ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Bigelowiella natans plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008408	AAAT	3	1387	1397	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_008408	ATT	4	2174	2185	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008408	CTT	4	2382	2392	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	115443540
4	NC_008408	CCT	4	2619	2630	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	115443540
5	NC_008408	CAG	4	2902	2913	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	115443540
6	NC_008408	TAC	4	2915	2926	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	115443540
7	NC_008408	GGT	4	3153	3164	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	115443540
8	NC_008408	TTA	4	3229	3240	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	115443540
9	NC_008408	AAATTA	3	3369	3386	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	115443540
10	NC_008408	ATTA	3	3836	3847	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008408	TTA	4	4149	4160	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	115443541
12	NC_008408	TTTCTG	3	4333	4350	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	115443541
13	NC_008408	TCTTT	3	5317	5331	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	171259310
14	NC_008408	TGG	4	5544	5555	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	171259310
15	NC_008408	AAT	5	8382	8396	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	115443544
16	NC_008408	TAT	4	8818	8829	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	115443544
17	NC_008408	TTTAT	3	8831	8844	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	115443544
18	NC_008408	ATT	4	9073	9084	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_008408	TAT	4	9647	9658	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_008408	ATTT	3	10328	10339	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	115443547
21	NC_008408	TAT	4	10805	10815	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	115443549
22	NC_008408	AAAAT	3	10874	10887	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	115443549
23	NC_008408	TCAA	3	12503	12515	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	115443552
24	NC_008408	TTAA	3	13174	13185	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	115443553
25	NC_008408	TGA	4	13683	13694	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	115443554
26	NC_008408	TGA	4	13815	13825	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	115443554
27	NC_008408	AAAC	3	13907	13918	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	115443554
28	NC_008408	AT	7	15623	15635	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_008408	TA	6	18054	18064	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_008408	TAT	4	18132	18142	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_008408	TTTAAT	3	18878	18896	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	115443558
32	NC_008408	AG	6	19943	19953	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_008408	CTGA	3	21601	21611	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_008408	TATT	3	22507	22517	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_008408	GT	6	22554	22564	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_008408	ATT	4	22661	22672	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_008408	AGTA	3	22758	22768	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_008408	AT	8	24492	24507	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_008408	AATA	3	24686	24696	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_008408	A	13	25086	25098	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_008408	TAA	4	25704	25716	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_008408	TTTA	3	25762	25772	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_008408	TA	7	25789	25801	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_008408	TA	6	27400	27410	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	115443562
45	NC_008408	TAA	4	27413	27424	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	115443562
46	NC_008408	AAT	4	27463	27474	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	115443562
47	NC_008408	TAA	4	27975	27986	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	115443562
48	NC_008408	ATT	4	28304	28315	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	115443562
49	NC_008408	AT	10	29595	29613	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
50	NC_008408	TTA	4	31333	31345	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_008408	AAT	4	31433	31444	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_008408	AC	6	31541	31551	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_008408	AAAT	3	31587	31597	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_008408	TCAG	3	32494	32504	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
55	NC_008408	CT	6	34152	34162	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
56	NC_008408	TA	6	35911	35922	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_008408	ATA	4	35965	35976	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_008408	ACC	4	36605	36616	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	115443566
59	NC_008408	TAA	4	36698	36708	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	115443566
60	NC_008408	CATA	3	37229	37241	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	115443566
61	NC_008408	AT	7	38470	38482	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_008408	AATTA	3	39780	39793	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_008408	ACC	4	40300	40311	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	115443568
64	NC_008408	TAT	4	40485	40497	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	115443568
65	NC_008408	ATG	4	41176	41186	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	115443568
66	NC_008408	AT	6	43006	43016	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	115443569
67	NC_008408	ATA	4	43830	43840	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	115443570
68	NC_008408	TTTA	3	44235	44246	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	115443572
69	NC_008408	TTTAA	3	44381	44395	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	115443572
70	NC_008408	TTTA	3	44830	44841	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	115443574
71	NC_008408	ATTT	3	45010	45021	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	115443574
72	NC_008408	TAT	4	45320	45331	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	115443574
73	NC_008408	TAA	4	45858	45869	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	115443575
74	NC_008408	AAT	5	46420	46434	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_008408	TAT	4	46928	46938	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_008408	AT	7	46940	46954	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_008408	AGAA	3	47568	47580	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	115443579
78	NC_008408	AATT	3	48991	49003	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_008408	AGC	4	50010	50021	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	115443582
80	NC_008408	AAAT	3	51901	51912	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	115443583
81	NC_008408	TAAA	3	52091	52101	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_008408	AAAG	3	52152	52163	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008408	TAGGC	3	53212	53225	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	115443584
84	NC_008408	AATAT	3	53900	53913	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_008408	TATTT	3	53944	53958	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_008408	A	12	54116	54127	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_008408	ATA	4	54792	54803	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	115443588
88	NC_008408	AT	6	55532	55542	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_008408	ACAA	3	55716	55727	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
90	NC_008408	TATT	3	55766	55777	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_008408	AAAT	3	56182	56193	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	115443589
92	NC_008408	AGA	4	57738	57749	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	115443589
93	NC_008408	TAT	4	57872	57882	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	115443589
94	NC_008408	CTT	4	58037	58047	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	115443589
95	NC_008408	TTTA	3	58995	59005	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	115443589
96	NC_008408	TTTTA	3	59523	59536	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	115443589
97	NC_008408	AGA	4	59622	59633	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	115443589
98	NC_008408	AATC	3	60533	60543	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	115443589
99	NC_008408	AGA	4	61149	61159	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	115443590
100	NC_008408	TGAAAT	3	64837	64853	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	115443591
101	NC_008408	TTTA	3	65455	65465	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	115443591
102	NC_008408	ATTT	3	66249	66260	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	115443591
103	NC_008408	T	16	66377	66392	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_008408	TTA	4	66397	66408	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_008408	ATA	4	66628	66639	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_008408	TTAT	3	66883	66893	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_008408	AG	6	67065	67076	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_008408	ATTA	4	67660	67678	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
109	NC_008408	AT	6	67722	67733	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_008408	TTACT	3	67910	67923	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
111	NC_008408	TTAT	4	68053	68068	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_008408	TTTG	3	68420	68431	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	115443595
113	NC_008408	TGCT	3	68753	68763	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	115443597
114	NC_008408	TTAA	3	68969	68980	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_008408	N	100	69067	69166	100	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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