ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Hydrurga leptonyx mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008425	AAC	4	810	821	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_008425	AAAC	3	842	853	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008425	AAAC	3	1124	1135	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_008425	GTTC	3	2471	2482	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_008425	CTAGCC	3	2981	3004	24	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	4 %	115494636
6	NC_008425	TCA	4	3937	3948	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	115494637
7	NC_008425	AATT	3	4372	4382	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	115494637
8	NC_008425	CTAATA	3	4644	4661	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	115494637
9	NC_008425	CTA	4	5678	5689	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	115494638
10	NC_008425	GGA	4	6020	6030	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	115494638
11	NC_008425	ACT	4	7430	7441	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	115494639
12	NC_008425	ATT	4	8118	8130	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	115494641
13	NC_008425	TAC	4	8226	8237	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	115494641
14	NC_008425	CTA	4	8754	8765	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	115494642
15	NC_008425	CCA	4	8837	8849	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	115494642
16	NC_008425	CA	6	9715	9725	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	115494643
17	NC_008425	ATC	4	10580	10590	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	115494645
18	NC_008425	CAT	4	11383	11394	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	115494645
19	NC_008425	CTA	4	11519	11530	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	115494645
20	NC_008425	TAT	4	11786	11796	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	115494646
21	NC_008425	TAG	4	12520	12531	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	115494646
22	NC_008425	CCA	4	12610	12621	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	115494646
23	NC_008425	CAA	4	13893	13904	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	115494647
24	NC_008425	CTA	4	14885	14896	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	115494648
25	NC_008425	CAC	4	14959	14969	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	115494648
26	NC_008425	CTA	4	15254	15265	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	115494648
27	NC_008425	ACGCAC	3	16125	16142	18	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	5 %	Non-Coding
28	NC_008425	CACGCA	3	16150	16167	18	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008425	CACGCA	3	16176	16193	18	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	5 %	Non-Coding
30	NC_008425	CACGTA	4	16272	16295	24	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_008425	AACC	3	16459	16470	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Hydrurga leptonyx mitochondrion