ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Sorghum bicolor mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008360	TTCTTT	3	2366	2384	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
2	NC_008360	TTGGCT	3	2571	2588	18	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
3	NC_008360	ACTCTT	3	43464	43482	19	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	11527854
4	NC_008360	CCCAAG	3	59922	59939	18	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	5 %	11527854
5	NC_008360	AGGAAT	3	106111	106128	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	11527854
6	NC_008360	CCTATT	3	109566	109583	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	11527854
7	NC_008360	AAAAAG	3	168128	168146	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	11527854
8	NC_008360	CCATGT	3	168454	168471	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	11527854
9	NC_008360	CTCTTC	3	175014	175032	19	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	11527854
10	NC_008360	TCTCCT	3	175482	175499	18	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	11527854
11	NC_008360	CTTTTC	3	177320	177338	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	11527854
12	NC_008360	AAGAAA	3	195280	195298	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	11527854
13	NC_008360	AGCCAA	3	216802	216819	18	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	5 %	11527854
14	NC_008360	TGGTGA	3	220466	220483	18	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	5 %	11527854
15	NC_008360	ACAATG	3	234714	234731	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	11527854
16	NC_008360	AGAAAA	3	240526	240544	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	11527854
17	NC_008360	CTTCCT	3	262480	262498	19	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	11527854
18	NC_008360	ATTTCT	3	266697	266714	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	11527854
19	NC_008360	ATACGA	3	270426	270443	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	11527854
20	NC_008360	CAAACT	3	281774	281791	18	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	11527854
21	NC_008360	GGGAGA	3	303914	303932	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10 %	11527854
22	NC_008360	TTCTTT	3	332444	332462	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	11527854
23	NC_008360	CATAGC	3	351266	351282	17	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	11527854
24	NC_008360	CGAACA	3	373239	373256	18	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	5 %	11527854
25	NC_008360	GGCTAG	3	378930	378946	17	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	5 %	11527854
26	NC_008360	TTCTTT	3	419157	419175	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	11527854
27	NC_008360	AAGAAA	3	444519	444537	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_008360	AGCCAA	3	466041	466058	18	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Sorghum bicolor mitochondrion