ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ustilago maydis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008368	TTA	4	909	920	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_008368	ATA	4	6491	6503	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_008368	AAG	4	8050	8061	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_008368	TTA	4	8243	8253	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_008368	TAT	4	8276	8288	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_008368	ATA	4	8842	8853	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_008368	ACA	4	10215	10226	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11530438
8	NC_008368	ACT	4	11934	11944	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11530438
9	NC_008368	TAT	5	15231	15244	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_008368	TAA	4	16762	16773	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_008368	TCT	4	17111	17122	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_008368	TAC	4	17388	17398	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
13	NC_008368	GTT	4	18079	18091	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	11530438
14	NC_008368	TAA	4	18751	18761	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_008368	CTA	4	21592	21602	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11530439
16	NC_008368	CTT	4	25503	25515	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11530439
17	NC_008368	TAG	4	25888	25899	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11530439
18	NC_008368	TTA	4	27228	27239	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11530439
19	NC_008368	TAA	4	27469	27480	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11530439
20	NC_008368	TAG	4	28836	28848	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	11530439
21	NC_008368	TAG	4	29505	29517	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	11530439
22	NC_008368	TAT	4	29761	29773	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11530439
23	NC_008368	TTA	4	32369	32379	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_008368	ACT	4	32587	32598	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11530439
25	NC_008368	CTA	4	33552	33562	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11530439
26	NC_008368	GTA	4	36428	36438	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_008368	ATT	4	36535	36546	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_008368	ATA	4	38041	38053	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_008368	ATT	4	39398	39409	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_008368	ACT	4	39911	39922	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11530439
31	NC_008368	TTC	4	40116	40126	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11530439
32	NC_008368	TTG	4	40258	40269	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11530439
33	NC_008368	TAT	4	40400	40410	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_008368	CTT	5	41119	41133	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	11530439
35	NC_008368	TAA	4	42198	42209	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11530439
36	NC_008368	ATT	4	43357	43368	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_008368	CTA	4	46118	46129	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11530439
38	NC_008368	CTA	4	46742	46756	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	11530439
39	NC_008368	TTA	4	48020	48031	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11530439
40	NC_008368	GCT	4	49514	49525	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_008368	ATA	4	50616	50627	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_008368	TAT	4	50952	50964	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_008368	ATT	4	51224	51235	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_008368	TTA	4	53386	53397	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_008368	AGC	4	53761	53773	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	11530439
46	NC_008368	TAT	4	55290	55300	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_008368	CTA	4	56622	56632	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
48	NC_008368	ATT	4	56648	56659	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ustilago maydis mitochondrion