ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Perfect Repeats of Tripsacum dactyloides mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008362	TTTGAC	5	12594	12623	30	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008362	ATAAGA	36	14942	15157	216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008362	TCTTTA	28	39043	39210	168	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008362	ATAGAG	6	72825	72860	36	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11527861
5	NC_008362	TAAGTG	4	76993	77016	24	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11527861
6	NC_008362	TATTGG	4	78271	78294	24	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	11527861
7	NC_008362	CTAAAT	8	79007	79054	48	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11527861
8	NC_008362	TACTTA	14	88565	88648	84	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	11527861
9	NC_008362	CTAATA	13	104342	104419	78	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11527861
10	NC_008362	TACTAA	12	104424	104495	72	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11527861
11	NC_008362	TACTAA	12	104502	104573	72	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11527861
12	NC_008362	ATAAAA	33	113270	113467	198	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	11527861
13	NC_008362	TTAAGA	11	164204	164269	66	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11527861
14	NC_008362	TCCTTA	3	204527	204544	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	11527861
15	NC_008362	TCTAAG	5	208023	208052	30	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11527861
16	NC_008362	TATAAG	19	208053	208166	114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11527861
17	NC_008362	TATTAG	21	230678	230803	126	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11527861
18	NC_008362	CCATTT	24	245638	245781	144	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	11527861
19	NC_008362	TAGCCC	7	259877	259918	42	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	11527861
20	NC_008362	CTAAGT	15	261316	261405	90	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11527861
21	NC_008362	ATTAAG	20	284210	284329	120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11527861
22	NC_008362	CTTCTG	4	298663	298686	24	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	11527861
23	NC_008362	TCTAAT	7	316952	316993	42	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	11527861
24	NC_008362	ATACGA	11	328946	329011	66	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11527861
25	NC_008362	AAGGAA	9	358785	358838	54	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11527861
26	NC_008362	TATAAG	3	385562	385579	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11527861
27	NC_008362	TTAGTA	6	397214	397249	36	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11527861
28	NC_008362	CTATGG	3	417380	417397	18	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	11527861
29	NC_008362	TAACCT	15	418499	418588	90	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11527861
30	NC_008362	TTTCAC	4	433256	433279	24	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	11527861
31	NC_008362	CTGAAA	5	438032	438061	30	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11527861
32	NC_008362	TTAAGA	11	475904	475969	66	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11527861
33	NC_008362	TCCTTA	3	516227	516244	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	11527861
34	NC_008362	TCTAAG	5	519723	519752	30	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11527861
35	NC_008362	TATAAG	19	519753	519866	114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11527861
36	NC_008362	TATTAG	21	542378	542503	126	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11527861
37	NC_008362	CCATTT	24	557338	557481	144	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	11527861
38	NC_008362	AGGCAG	3	579406	579423	18	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	11527861
39	NC_008362	TTCTGG	3	603530	603547	18	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	11527861
40	NC_008362	CACTTT	9	610959	611012	54	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	11527861
41	NC_008362	TAAGTT	6	615473	615508	36	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11527861
42	NC_008362	TTCAAT	24	619816	619959	144	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	11527861
43	NC_008362	CTATGG	14	625646	625729	84	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	11527861
44	NC_008362	ACCATA	13	629260	629337	78	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	11527861
45	NC_008362	TTAGTT	15	631839	631928	90	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	11527861
46	NC_008362	CTTATC	23	645609	645746	138	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	11527861
47	NC_008362	ATAGAA	27	647756	647917	162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11527861
48	NC_008362	GCCCCA	11	656262	656327	66	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008362	ATTGAA	5	702090	702119	30	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Perfect Repeats of Tripsacum dactyloides mitochondrion