Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Phaeodactylum tricornutum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008588ACC45525631233.33 %0 %0 %66.67 %8 %118410963
2NC_008588GTA46586701333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %118410963
3NC_008588TAT47377481233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118410963
4NC_008588ATT4103210431233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118410963
5NC_008588ACC4282528361233.33 %0 %0 %66.67 %8 %118410964
6NC_008588ATG4367736871133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %118410964
7NC_008588TAA4800980201266.67 %33.33 %0 %0 %8 %118410970
8NC_008588GAA4948194921266.67 %0 %33.33 %0 %8 %118410973
9NC_008588TAA412847128571166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_008588CTA414560145701133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %193735613
11NC_008588AAT415517155281266.67 %33.33 %0 %0 %8 %118410982
12NC_008588TTA416225162361233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118410984
13NC_008588TAA417344173551266.67 %33.33 %0 %0 %8 %118410986
14NC_008588TAA518057180731766.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
15NC_008588TAT418075180861233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_008588AAT420563205731166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
17NC_008588ATT421458214681133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
18NC_008588CAA422244222551266.67 %0 %0 %33.33 %8 %118410995
19NC_008588CAC425308253191233.33 %0 %0 %66.67 %8 %118411000
20NC_008588GAC426172261821133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %118411001
21NC_008588TTA428759287691133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
22NC_008588ATA434407344191366.67 %33.33 %0 %0 %7 %118411012
23NC_008588TCT43548135492120 %66.67 %0 %33.33 %8 %118411013
24NC_008588CTT43576735778120 %66.67 %0 %33.33 %8 %118411013
25NC_008588AAT435956359671266.67 %33.33 %0 %0 %8 %118411014
26NC_008588AAG438371383821266.67 %0 %33.33 %0 %8 %118411017
27NC_008588AGA441509415201266.67 %0 %33.33 %0 %8 %118411018
28NC_008588GAA443025430361266.67 %0 %33.33 %0 %8 %118411018
29NC_008588ATA444630446401166.67 %33.33 %0 %0 %9 %118411019
30NC_008588ATT445983459931133.33 %66.67 %0 %0 %9 %118411019
31NC_008588CAG450886508971233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %118411023
32NC_008588TAA451296513071266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_008588TAT454657546681233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411027
34NC_008588CAA459230592411266.67 %0 %0 %33.33 %8 %118411032
35NC_008588TTA763993640132133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
36NC_008588TAA475482754941366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
37NC_008588ATT475904759151233.33 %66.67 %0 %0 %0 %118411047
38NC_008588TTA477112771241333.33 %66.67 %0 %0 %7 %118411048
39NC_008588AGC478856788671233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %118411049
40NC_008588AAG479128791391266.67 %0 %33.33 %0 %8 %118411049
41NC_008588ATT480054800651233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
42NC_008588GGC48087780889130 %0 %66.67 %33.33 %7 %118411052
43NC_008588CTG48719887209120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %118411057
44NC_008588TAT487687876981233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411057
45NC_008588ATA488078880891266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
46NC_008588GGT48916189172120 %33.33 %66.67 %0 %8 %118411059
47NC_008588AAT495086950981366.67 %33.33 %0 %0 %7 %118411071
48NC_008588ATA41001331001441266.67 %33.33 %0 %0 %8 %118411080
49NC_008588TCA41008281008391233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %118411081
50NC_008588ATT41010511010621233.33 %66.67 %0 %0 %8 %118411082
51NC_008588ACA41017581017691266.67 %0 %0 %33.33 %8 %118411084
52NC_008588ACA41034511034631366.67 %0 %0 %33.33 %7 %118411086
53NC_008588GTT4106448106459120 %66.67 %33.33 %0 %8 %118411088
54NC_008588ATT41104481104581133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
55NC_008588TAA71170311170512166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding