ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Tripsacum dactyloides mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008362	ACTTC	8	3056	3095	40	20 %	40 %	0 %	40 %	2 %	Non-Coding
2	NC_008362	CTTTT	3	4317	4331	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
3	NC_008362	ATAAG	9	5395	5438	44	60 %	20 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding
4	NC_008362	ATAAG	3	12790	12804	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008362	TAAGA	12	18860	18918	59	60 %	20 %	20 %	0 %	1 %	Non-Coding
6	NC_008362	ATTCC	3	26369	26382	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
7	NC_008362	TCAAT	3	31557	31570	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
8	NC_008362	GATTA	9	32236	32280	45	40 %	40 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_008362	TATAT	14	32239	32308	70	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_008362	TAGAG	10	32542	32591	50	40 %	20 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008362	CAAAG	3	39028	39042	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
12	NC_008362	TTACC	3	40685	40700	16	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	11527862
13	NC_008362	TAAAG	20	49931	50029	99	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_008362	CTATA	15	52940	53013	74	40 %	40 %	0 %	20 %	8 %	Non-Coding
15	NC_008362	ACTAA	7	64966	64999	34	60 %	20 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
16	NC_008362	CATCT	3	74541	74554	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	11527861
17	NC_008362	CTTTT	4	75466	75484	19	0 %	80 %	0 %	20 %	5 %	11527861
18	NC_008362	TAAAC	3	76430	76443	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	11527861
19	NC_008362	AACAA	3	98778	98792	15	80 %	0 %	0 %	20 %	0 %	11527861
20	NC_008362	ATTCT	3	106422	106435	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	11527861
21	NC_008362	TACTA	17	131609	131691	83	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	11527861
22	NC_008362	TCCAT	7	138615	138649	35	20 %	40 %	0 %	40 %	0 %	11527861
23	NC_008362	TGTTT	3	146369	146383	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	11527861
24	NC_008362	CATTC	3	147968	147981	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	11527861
25	NC_008362	TATAG	12	148434	148492	59	40 %	40 %	20 %	0 %	1 %	11527861
26	NC_008362	TGCGT	3	154304	154317	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	11527861
27	NC_008362	AAGAA	3	156246	156260	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	11527861
28	NC_008362	ATGAG	6	157393	157422	30	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	11527861
29	NC_008362	GCTTT	3	165185	165198	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	11527861
30	NC_008362	TTCTA	8	165439	165479	41	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	11527861
31	NC_008362	TATAA	4	178377	178396	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	11527861
32	NC_008362	TTGAG	3	185507	185521	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	11527861
33	NC_008362	AAAGT	11	188739	188792	54	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	11527861
34	NC_008362	AAACG	3	195871	195885	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	11527861
35	NC_008362	GAAAA	3	197155	197168	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	11527861
36	NC_008362	ATCAA	5	198212	198236	25	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	11527861
37	NC_008362	AAATG	3	199193	199207	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	11527861
38	NC_008362	TTTAA	3	199586	199599	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	11527861
39	NC_008362	CTATA	23	200228	200342	115	40 %	40 %	0 %	20 %	1 %	11527861
40	NC_008362	GAATA	3	203274	203289	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	11527861
41	NC_008362	AAGTA	39	205231	205425	195	60 %	20 %	20 %	0 %	3 %	11527861
42	NC_008362	AGAAA	3	206363	206377	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	11527861
43	NC_008362	CAAGG	3	222815	222828	14	40 %	0 %	40 %	20 %	7 %	11527861
44	NC_008362	TCTTT	13	230604	230668	65	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	11527861
45	NC_008362	GAATA	3	238040	238053	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	11527861
46	NC_008362	TCCAC	3	239889	239903	15	20 %	20 %	0 %	60 %	6 %	11527861
47	NC_008362	CGGCA	3	241133	241146	14	20 %	0 %	40 %	40 %	7 %	11527861
48	NC_008362	ATATT	3	243260	243274	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	11527861
49	NC_008362	TTAAG	3	249843	249857	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	11527861
50	NC_008362	ATGGG	3	272045	272058	14	20 %	20 %	60 %	0 %	7 %	11527861
51	NC_008362	ACTAA	3	277389	277403	15	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	11527861
52	NC_008362	TATAT	12	292708	292767	60	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	11527861
53	NC_008362	TTTCA	3	298930	298944	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	11527861
54	NC_008362	ACCAT	15	309092	309166	75	40 %	20 %	0 %	40 %	2 %	11527861
55	NC_008362	ATATA	31	318897	319050	154	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	11527861
56	NC_008362	GTAGC	3	336873	336886	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	11527861
57	NC_008362	CAATA	17	337209	337292	84	60 %	20 %	0 %	20 %	1 %	11527861
58	NC_008362	AGTAA	7	344803	344836	34	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	11527861
59	NC_008362	TATAC	11	349581	349636	56	40 %	40 %	0 %	20 %	8 %	11527861
60	NC_008362	TTTGA	3	350343	350356	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	11527861
61	NC_008362	ATAGT	19	358656	358750	95	40 %	40 %	20 %	0 %	2 %	11527861
62	NC_008362	CTCTG	3	361393	361406	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	11527861
63	NC_008362	TTACA	3	361454	361468	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	11527861
64	NC_008362	GTAGA	15	362206	362280	75	40 %	20 %	40 %	0 %	0 %	11527861
65	NC_008362	TTTGA	14	365395	365462	68	20 %	60 %	20 %	0 %	5 %	11527861
66	NC_008362	AGCTT	3	368312	368326	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	11527861
67	NC_008362	TCTTA	3	375509	375523	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	11527861
68	NC_008362	AGTAA	7	378364	378397	34	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	11527861
69	NC_008362	ATTAG	3	379132	379146	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	11527861
70	NC_008362	CTATT	3	380078	380092	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	11527861
71	NC_008362	TAGTT	3	384769	384782	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	11527861
72	NC_008362	TAAGT	3	410210	410224	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	11527861
73	NC_008362	TATAG	26	411081	411210	130	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	11527861
74	NC_008362	ATAAG	36	418974	419151	178	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	11527861
75	NC_008362	TACTA	24	422725	422843	119	40 %	40 %	0 %	20 %	5 %	11527861
76	NC_008362	ACTAA	8	424814	424852	39	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	11527861
77	NC_008362	CGAAG	3	429046	429060	15	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	11527861
78	NC_008362	CTTTA	3	435728	435741	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	11527861
79	NC_008362	ACGAA	8	439076	439114	39	60 %	0 %	20 %	20 %	5 %	11527861
80	NC_008362	CTTAA	3	446366	446380	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	11527861
81	NC_008362	TACTA	3	448613	448627	15	40 %	40 %	0 %	20 %	0 %	11527861
82	NC_008362	TATGA	7	448659	448692	34	40 %	40 %	20 %	0 %	8 %	11527861
83	NC_008362	TGTTT	3	458069	458083	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	11527861
84	NC_008362	CATTC	3	459668	459681	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	11527861
85	NC_008362	TATAG	12	460134	460192	59	40 %	40 %	20 %	0 %	1 %	11527861
86	NC_008362	TGCGT	3	466004	466017	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	11527861
87	NC_008362	AAGAA	3	467946	467960	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	11527861
88	NC_008362	ATGAG	6	469093	469122	30	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	11527861
89	NC_008362	GCTTT	3	476885	476898	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	11527861
90	NC_008362	TTCTA	8	477139	477179	41	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	11527861
91	NC_008362	TATAA	4	490077	490096	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	11527861
92	NC_008362	TTGAG	3	497207	497221	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	11527861
93	NC_008362	AAAGT	11	500439	500492	54	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	11527861
94	NC_008362	AAACG	3	507571	507585	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	11527861
95	NC_008362	GAAAA	3	508855	508868	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	11527861
96	NC_008362	ATCAA	5	509912	509936	25	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	11527861
97	NC_008362	AAATG	3	510893	510907	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	11527861
98	NC_008362	TTTAA	3	511286	511299	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	11527861
99	NC_008362	CTATA	23	511928	512042	115	40 %	40 %	0 %	20 %	1 %	11527861
100	NC_008362	GAATA	3	514974	514989	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	11527861
101	NC_008362	AAGTA	43	516931	517143	213	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	11527861
102	NC_008362	AGAAA	3	518063	518077	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	11527861
103	NC_008362	CAAGG	3	534515	534528	14	40 %	0 %	40 %	20 %	7 %	11527861
104	NC_008362	TCTTT	13	542304	542368	65	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	11527861
105	NC_008362	GAATA	3	549740	549753	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	11527861
106	NC_008362	TCCAC	3	551589	551603	15	20 %	20 %	0 %	60 %	6 %	11527861
107	NC_008362	CGGCA	3	552833	552846	14	20 %	0 %	40 %	40 %	7 %	11527861
108	NC_008362	ATATT	3	554960	554974	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	11527861
109	NC_008362	GGCAA	3	570939	570953	15	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	11527861
110	NC_008362	AGTCT	3	576125	576139	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	11527861
111	NC_008362	AGTTA	4	576912	576931	20	40 %	40 %	20 %	0 %	5 %	11527861
112	NC_008362	ACTTA	4	583223	583242	20	40 %	40 %	0 %	20 %	5 %	11527861
113	NC_008362	ATCCC	5	586813	586837	25	20 %	20 %	0 %	60 %	0 %	11527861
114	NC_008362	ATAGA	16	587986	588065	80	60 %	20 %	20 %	0 %	2 %	11527861
115	NC_008362	TATGG	15	597719	597793	75	20 %	40 %	40 %	0 %	2 %	11527861
116	NC_008362	TATAC	13	598940	599003	64	40 %	40 %	0 %	20 %	9 %	11527861
117	NC_008362	GTGCC	3	599623	599636	14	0 %	20 %	40 %	40 %	7 %	11527861
118	NC_008362	ACTTG	4	604255	604275	21	20 %	40 %	20 %	20 %	4 %	11527861
119	NC_008362	TCGCT	3	609380	609394	15	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	11527861
120	NC_008362	TAATA	15	610452	610527	76	60 %	40 %	0 %	0 %	3 %	11527861
121	NC_008362	AAGTA	3	615754	615767	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	11527861
122	NC_008362	ATAGG	10	624783	624831	49	40 %	20 %	40 %	0 %	4 %	11527861
123	NC_008362	TCGGT	3	626566	626580	15	0 %	40 %	40 %	20 %	6 %	11527861
124	NC_008362	TTCGT	6	644700	644728	29	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	11527861
125	NC_008362	TCATT	3	649305	649318	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	11527861
126	NC_008362	TGGAT	22	653291	653400	110	20 %	40 %	40 %	0 %	0 %	11527861
127	NC_008362	GTATA	19	654420	654514	95	40 %	40 %	20 %	0 %	1 %	Non-Coding
128	NC_008362	CTATA	4	664538	664557	20	40 %	40 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
129	NC_008362	GCTTG	3	671393	671407	15	0 %	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008362	TACTT	7	683219	683253	35	20 %	60 %	0 %	20 %	2 %	11527861
131	NC_008362	TACTG	3	692607	692620	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Tripsacum dactyloides mitochondrion