ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Drimys granadensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008456	CAG	4	703	714	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	115604914
2	NC_008456	TTC	4	1859	1870	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	115604915
3	NC_008456	GAA	4	2636	2647	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	115604915
4	NC_008456	CAA	4	4659	4670	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_008456	CAT	4	6601	6612	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_008456	TCT	4	7831	7841	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_008456	AGG	4	13172	13182	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	115604920
8	NC_008456	TAT	4	13909	13919	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_008456	TTA	4	22089	22099	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	115604925
10	NC_008456	TCT	7	24016	24036	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	115604925
11	NC_008456	GTT	4	24542	24553	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	115604925
12	NC_008456	AAT	5	31078	31093	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_008456	CAT	4	33370	33380	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_008456	ATG	4	41390	41400	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	115604933
15	NC_008456	GCA	4	43288	43299	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	115604934
16	NC_008456	ATG	4	43614	43624	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	115604934
17	NC_008456	AGA	4	45374	45384	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	115604935
18	NC_008456	TAA	4	46925	46936	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	115604935
19	NC_008456	AGT	4	48709	48720	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	115604936
20	NC_008456	ATT	4	48980	48990	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_008456	ATT	4	49481	49492	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_008456	CTT	4	56389	56399	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_008456	ATA	6	58486	58503	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	115604941
24	NC_008456	TTA	4	63723	63733	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_008456	GTT	4	67125	67136	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	115604947
26	NC_008456	CTT	4	68020	68032	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
27	NC_008456	TTA	4	71638	71650	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_008456	CAA	5	74160	74174	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	115604981
29	NC_008456	TAT	5	74961	74976	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	115604981
30	NC_008456	TCC	4	82520	82531	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	115604981
31	NC_008456	AAT	4	88921	88933	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	115604981
32	NC_008456	CTT	4	89168	89179	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	115604981
33	NC_008456	GAT	4	91007	91017	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	115604981
34	NC_008456	GAT	4	94059	94070	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	115604981
35	NC_008456	TGA	4	95801	95812	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	115604981
36	NC_008456	CTT	4	108207	108218	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	115604994
37	NC_008456	AAG	4	116687	116698	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	115604994
38	NC_008456	TTA	4	117568	117579	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	115604994
39	NC_008456	TAA	4	117947	117957	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	115604994
40	NC_008456	TAT	4	119544	119554	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	115604994
41	NC_008456	TTC	5	125586	125600	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	115604994
42	NC_008456	AAT	5	129045	129058	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	115604994
43	NC_008456	CCT	4	132721	132732	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	115604994
44	NC_008456	ATC	4	155220	155231	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	115604998
45	NC_008456	ATC	4	158273	158283	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_008456	GAA	5	160110	160124	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	115605000
47	NC_008456	ATT	4	160357	160369	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Drimys granadensis chloroplast