ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Sorghum bicolor mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008360	AG	6	8541	8551	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11527854
2	NC_008360	AG	7	11029	11042	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11527854
3	NC_008360	AG	6	26227	26238	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11527854
4	NC_008360	CT	6	37022	37033	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11527854
5	NC_008360	TC	6	38500	38510	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11527854
6	NC_008360	TC	6	40236	40247	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11527854
7	NC_008360	AT	7	46796	46809	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11527854
8	NC_008360	TA	7	46824	46836	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11527854
9	NC_008360	TA	6	52788	52799	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11527854
10	NC_008360	CT	6	64781	64791	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11527854
11	NC_008360	CT	6	82004	82015	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11527854
12	NC_008360	AT	6	88910	88920	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11527854
13	NC_008360	TA	6	89117	89127	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11527854
14	NC_008360	AT	6	93180	93190	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11527854
15	NC_008360	TC	6	95467	95477	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11527854
16	NC_008360	CT	7	97562	97575	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11527854
17	NC_008360	TA	6	99720	99731	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11527854
18	NC_008360	CT	7	99892	99904	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11527854
19	NC_008360	AC	6	103543	103553	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	11527854
20	NC_008360	TA	6	104174	104185	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11527854
21	NC_008360	CT	6	121289	121299	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11527854
22	NC_008360	GT	6	122990	123000	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	11527854
23	NC_008360	AT	6	124578	124589	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11527854
24	NC_008360	AT	6	143935	143946	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11527854
25	NC_008360	AG	6	151702	151712	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11527854
26	NC_008360	TA	7	167478	167491	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11527854
27	NC_008360	AC	6	173495	173505	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	11527854
28	NC_008360	GA	7	174666	174679	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11527854
29	NC_008360	TA	6	177112	177122	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11527854
30	NC_008360	GA	6	196857	196867	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11527854
31	NC_008360	GA	6	201067	201078	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11527854
32	NC_008360	AT	6	214291	214303	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11527854
33	NC_008360	AG	6	223880	223890	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11527854
34	NC_008360	GA	6	225753	225763	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11527854
35	NC_008360	CT	7	243805	243818	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11527854
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37	NC_008360	AG	6	258131	258141	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11527854
38	NC_008360	AT	6	267851	267861	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11527854
39	NC_008360	TC	6	288085	288095	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11527854
40	NC_008360	CT	6	288104	288115	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11527854
41	NC_008360	TA	7	295465	295478	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11527854
42	NC_008360	TA	6	295485	295495	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11527854
43	NC_008360	AT	8	314082	314097	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11527854
44	NC_008360	GA	6	315384	315394	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11527854
45	NC_008360	TA	6	353455	353466	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11527854
46	NC_008360	TA	7	359930	359943	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11527854
47	NC_008360	TA	6	367955	367965	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11527854
48	NC_008360	AC	7	371022	371035	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	11527854
49	NC_008360	TG	6	378663	378673	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	11527854
50	NC_008360	TA	6	380713	380723	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11527854
51	NC_008360	TA	6	393386	393397	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11527854
52	NC_008360	TC	6	407690	407701	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11527854
53	NC_008360	GA	7	413463	413475	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11527854
54	NC_008360	AT	6	415180	415191	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11527854
55	NC_008360	CT	6	419556	419566	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11527854
56	NC_008360	CT	6	421706	421716	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11527854
57	NC_008360	CT	6	424366	424376	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11527854
58	NC_008360	AG	8	426956	426970	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	11527854
59	NC_008360	GA	6	446096	446106	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_008360	GA	6	450306	450317	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_008360	AT	6	463530	463542	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Sorghum bicolor mitochondrion