ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Stigeoclonium helveticum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008372CGGA31091191125 %0 %50 %25 %9 %Non-Coding
2NC_008372AGCG33223321125 %0 %50 %25 %9 %Non-Coding
3NC_008372AGAA3133913501275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
4NC_008372GAGG3381438251225 %0 %75 %0 %8 %Non-Coding
5NC_008372ACAA3551055201175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
6NC_008372ATGG3611661261125 %25 %50 %0 %9 %115350035
7NC_008372ATTT3701870281125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
8NC_008372AAAT4868987041675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_008372ATTT5870387222025 %75 %0 %0 %5 %Non-Coding
10NC_008372AAAT4885288671675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
11NC_008372ATTT5886688852025 %75 %0 %0 %5 %Non-Coding
12NC_008372AATA3931293221175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
13NC_008372ATTT3948294931225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
14NC_008372ATCA310474104851250 %25 %0 %25 %0 %115350009
15NC_008372AGAA311497115091375 %0 %25 %0 %7 %115350009
16NC_008372AAGG313218132281150 %0 %50 %0 %9 %115350009
17NC_008372GAAA313390134001175 %0 %25 %0 %9 %115350009
18NC_008372AAAG313825138351175 %0 %25 %0 %9 %115350009
19NC_008372TTTC31431914330120 %75 %0 %25 %8 %115350009
20NC_008372AAAG515241152591975 %0 %25 %0 %10 %115350009
21NC_008372CTTT31526615276110 %75 %0 %25 %9 %115350009
22NC_008372ATTT315313153241225 %75 %0 %0 %8 %115350009
23NC_008372ATTT416759167741625 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
24NC_008372ATTT316959169701225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
25NC_008372ATGT318607186171125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
26NC_008372ATTT318828188391225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
27NC_008372AAAG319120191311275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
28NC_008372CTTT31916819178110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
29NC_008372CTTT31980419814110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
30NC_008372TTAA320112201231250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_008372AAAT320930209401175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
32NC_008372TAAA321110211211275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_008372GAAA321621216331375 %0 %25 %0 %7 %115350029
34NC_008372ATTT321663216741225 %75 %0 %0 %0 %115350029
35NC_008372ATTT327701277111125 %75 %0 %0 %9 %115350026
36NC_008372AATT327926279361150 %50 %0 %0 %9 %115350026
37NC_008372TTTA327965279761225 %75 %0 %0 %8 %115350026
38NC_008372ATTT328256282671225 %75 %0 %0 %0 %115350026
39NC_008372ATTT528315283352125 %75 %0 %0 %9 %115350026
40NC_008372AAAT429146291611675 %25 %0 %0 %6 %115350026
41NC_008372ATTT529160291792025 %75 %0 %0 %5 %115350026
42NC_008372TTTC32947429485120 %75 %0 %25 %8 %115350026
43NC_008372TTTG32966429675120 %75 %25 %0 %8 %115350026
44NC_008372CTTT33072530735110 %75 %0 %25 %9 %115350026
45NC_008372TTTA332316323271225 %75 %0 %0 %8 %115350026
46NC_008372TAAA332908329191275 %25 %0 %0 %8 %115350026
47NC_008372CAAT333440334511250 %25 %0 %25 %8 %115350026
48NC_008372AAAT333766337771275 %25 %0 %0 %8 %115350026
49NC_008372TTTA334717347271125 %75 %0 %0 %9 %115350026
50NC_008372TAAA334755347651175 %25 %0 %0 %9 %115350026
51NC_008372TTAT337803378141225 %75 %0 %0 %0 %115350026
52NC_008372CTTT34163341644120 %75 %0 %25 %8 %115350026
53NC_008372AAAT541722417412075 %25 %0 %0 %10 %115350026
54NC_008372TAAA341939419511375 %25 %0 %0 %7 %115350026
55NC_008372TTTA341952419631225 %75 %0 %0 %8 %115350026
56NC_008372TCTT34257142582120 %75 %0 %25 %8 %115350026
57NC_008372TATT343312433231225 %75 %0 %0 %8 %115350026
58NC_008372AAAT543574435932075 %25 %0 %0 %10 %115350026
59NC_008372AAAG344650446601175 %0 %25 %0 %9 %115350026
60NC_008372ATTT546531465512125 %75 %0 %0 %9 %115350026
61NC_008372TATT347264472751225 %75 %0 %0 %8 %115350026
62NC_008372ATTT348469484801225 %75 %0 %0 %8 %115350026
63NC_008372ATTA348499485091150 %50 %0 %0 %9 %115350026
64NC_008372GTTT35104551055110 %75 %25 %0 %9 %115350026
65NC_008372GTTT35188251893120 %75 %25 %0 %8 %115350026
66NC_008372AAAT552255522742075 %25 %0 %0 %10 %115350026
67NC_008372TTTC35330153312120 %75 %0 %25 %8 %115350026
68NC_008372ATTT455119551341625 %75 %0 %0 %6 %115350026
69NC_008372TTTA355499555091125 %75 %0 %0 %9 %115350026
70NC_008372GTTT35564655657120 %75 %25 %0 %8 %115350026
71NC_008372AATT355725557361250 %50 %0 %0 %8 %115350026
72NC_008372CTTT35587755887110 %75 %0 %25 %9 %115350026
73NC_008372TTAT357373573851325 %75 %0 %0 %7 %115350026
74NC_008372TAAA357738577501375 %25 %0 %0 %7 %115350026
75NC_008372AAAG357965579761275 %0 %25 %0 %8 %115350026
76NC_008372TTTC35802158032120 %75 %0 %25 %8 %115350026
77NC_008372ATTT458811588261625 %75 %0 %0 %6 %115350026
78NC_008372ATTT459043590581625 %75 %0 %0 %6 %115350026
79NC_008372ATTT362125621361225 %75 %0 %0 %0 %115350026
80NC_008372AAAT562169621892175 %25 %0 %0 %9 %115350026
81NC_008372TATT362720627311225 %75 %0 %0 %8 %115350026
82NC_008372TAAA362832628421175 %25 %0 %0 %9 %115350026
83NC_008372AAAG462867628811575 %0 %25 %0 %6 %115350026
84NC_008372CTTT36288862899120 %75 %0 %25 %8 %115350026
85NC_008372ATTT363318633281125 %75 %0 %0 %9 %115350026
86NC_008372ACAA363841638511175 %0 %0 %25 %9 %115350026
87NC_008372TTCC36501065020110 %50 %0 %50 %9 %115350026
88NC_008372CTTT36550565515110 %75 %0 %25 %9 %115350026
89NC_008372AAAG367097671071175 %0 %25 %0 %9 %115350026
90NC_008372TTTA368489685001225 %75 %0 %0 %8 %115350026
91NC_008372ATTA369346693571250 %50 %0 %0 %8 %115350026
92NC_008372GAAA369524695351275 %0 %25 %0 %8 %115350026
93NC_008372TTTC36967469686130 %75 %0 %25 %7 %115350026
94NC_008372AAGA370944709551275 %0 %25 %0 %8 %115350026
95NC_008372CAAA371174711851275 %0 %0 %25 %8 %115350026
96NC_008372GAAA371469714791175 %0 %25 %0 %9 %115350026
97NC_008372AAAG373623736341275 %0 %25 %0 %8 %115350026
98NC_008372ATGC374403744141225 %25 %25 %25 %8 %115350026
99NC_008372ATTT475264752791625 %75 %0 %0 %6 %115350026
100NC_008372CTTT37584775857110 %75 %0 %25 %9 %115350026
101NC_008372AAAC376757767671175 %0 %0 %25 %9 %115350026
102NC_008372TTTA377038770481125 %75 %0 %0 %9 %115350026
103NC_008372AAAT377174771861375 %25 %0 %0 %7 %115350026
104NC_008372TTCC37868878698110 %50 %0 %50 %9 %115350026
105NC_008372TTTC38183181842120 %75 %0 %25 %8 %115350026
106NC_008372TAAA381971819821275 %25 %0 %0 %8 %115350026
107NC_008372AATT382623826341250 %50 %0 %0 %8 %115350026
108NC_008372AAAG384363843741275 %0 %25 %0 %8 %115350026
109NC_008372TTTA384891849011125 %75 %0 %0 %9 %115350026
110NC_008372TTTC38694786957110 %75 %0 %25 %9 %115350026
111NC_008372ATTT487343873581625 %75 %0 %0 %6 %115350026
112NC_008372ATTT487542875571625 %75 %0 %0 %6 %115350026
113NC_008372TAAA387763877741275 %25 %0 %0 %8 %115350026
114NC_008372CTTT38810688117120 %75 %0 %25 %8 %115350026
115NC_008372TAAA389886898971275 %25 %0 %0 %8 %115350026
116NC_008372AAAT590597906162075 %25 %0 %0 %10 %115350026
117NC_008372AAAT593082931012075 %25 %0 %0 %10 %115350026
118NC_008372AAAT593141931602075 %25 %0 %0 %10 %115350026
119NC_008372TTTA394751947611125 %75 %0 %0 %9 %115350026
120NC_008372TTAT394820948301125 %75 %0 %0 %9 %115350026
121NC_008372AGAA395966959771275 %0 %25 %0 %8 %115350026
122NC_008372AAAT597333973522075 %25 %0 %0 %10 %115350026
123NC_008372AAAG398068980791275 %0 %25 %0 %8 %115350026
124NC_008372AAAT598153981722075 %25 %0 %0 %10 %115350026
125NC_008372TTGT39862598636120 %75 %25 %0 %8 %115350026
126NC_008372TTTA31009691009791125 %75 %0 %0 %9 %115350026
127NC_008372CTTT3101934101944110 %75 %0 %25 %9 %115350026
128NC_008372TTTA31021711021821225 %75 %0 %0 %8 %115350026
129NC_008372TAAA31033691033801275 %25 %0 %0 %8 %115350026
130NC_008372AAAT31054371054481275 %25 %0 %0 %8 %115350026
131NC_008372AATT31066111066221250 %50 %0 %0 %8 %115350026
132NC_008372AATT31096471096581250 %50 %0 %0 %0 %115350026
133NC_008372CTTT3110471110481110 %75 %0 %25 %9 %115350026
134NC_008372AAAG31129881129981175 %0 %25 %0 %9 %115350026
135NC_008372TTTG3113854113865120 %75 %25 %0 %8 %115350026
136NC_008372TTTA31141791141901225 %75 %0 %0 %8 %115350026
137NC_008372CTTT3114548114558110 %75 %0 %25 %9 %115350026
138NC_008372TTTA31155701155801125 %75 %0 %0 %9 %115350026
139NC_008372TCTT3117394117405120 %75 %0 %25 %8 %115350026
140NC_008372TGAA31174671174781250 %25 %25 %0 %8 %115350026
141NC_008372ATTT31179521179631225 %75 %0 %0 %0 %115350026
142NC_008372ATTT51180111180312125 %75 %0 %0 %9 %115350026
143NC_008372ATTT31181301181411225 %75 %0 %0 %0 %115350026
144NC_008372ATTT41183871184021625 %75 %0 %0 %6 %115350026
145NC_008372ATTT41185511185661625 %75 %0 %0 %6 %115350026
146NC_008372TTTC3118755118765110 %75 %0 %25 %9 %115350026
147NC_008372AATA31191861191971275 %25 %0 %0 %8 %115350026
148NC_008372AAAT31192691192791175 %25 %0 %0 %9 %115350026
149NC_008372CCAT31194251194361225 %25 %0 %50 %8 %115350026
150NC_008372CTTT3120551120561110 %75 %0 %25 %9 %115350026
151NC_008372GAAA31211391211501275 %0 %25 %0 %8 %115350026
152NC_008372TTTG3122681122691110 %75 %25 %0 %9 %115350026
153NC_008372AAAT41236181236331675 %25 %0 %0 %6 %115350026
154NC_008372ATTT51236321236512025 %75 %0 %0 %5 %115350026
155NC_008372CTTT3123851123862120 %75 %0 %25 %8 %115350026
156NC_008372ATTT31240581240691225 %75 %0 %0 %8 %115350026
157NC_008372AATA31240941241041175 %25 %0 %0 %9 %115350026
158NC_008372ATTT41248441248591625 %75 %0 %0 %6 %115350026
159NC_008372CTTT3125205125215110 %75 %0 %25 %9 %115350026
160NC_008372ATTT41259301259451625 %75 %0 %0 %6 %115350026
161NC_008372TTGA31273821273931225 %50 %25 %0 %8 %115350026
162NC_008372TTTA31280581280681125 %75 %0 %0 %9 %115350026
163NC_008372GAAA31302821302931275 %0 %25 %0 %8 %115350026
164NC_008372CTTT3130369130379110 %75 %0 %25 %9 %115350026
165NC_008372TTTC3130430130440110 %75 %0 %25 %9 %115350026
166NC_008372TAAA31312231312341275 %25 %0 %0 %8 %115350026
167NC_008372AAAT31314041314141175 %25 %0 %0 %9 %115350026
168NC_008372AAAT31318811318911175 %25 %0 %0 %9 %115350026
169NC_008372TAAA41322521322661575 %25 %0 %0 %6 %115350026
170NC_008372AGAT31333031333141250 %25 %25 %0 %8 %115350026
171NC_008372CTTT3135155135166120 %75 %0 %25 %8 %115350026
172NC_008372TTTA31363231363331125 %75 %0 %0 %9 %115350026
173NC_008372ATTT31366111366221225 %75 %0 %0 %8 %115350026
174NC_008372TATT31366561366661125 %75 %0 %0 %9 %115350026
175NC_008372AAAT31371131371231175 %25 %0 %0 %9 %115350026
176NC_008372CTTT3137425137436120 %75 %0 %25 %8 %115350026
177NC_008372ATAA41376091376231575 %25 %0 %0 %6 %115350026
178NC_008372TTAT31376491376591125 %75 %0 %0 %9 %115350026
179NC_008372AAAC31387141387241175 %0 %0 %25 %9 %115350026
180NC_008372ATTT31398091398201225 %75 %0 %0 %8 %115350026
181NC_008372AAAT31405881406001375 %25 %0 %0 %7 %115350026
182NC_008372AAAT51421631421822075 %25 %0 %0 %10 %115350026
183NC_008372AAAT31430591430701275 %25 %0 %0 %0 %115350026
184NC_008372GAAA31435691435801275 %0 %25 %0 %8 %115350026
185NC_008372CTTT3143865143876120 %75 %0 %25 %8 %115350026
186NC_008372TTTA31463991464111325 %75 %0 %0 %7 %115350026
187NC_008372AAAT31489081489181175 %25 %0 %0 %9 %115350026
188NC_008372ATTT31495991496101225 %75 %0 %0 %0 %115350026
189NC_008372ATTT41497851498001625 %75 %0 %0 %6 %115350026
190NC_008372AAAT31498281498391275 %25 %0 %0 %0 %115350026
191NC_008372AAAT41499621499771675 %25 %0 %0 %6 %115350026
192NC_008372ATTT51499761499952025 %75 %0 %0 %5 %115350026
193NC_008372ATTT31502161502271225 %75 %0 %0 %8 %115350026
194NC_008372TGAA31506241506351250 %25 %25 %0 %0 %115350026
195NC_008372TTCT3152346152357120 %75 %0 %25 %0 %115350026
196NC_008372CTTT3153858153868110 %75 %0 %25 %9 %115350026
197NC_008372CAAA31570891570991175 %0 %0 %25 %9 %115350026
198NC_008372TTTA31575121575231225 %75 %0 %0 %8 %115350026
199NC_008372TAAA31576471576571175 %25 %0 %0 %9 %115350026
200NC_008372TTCA31580301580411225 %50 %0 %25 %8 %115350026
201NC_008372ATGA31582021582131250 %25 %25 %0 %8 %115350026
202NC_008372AAAT41585211585361675 %25 %0 %0 %6 %115350026
203NC_008372ATTT31585351585461225 %75 %0 %0 %0 %115350026
204NC_008372AAAT51588431588632175 %25 %0 %0 %9 %115350026
205NC_008372ATTT31592951593061225 %75 %0 %0 %0 %115350026
206NC_008372AAAT31602781602891275 %25 %0 %0 %8 %115350026
207NC_008372ATTT31605291605401225 %75 %0 %0 %0 %115350026
208NC_008372AAAT51605731605922075 %25 %0 %0 %10 %115350026
209NC_008372ATTT31606451606561225 %75 %0 %0 %0 %115350026
210NC_008372ATTT41608521608671625 %75 %0 %0 %6 %115350026
211NC_008372TTCA31613321613421125 %50 %0 %25 %9 %115350026
212NC_008372CTTT3162154162164110 %75 %0 %25 %9 %115350026
213NC_008372AAAT51652911653102075 %25 %0 %0 %10 %115350026
214NC_008372AAAG41659871660021675 %0 %25 %0 %6 %115350026
215NC_008372TTAG31669021669141325 %50 %25 %0 %7 %115350026
216NC_008372CAAA31676531676641275 %0 %0 %25 %8 %115350026
217NC_008372CTTT3168373168384120 %75 %0 %25 %8 %115350026
218NC_008372TTTA31685831685931125 %75 %0 %0 %9 %115350026
219NC_008372ACAT31699351699451150 %25 %0 %25 %9 %115350026
220NC_008372TAAC31702751702851150 %25 %0 %25 %9 %115350026
221NC_008372CTTT3171338171349120 %75 %0 %25 %8 %115350026
222NC_008372ATTT41716351716501625 %75 %0 %0 %6 %115350026
223NC_008372AAAT51718561718752075 %25 %0 %0 %10 %115350026
224NC_008372ATTT51723291723492125 %75 %0 %0 %9 %115350026
225NC_008372GAAA31724991725091175 %0 %25 %0 %9 %115350026
226NC_008372AAAT31734721734841375 %25 %0 %0 %7 %115350026
227NC_008372ATTT31766021766131225 %75 %0 %0 %8 %115350026
228NC_008372TGTT3177417177427110 %75 %25 %0 %9 %115350026
229NC_008372AAAT61774741774972475 %25 %0 %0 %8 %115350026
230NC_008372ATTT51774961775152025 %75 %0 %0 %5 %115350026
231NC_008372GAAA31777371777471175 %0 %25 %0 %9 %115350026
232NC_008372TTAA31779731779851350 %50 %0 %0 %7 %115350026
233NC_008372TTTA31784631784731125 %75 %0 %0 %9 %115350026
234NC_008372TTTC3178853178865130 %75 %0 %25 %7 %115350026
235NC_008372TAAA31790501790601175 %25 %0 %0 %9 %115350026
236NC_008372TTTC3180675180686120 %75 %0 %25 %8 %115350026
237NC_008372TTTA31809181809281125 %75 %0 %0 %9 %115350026
238NC_008372TAAA31812811812911175 %25 %0 %0 %9 %115350026
239NC_008372TTTG3182668182679120 %75 %25 %0 %8 %115350026
240NC_008372AAAC31836841836941175 %0 %0 %25 %9 %115350026
241NC_008372ATTT31838591838701225 %75 %0 %0 %0 %115350026
242NC_008372TTTA31850161850271225 %75 %0 %0 %8 %115350026
243NC_008372TAAA31869551869651175 %25 %0 %0 %9 %115350026
244NC_008372TAAA31880911881011175 %25 %0 %0 %9 %115350026
245NC_008372CTTT3188582188593120 %75 %0 %25 %8 %115350026
246NC_008372AAAT51901501901692075 %25 %0 %0 %10 %Non-Coding
247NC_008372TTCA31902571902671125 %50 %0 %25 %9 %115349972
248NC_008372AAAG31931481931581175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
249NC_008372ATTT31933571933681225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
250NC_008372AATG31941741941841150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
251NC_008372TTTC4194244194259160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
252NC_008372TTTA31943131943231125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
253NC_008372TTTA31962711962811125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
254NC_008372TTAA31968051968161250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
255NC_008372TTTA31971031971131125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
256NC_008372TAAA31971321971431275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
257NC_008372AATT31983931984031150 %50 %0 %0 %9 %115349985
258NC_008372GAAA31993591993701275 %0 %25 %0 %8 %115349985
259NC_008372ATAA32017452017561275 %25 %0 %0 %8 %115349985
260NC_008372ATTT32028322028421125 %75 %0 %0 %9 %115349985
261NC_008372CCAA32031772031891350 %0 %0 %50 %7 %115349985
262NC_008372AAAG32047752047861275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
263NC_008372TAGA32055552055651150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
264NC_008372AAAT52057262057452075 %25 %0 %0 %10 %Non-Coding
265NC_008372AAAG32061082061181175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
266NC_008372ATTT32061522061631225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
267NC_008372ATTT32063832063941225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
268NC_008372TTAT32073282073391225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
269NC_008372AAAT52074612074802075 %25 %0 %0 %10 %Non-Coding
270NC_008372TAAA32081672081771175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
271NC_008372CTTT3208372208382110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
272NC_008372TAAA42086812086961675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
273NC_008372ATTT32091322091431225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
274NC_008372ATTT52091912092112125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
275NC_008372ATTT32093762093871225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
276NC_008372ATTT52094352094552125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
277NC_008372ATTT32096202096311225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
278NC_008372ATTT52096792096992125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
279NC_008372ATTT32098642098751225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
280NC_008372ATTT32099232099341225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
281NC_008372AAAT32147022147121175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
282NC_008372ATTT32153852153961225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
283NC_008372AAAT32162482162591275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
284NC_008372TATT32183942184051225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
285NC_008372TTTC3218608218618110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
286NC_008372ATAA62191152191382475 %25 %0 %0 %4 %Non-Coding
287NC_008372AAAT62191532191752375 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
288NC_008372AAAT62191892192112375 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
289NC_008372AAAT52193492193682075 %25 %0 %0 %10 %Non-Coding
290NC_008372TTAT32204592204701225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
291NC_008372AATA32232842232951275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
292NC_008372TACA32233392233491150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding