ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Drimys granadensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008456	CAG	4	703	714	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	115604914
2	NC_008456	AAGT	3	809	819	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	115604914
3	NC_008456	A	13	1380	1392	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_008456	TTC	4	1859	1870	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	115604915
5	NC_008456	GAA	4	2636	2647	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	115604915
6	NC_008456	GAAA	3	2858	2869	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	115604915
7	NC_008456	T	14	4278	4291	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008456	A	14	4570	4583	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008456	CAA	4	4659	4670	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
10	NC_008456	TCTCT	3	5093	5106	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	115604916
11	NC_008456	A	17	5348	5364	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	115604916
12	NC_008456	T	16	5736	5751	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	115604916
13	NC_008456	CAT	4	6601	6612	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_008456	T	13	7239	7251	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_008456	TCT	4	7831	7841	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_008456	GATAA	3	8174	8188	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_008456	CAAA	3	8505	8516	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
18	NC_008456	TTTA	3	8948	8959	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008456	CTATAT	3	8978	8995	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
20	NC_008456	ATAC	3	8996	9007	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_008456	GAAA	3	10578	10588	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_008456	GTTT	3	10911	10922	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	115604919
23	NC_008456	T	15	13053	13067	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	115604920
24	NC_008456	AGG	4	13172	13182	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	115604920
25	NC_008456	ATAA	8	13513	13544	32	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	115604920
26	NC_008456	TTTA	11	13821	13863	43	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_008456	TAT	4	13909	13919	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_008456	GAAA	3	14045	14056	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_008456	AAAT	3	14494	14505	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_008456	AT	6	14833	14843	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_008456	ACCTA	3	15014	15027	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
32	NC_008456	T	15	15202	15216	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008456	T	12	15513	15524	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008456	A	13	15526	15538	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_008456	TCAA	3	17675	17686	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	115604924
36	NC_008456	T	13	19454	19466	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	115604924
37	NC_008456	CT	6	20062	20073	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	115604924
38	NC_008456	TTA	4	22089	22099	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	115604925
39	NC_008456	ATTCC	3	23146	23159	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	115604925
40	NC_008456	AAAT	4	23459	23473	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	115604925
41	NC_008456	TTCA	3	23563	23574	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	115604925
42	NC_008456	TTTTA	3	23576	23591	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	115604925
43	NC_008456	GAAT	3	23668	23678	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	115604925
44	NC_008456	TCT	7	24016	24036	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	115604925
45	NC_008456	GTT	4	24542	24553	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	115604925
46	NC_008456	GAAA	3	27196	27208	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	115604926
47	NC_008456	AG	7	28286	28298	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_008456	ATCT	3	28396	28407	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
49	NC_008456	GT	6	28873	28883	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_008456	A	17	28929	28945	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_008456	ATCAA	4	29290	29308	19	60 %	20 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
52	NC_008456	TCTTG	3	30566	30579	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
53	NC_008456	AAT	5	31078	31093	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_008456	T	17	31872	31888	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_008456	ATTT	3	31889	31900	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_008456	A	19	31926	31944	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_008456	CAT	4	33370	33380	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
58	NC_008456	TATCTC	3	33509	33525	17	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
59	NC_008456	T	17	33568	33584	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_008456	TACATA	3	33865	33883	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
61	NC_008456	TTCA	3	34258	34268	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_008456	T	18	34498	34515	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_008456	GATATA	3	34698	34715	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_008456	T	14	34877	34890	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_008456	TAAAG	3	34897	34912	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_008456	TTTG	3	34936	34946	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_008456	TCTATA	3	35058	35075	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
68	NC_008456	CTTG	3	35234	35244	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_008456	GAAA	3	36978	36989	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	115604930
70	NC_008456	TTTC	3	38042	38053	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
71	NC_008456	AG	6	38198	38208	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_008456	TC	6	38812	38822	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	115604931
73	NC_008456	GAAAA	4	38920	38939	20	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
74	NC_008456	A	12	39984	39995	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008456	GAAT	3	41035	41045	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	115604933
76	NC_008456	ATG	4	41390	41400	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	115604933
77	NC_008456	AATG	3	42883	42894	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	115604934
78	NC_008456	GCA	4	43288	43299	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	115604934
79	NC_008456	ATG	4	43614	43624	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	115604934
80	NC_008456	CCAT	3	44620	44631	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
81	NC_008456	TTTA	4	44632	44647	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_008456	AGA	4	45374	45384	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	115604935
83	NC_008456	ATCA	3	45418	45428	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	115604935
84	NC_008456	AAAG	3	45574	45585	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	115604935
85	NC_008456	TCTT	4	45928	45943	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	115604935
86	NC_008456	TAA	4	46925	46936	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	115604935
87	NC_008456	A	12	46932	46943	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	115604935
88	NC_008456	GTATAA	3	47290	47308	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
89	NC_008456	TC	6	48060	48071	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
90	NC_008456	A	13	48313	48325	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008456	AGT	4	48709	48720	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	115604936
92	NC_008456	ATT	4	48980	48990	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_008456	A	12	49310	49321	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_008456	ATT	4	49481	49492	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_008456	T	12	49572	49583	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008456	TTATAT	3	49637	49655	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_008456	TATAAC	3	49653	49669	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
98	NC_008456	TA	7	49686	49698	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_008456	A	16	49827	49842	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_008456	G	13	49893	49905	13	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008456	TTGA	3	50099	50111	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_008456	AT	6	51189	51200	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_008456	T	13	51207	51219	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008456	A	19	53726	53744	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
105	NC_008456	TATTCA	3	53816	53832	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
106	NC_008456	TTGCT	3	54895	54910	16	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
107	NC_008456	T	12	55290	55301	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008456	T	16	56236	56251	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_008456	CTT	4	56389	56399	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
110	NC_008456	T	16	56398	56413	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008456	ATA	6	58486	58503	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	115604941
112	NC_008456	A	16	59012	59027	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
113	NC_008456	T	13	61298	61310	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008456	GTTA	3	61323	61333	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_008456	TTA	4	63723	63733	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_008456	ATGA	3	64444	64454	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_008456	T	12	65129	65140	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008456	A	15	65201	65215	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_008456	A	13	65331	65343	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008456	AAAG	3	65352	65362	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	115604946
121	NC_008456	AATG	3	66042	66053	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	115604946
122	NC_008456	ACTAT	5	66185	66208	24	40 %	40 %	0 %	20 %	4 %	Non-Coding
123	NC_008456	GTT	4	67125	67136	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	115604947
124	NC_008456	TCTT	3	67316	67326	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
125	NC_008456	T	14	67413	67426	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008456	A	24	67782	67805	24	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_008456	T	14	67868	67881	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008456	CTT	4	68020	68032	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
129	NC_008456	T	13	69590	69602	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_008456	T	19	69818	69836	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
131	NC_008456	A	16	69987	70002	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
132	NC_008456	T	12	71428	71439	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008456	GAAAGA	3	71457	71475	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
134	NC_008456	TTA	4	71638	71650	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_008456	A	14	72561	72574	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_008456	T	14	72595	72608	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_008456	ATTT	3	73232	73242	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_008456	AAAT	3	73336	73347	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_008456	AT	6	149885	149896	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
235	NC_008456	CATAC	3	150980	150993	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
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242	NC_008456	ATTT	3	156436	156447	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	115604998
243	NC_008456	ATC	4	158273	158283	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
244	NC_008456	GAA	5	160110	160124	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	115605000
245	NC_008456	CT	7	160295	160307	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
246	NC_008456	ATT	4	160357	160369	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
247	NC_008456	TCTT	4	160392	160407	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
248	NC_008456	A	13	160575	160587	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Drimys granadensis chloroplast