33.33 %0 %0 %8 %118411173
45NC_008589TGA476455764661233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %118411176
46NC_008589TAA477225772371366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
47NC_008589ATT477547775581233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411178
48NC_008589ATT477647776581233.33 %66.67 %0 %0 %0 %118411178
49NC_008589ATA479298793091266.67 %33.33 %0 %0 %8 %118411179
50NC_008589AGC480612806231233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %118411180
51NC_008589AAG480884808951266.67 %0 %33.33 %0 %8 %118411180
52NC_008589TAA483070830811266.67 %33.33 %0 %0 %8 %118411183
53NC_008589TCT58773787751150 %66.67 %0 %33.33 %6 %118411189
54NC_008589TTC48787187882120 %66.67 %0 %33.33 %8 %118411189
55NC_008589TAA488255882651166.67 %33.33 %0 %0 %9 %118411189
56NC_008589ATT489640896511233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
57NC_008589CAA490576905871266.67 %0 %0 %33.33 %8 %118411191
58NC_008589GGT49068090690110 %33.33 %66.67 %0 %9 %118411191
59NC_008589ATT492923929331133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
60NC_008589AAT493174931851266.67 %33.33 %0 %0 %8 %118411196
61NC_008589AGA493457934681266.67 %0 %33.33 %0 %8 %118411197
62NC_008589TGT49807998090120 %66.67 %33.33 %0 %8 %118411207
63NC_008589GTT49971399724120 %66.67 %33.33 %0 %8 %118411208
64NC_008589CTG4104375104386120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %118411218
65NC_008589GAT41044791044901233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %118411218
66NC_008589TTG4104819104830120 %66.67 %33.33 %0 %8 %118411218
67NC_008589TAT41056931057041233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
68NC_008589TAT41090571090671133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
69NC_008589TTG4110407110418120 %66.67 %33.33 %0 %8 %118411222
70NC_008589ATT41109841109951233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411223
71NC_008589TCT4113171113181110 %66.67 %0 %33.33 %9 %118411226
72NC_008589GCT4113443113454120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %118411226
73NC_008589TAT41147601147711233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411227
74NC_008589TAA41152071152171166.67 %33.33 %0 %0 %9 %118411227
75NC_008589AAT41164081164191266.67 %33.33 %0 %0 %0 %118411228
76NC_008589TAA41165071165181266.67 %33.33 %0 %0 %8 %118411228
77NC_008589ATT41168281168401333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
78NC_008589AAT41187721187831266.67 %33.33 %0 %0 %8 %118411230
79NC_008589TCT4119547119558120 %66.67 %0 %33.33 %8 %118411230
80NC_008589ATT41205101205211233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411233
81NC_008589TCT4120760120771120 %66.67 %0 %33.33 %8 %118411233
82NC_008589TAA41211661211761166.67 %33.33 %0 %0 %9 %118411233
83NC_008589AAT41221171221281266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
84NC_008589CAA41277321277421166.67 %0 %0 %33.33 %9 %118411236