ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Pelargonium x hortorum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008454CTTTT380618074140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
2NC_008454GAATG418534185532040 %20 %40 %0 %5 %115531904
3NC_008454AGAAA433745337652180 %0 %20 %0 %9 %115531909
4NC_008454TTTTA350662506751420 %80 %0 %0 %7 %115531917
5NC_008454TTTTG35087350887150 %80 %20 %0 %6 %Non-Coding
6NC_008454GAAAA369682696951480 %0 %20 %0 %7 %Non-Coding
7NC_008454TTTCC47988279900190 %60 %0 %40 %10 %Non-Coding
8NC_008454GAAAG390553905661460 %0 %40 %0 %7 %115531939
9NC_008454ACCGG393146931601520 %0 %40 %40 %6 %115531939
10NC_008454AAAAG31010551010701680 %0 %20 %0 %6 %115531939
11NC_008454TTTTC3112402112416150 %80 %0 %20 %6 %115531939
12NC_008454CTTTT3112446112461160 %80 %0 %20 %6 %115531939
13NC_008454AATTT41232441232621940 %60 %0 %0 %5 %115532023
14NC_008454TTCTT4144814144832190 %80 %0 %20 %10 %115532023
15NC_008454ATTAA41543881544061960 %40 %0 %0 %5 %115532023
16NC_008454TTTCA31570101570241520 %60 %0 %20 %6 %115532024
17NC_008454CACTT31573191573331520 %40 %0 %40 %6 %115532024
18NC_008454AAAAG31651921652071680 %0 %20 %0 %6 %115532024
19NC_008454AAACA31652391652531580 %0 %0 %20 %6 %115532024
20NC_008454CTTTT3176583176598160 %80 %0 %20 %6 %115532024
21NC_008454ATATG31843191843331540 %40 %20 %0 %6 %115532024
22NC_008454TCCGG3184492184506150 %20 %40 %40 %6 %115532024
23NC_008454TTCTA42072972073172120 %60 %0 %20 %9 %Non-Coding
24NC_008454TTTTC3207958207971140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
25NC_008454GAAAA32093842093981580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
26NC_008454TTGAA32098702098841540 %40 %20 %0 %6 %115532017