ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Coffea arabica chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008535TTTCT3121135150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
2NC_008535TAAAA4416041802180 %20 %0 %0 %9 %Non-Coding
3NC_008535TCTTT354025415140 %80 %0 %20 %7 %116617090
4NC_008535GATAA3821682301560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
5NC_008535TTTCC31311013123140 %60 %0 %40 %7 %116617094
6NC_008535ATTCA314217142301440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
7NC_008535ACAAA430378303972080 %0 %0 %20 %10 %Non-Coding
8NC_008535TTATT332879328921420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
9NC_008535ATTTT349912499251420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
10NC_008535TTGAT353302533151420 %60 %20 %0 %7 %Non-Coding
11NC_008535TAGAA368505685201660 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
12NC_008535GATAA371743717561460 %20 %20 %0 %7 %116617154
13NC_008535ACTTA377880778931440 %40 %0 %20 %7 %116617154
14NC_008535TCCGG39543695450150 %20 %40 %40 %6 %116617154
15NC_008535TAAAA31181361181501580 %20 %0 %0 %6 %116617167
16NC_008535ACCGG31449041449181520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding