ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Nymphon gracile mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008572	AGAAA	3	340	353	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	117647184
2	NC_008572	ATA	4	438	448	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	117647184
3	NC_008572	TAA	5	562	576	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	117647184
4	NC_008572	TAA	4	1273	1284	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	117647184
5	NC_008572	A	17	1538	1554	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	117647184
6	NC_008572	TAAA	4	1732	1746	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	117647184
7	NC_008572	AAATAT	3	1792	1809	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	117647184
8	NC_008572	A	13	2639	2651	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	117647185
9	NC_008572	ATA	4	2661	2671	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	117647185
10	NC_008572	AAAT	3	2797	2807	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	117647185
11	NC_008572	ATT	4	3005	3016	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	117647185
12	NC_008572	A	27	3114	3140	27	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	117647185
13	NC_008572	TAAAGC	3	3323	3340	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	117647186
14	NC_008572	ATAA	3	3376	3386	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	117647186
15	NC_008572	AAAT	3	3463	3474	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	117647186
16	NC_008572	AAAATA	3	3505	3523	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	117647186
17	NC_008572	TAA	4	3553	3563	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_008572	TTCA	3	3618	3629	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	117647187
19	NC_008572	AAT	4	3879	3890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	117647187
20	NC_008572	ATTT	3	4175	4186	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	117647188
21	NC_008572	AATA	3	5655	5666	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	117647189
22	NC_008572	ATAG	3	6360	6370	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_008572	ATA	4	7301	7312	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_008572	TAAAG	3	7942	7956	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_008572	TTA	4	8027	8039	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_008572	AACT	3	8209	8220	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_008572	AATT	3	8290	8300	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_008572	ATT	4	8436	8448	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_008572	TACTA	3	8590	8604	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
30	NC_008572	TAA	4	8952	8962	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_008572	TA	6	9539	9549	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	117647190
32	NC_008572	TAAC	3	9568	9578	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	117647190
33	NC_008572	TAA	4	9684	9694	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_008572	AAT	5	9828	9841	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	117647191
35	NC_008572	AGAA	3	10194	10204	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	117647191
36	NC_008572	TTTTCA	3	10705	10723	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	117647191
37	NC_008572	AAAT	3	10802	10813	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	117647191
38	NC_008572	TAT	4	11235	11246	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	117647191
39	NC_008572	AATT	3	11929	11939	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	117647192
40	NC_008572	TAAA	3	12146	12157	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	117647192
41	NC_008572	TTTA	3	12501	12512	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	117647193
42	NC_008572	ATT	4	14082	14093	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	117647196
43	NC_008572	ATT	5	14205	14219	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	117647196
44	NC_008572	TTA	4	14279	14289	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	117647196
45	NC_008572	ATAA	3	14627	14637	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Nymphon gracile mitochondrion