ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Bigelowiella natans plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008408	ATT	4	2174	2185	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_008408	CTT	4	2382	2392	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	115443540
3	NC_008408	CCT	4	2619	2630	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	115443540
4	NC_008408	CAG	4	2902	2913	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	115443540
5	NC_008408	TAC	4	2915	2926	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	115443540
6	NC_008408	GGT	4	3153	3164	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	115443540
7	NC_008408	TTA	4	3229	3240	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	115443540
8	NC_008408	TTA	4	4149	4160	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	115443541
9	NC_008408	TGG	4	5544	5555	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	171259310
10	NC_008408	AAT	5	8382	8396	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	115443544
11	NC_008408	TAT	4	8818	8829	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	115443544
12	NC_008408	ATT	4	9073	9084	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_008408	TAT	4	9647	9658	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_008408	TAT	4	10805	10815	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	115443549
15	NC_008408	TGA	4	13683	13694	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	115443554
16	NC_008408	TGA	4	13815	13825	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	115443554
17	NC_008408	TAT	4	18132	18142	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_008408	ATT	4	22661	22672	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_008408	TAA	4	25704	25716	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_008408	TAA	4	27413	27424	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	115443562
21	NC_008408	AAT	4	27463	27474	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	115443562
22	NC_008408	TAA	4	27975	27986	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	115443562
23	NC_008408	ATT	4	28304	28315	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	115443562
24	NC_008408	TTA	4	31333	31345	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_008408	AAT	4	31433	31444	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_008408	ATA	4	35965	35976	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_008408	ACC	4	36605	36616	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	115443566
28	NC_008408	TAA	4	36698	36708	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	115443566
29	NC_008408	ACC	4	40300	40311	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	115443568
30	NC_008408	TAT	4	40485	40497	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	115443568
31	NC_008408	ATG	4	41176	41186	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	115443568
32	NC_008408	ATA	4	43830	43840	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	115443570
33	NC_008408	TAT	4	45320	45331	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	115443574
34	NC_008408	TAA	4	45858	45869	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	115443575
35	NC_008408	AAT	5	46420	46434	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_008408	TAT	4	46928	46938	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_008408	AGC	4	50010	50021	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	115443582
38	NC_008408	ATA	4	54792	54803	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	115443588
39	NC_008408	AGA	4	57738	57749	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	115443589
40	NC_008408	TAT	4	57872	57882	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	115443589
41	NC_008408	CTT	4	58037	58047	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	115443589
42	NC_008408	AGA	4	59622	59633	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	115443589
43	NC_008408	AGA	4	61149	61159	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	115443590
44	NC_008408	TTA	4	66397	66408	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_008408	ATA	4	66628	66639	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Bigelowiella natans plastid