Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Sorghum bicolor mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008360TAA4992899391266.67 %33.33 %0 %0 %8 %11527854
2NC_008360AAG411230112411266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11527854
3NC_008360CTT42002420034110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11527854
4NC_008360CCT42159721607110 %33.33 %0 %66.67 %9 %11527854
5NC_008360TCA423778237891233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11527854
6NC_008360ACA527015270291566.67 %0 %0 %33.33 %6 %11527854
7NC_008360AGA428778287891266.67 %0 %33.33 %0 %0 %11527854
8NC_008360TCT43428934299110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11527854
9NC_008360AGC436011360211133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %11527854
10NC_008360ACT439350393601133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11527854
11NC_008360TTC44058940599110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11527854
12NC_008360CTA444658446681133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11527854
13NC_008360CCA445837458471133.33 %0 %0 %66.67 %9 %11527854
14NC_008360CTT44894148953130 %66.67 %0 %33.33 %7 %11527854
15NC_008360TTC44900049011120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
16NC_008360TGT45021250222110 %66.67 %33.33 %0 %9 %11527854
17NC_008360CAC454964549751233.33 %0 %0 %66.67 %8 %11527854
18NC_008360GAA457878578891266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11527854
19NC_008360AGT560269602831533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %11527854
20NC_008360TTC46068160692120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
21NC_008360AGA461589616001266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11527854
22NC_008360AAC462715627261266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11527854
23NC_008360TCT56323963252140 %66.67 %0 %33.33 %7 %11527854
24NC_008360CTA463792638031233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11527854
25NC_008360GAA464634646441166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11527854
26NC_008360GGC46608366094120 %0 %66.67 %33.33 %8 %11527854
27NC_008360CTG47103171041110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %11527854
28NC_008360TAG475807758171133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %11527854
29NC_008360TTC47718577195110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11527854
30NC_008360AGA479537795491366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11527854
31NC_008360AAG480044800561366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11527854
32NC_008360TTA484671846821233.33 %66.67 %0 %0 %8 %11527854
33NC_008360ATT485695857061233.33 %66.67 %0 %0 %8 %11527854
34NC_008360TAT491424914341133.33 %66.67 %0 %0 %9 %11527854
35NC_008360GTT4102933102943110 %66.67 %33.33 %0 %9 %11527854
36NC_008360CAT41038891039001233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11527854
37NC_008360GTA41123371123471133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %11527854
38NC_008360TAC41130501130611233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11527854
39NC_008360GAA41161391161491166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11527854
40NC_008360GAC41165741165841133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %11527854
41NC_008360CTA51174201174341533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %11527854
42NC_008360GTT4120131120143130 %66.67 %33.33 %0 %7 %11527854
43NC_008360CTT4133344133354110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11527854
44NC_008360CCT4134917134927110 %33.33 %0 %66.67 %9 %11527854
45NC_008360TCA41370981371091233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11527854
46NC_008360TTG4145603145614120 %66.67 %33.33 %0 %8 %11527854
47NC_008360AAG41497591497691166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11527854
48NC_008360ATC41533291533391133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11527854
49NC_008360AGA41572631572741266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11527854
50NC_008360AGA41589671589791366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11527854
51NC_008360ACC41612311612431333.33 %0 %0 %66.67 %7 %11527854
52NC_008360CTC4163837163847110 %33.33 %0 %66.67 %9 %11527854
53NC_008360CCA41641681641791233.33 %0 %0 %66.67 %8 %11527854
54NC_008360TGA41700381700491233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11527854
55NC_008360GAG41705941706041133.33 %0 %66.67 %0 %9 %11527854
56NC_008360ACA41734021734131266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11527854
57NC_008360TCT4173636173646110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11527854
58NC_008360AAG41781981782101366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11527854
59NC_008360TCT4179005179015110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11527854
60NC_008360GAA41791811791921266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11527854
61NC_008360AAG41801641801741166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11527854
62NC_008360CAG41870611870721233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %11527854
63NC_008360CTA51887781887921533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %11527854
64NC_008360TAG41923351923461233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11527854
65NC_008360AGA41943681943791266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11527854
66NC_008360AGA41957661957771266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11527854
67NC_008360TGA41966391966501233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11527854
68NC_008360GAG41994381994491233.33 %0 %66.67 %0 %0 %11527854
69NC_008360ACT42014482014591233.33 %33.33 %0 %33.33 %0 %11527854
70NC_008360TCA42021112021221233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11527854
71NC_008360CTT4204429204439110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11527854
72NC_008360TCT4207643207654120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
73NC_008360ATT42115052115171333.33 %66.67 %0 %0 %7 %11527854
74NC_008360ATA52142712142841466.67 %33.33 %0 %0 %7 %11527854
75NC_008360TAT52142982143121533.33 %66.67 %0 %0 %6 %11527854
76NC_008360GAA42170012170111166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11527854
77NC_008360GAA42175592175701266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11527854
78NC_008360CTA42204142204261333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %11527854
79NC_008360ATA42260142260241166.67 %33.33 %0 %0 %9 %11527854
80NC_008360TAA42261592261701266.67 %33.33 %0 %0 %0 %11527854
81NC_008360ACT42273252273351133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11527854
82NC_008360TCT4228436228447120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
83NC_008360CTA42305642305751233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11527854
84NC_008360CTG4231148231159120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11527854
85NC_008360AAC42341412341511166.67 %0 %0 %33.33 %9 %11527854
86NC_008360GGT4234557234567110 %33.33 %66.67 %0 %9 %11527854
87NC_008360TCT4237657237667110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11527854
88NC_008360AGC42393792393891133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %11527854
89NC_008360TCT4245094245105120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
90NC_008360CTA42463572463671133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11527854
91NC_008360TAT42469302469401133.33 %66.67 %0 %0 %9 %11527854
92NC_008360AGA42486902487001166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11527854
93NC_008360GGA42492442492541133.33 %0 %66.67 %0 %9 %11527854
94NC_008360ATA42530302530411266.67 %33.33 %0 %0 %8 %11527854
95NC_008360TCT4254076254087120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
96NC_008360ATA42541622541721166.67 %33.33 %0 %0 %9 %11527854
97NC_008360ATT42568372568481233.33 %66.67 %0 %0 %8 %11527854
98NC_008360AAG42580912581031366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11527854
99NC_008360TAT42605542605651233.33 %66.67 %0 %0 %8 %11527854
100NC_008360TAG42619982620091233.33 %33.33 %33.33 %0 %0 %11527854
101NC_008360CAA42680942681051266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11527854
102NC_008360AGG42695732695841233.33 %0 %66.67 %0 %8 %11527854
103NC_008360AAG42696402696511266.67 %0 %33.33 %0 %8 %11527854
104NC_008360TAG42711162711281333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %11527854
105NC_008360CAG42716012716111133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %11527854
106NC_008360AAG42719112719231366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11527854
107NC_008360ATA42723742723841166.67 %33.33 %0 %0 %9 %11527854
108NC_008360TGA42733532733631133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %11527854
109NC_008360CTA42804532804641233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11527854
110NC_008360TAC42807362807461133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11527854
111NC_008360TCA52882852883001633.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %11527854
112NC_008360CTT4291264291275120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
113NC_008360AGA42945492945611366.67 %0 %33.33 %0 %7 %11527854
114NC_008360AGA42974932975031166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11527854
115NC_008360CTT4297697297708120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
116NC_008360CTA43025503025611233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11527854
117NC_008360TAA43028003028111266.67 %33.33 %0 %0 %8 %11527854
118NC_008360GTG4307074307085120 %33.33 %66.67 %0 %8 %11527854
119NC_008360GCT4307175307185110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %11527854
120NC_008360TCC4309540309550110 %33.33 %0 %66.67 %9 %11527854
121NC_008360GAT43104193104291133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %11527854
122NC_008360TCG4317188317198110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %11527854
123NC_008360TAG43192303192411233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11527854
124NC_008360ATC43193783193891233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11527854
125NC_008360TGT4319445319455110 %66.67 %33.33 %0 %9 %11527854
126NC_008360CGT4326239326249110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %11527854
127NC_008360GAT43263733263831133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %11527854
128NC_008360ATT43290203290301133.33 %66.67 %0 %0 %9 %11527854
129NC_008360AGA43292973293071166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11527854
130NC_008360CTT4331749331759110 %66.67 %0 %33.33 %9 %11527854
131NC_008360TAG43349703349811233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11527854
132NC_008360AAG43356003356101166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11527854
133NC_008360AAT43360643360761366.67 %33.33 %0 %0 %7 %11527854
134NC_008360CAA43436603436711266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11527854
135NC_008360GAA53440733440861466.67 %0 %33.33 %0 %7 %11527854
136NC_008360ATT43458093458211333.33 %66.67 %0 %0 %7 %11527854
137NC_008360AGG43476713476821233.33 %0 %66.67 %0 %8 %11527854
138NC_008360AAG43540893540991166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11527854
139NC_008360TTC4364292364303120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
140NC_008360GCT4370069370080120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11527854
141NC_008360ACC43708453708561233.33 %0 %0 %66.67 %8 %11527854
142NC_008360AAC43726373726481266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11527854
143NC_008360TCA43763413763511133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %11527854
144NC_008360AAC43799483799591266.67 %0 %0 %33.33 %8 %11527854
145NC_008360TGC5380382380397160 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %11527854
146NC_008360GGT4381167381179130 %33.33 %66.67 %0 %7 %11527854
147NC_008360ACT43815553815661233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %11527854
148NC_008360TCC4381803381813110 %33.33 %0 %66.67 %9 %11527854
149NC_008360AGC43866523866631233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %11527854
150NC_008360ATT43892463892581333.33 %66.67 %0 %0 %7 %11527854
151NC_008360GAT43897363897461133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %11527854
152NC_008360ATG43913053913171333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %11527854
153NC_008360GTA43913483913581133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %11527854
154NC_008360TCT4391647391658120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
155NC_008360AGT43939893940001233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %11527854
156NC_008360ATA43975613975731366.67 %33.33 %0 %0 %7 %11527854
157NC_008360CAA44036344036441166.67 %0 %0 %33.33 %9 %11527854
158NC_008360GTT4405826405837120 %66.67 %33.33 %0 %8 %11527854
159NC_008360AGA44072144072241166.67 %0 %33.33 %0 %9 %11527854
160NC_008360CTT4407580407591120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
161NC_008360CTT4416110416121120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
162NC_008360GAT44167364167481333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %11527854
163NC_008360TAG44235744235841133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %11527854
164NC_008360CTT4423983423994120 %66.67 %0 %33.33 %8 %11527854
165NC_008360GAC44253824253931233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %11527854
166NC_008360CAA44273474273571166.67 %0 %0 %33.33 %9 %11527854
167NC_008360TGC4434839434850120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %11527854
168NC_008360CTT4435167435178120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
169NC_008360CAG44363004363111233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
170NC_008360CTA54380174380311533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
171NC_008360TAG44415744415851233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
172NC_008360AGA44436074436181266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
173NC_008360AGA44450054450161266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
174NC_008360TGA44458784458891233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
175NC_008360GAG44486774486881233.33 %0 %66.67 %0 %0 %Non-Coding
176NC_008360ACT44506874506981233.33 %33.33 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
177NC_008360TCA44513504513611233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
178NC_008360CTT4453668453678110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
179NC_008360TCT4456882456893120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
180NC_008360ATT44607444607561333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
181NC_008360ATA54635104635231466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
182NC_008360TAT54635374635511533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
183NC_008360GAA44662404662501166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
184NC_008360GAA44667984668091266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding