ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Sorghum bicolor mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008360	CTTT	3	440	450	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_008360	GAAA	3	3312	3323	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008360	CCTG	3	4868	4879	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	11527854
4	NC_008360	ATAG	3	9079	9089	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11527854
5	NC_008360	TTTC	3	13245	13255	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11527854
6	NC_008360	AGTA	3	16374	16384	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11527854
7	NC_008360	TAAG	3	19707	19718	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11527854
8	NC_008360	TTTC	3	20269	20280	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11527854
9	NC_008360	GAAT	3	22683	22693	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11527854
10	NC_008360	AAAG	3	25305	25316	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11527854
11	NC_008360	CCTT	3	26511	26523	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11527854
12	NC_008360	TTAT	3	29168	29179	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11527854
13	NC_008360	CCTT	3	29339	29350	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	11527854
14	NC_008360	ACTT	3	29486	29498	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	11527854
15	NC_008360	TAGG	3	32568	32579	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	11527854
16	NC_008360	GGGA	3	34857	34868	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	11527854
17	NC_008360	TCAA	3	36183	36194	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11527854
18	NC_008360	TTAT	3	37250	37261	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11527854
19	NC_008360	GTCT	3	37270	37281	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	11527854
20	NC_008360	GAAA	3	37670	37680	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11527854
21	NC_008360	GAAG	3	43879	43890	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11527854
22	NC_008360	AAAG	3	51400	51410	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11527854
23	NC_008360	TTCC	3	52999	53010	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11527854
24	NC_008360	TTGA	3	53947	53961	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	11527854
25	NC_008360	GAAA	3	55130	55141	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11527854
26	NC_008360	ACTC	3	55996	56006	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	11527854
27	NC_008360	AAAG	3	56429	56440	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	11527854
28	NC_008360	ATGT	3	57101	57113	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11527854
29	NC_008360	TTTC	3	58782	58793	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11527854
30	NC_008360	AAGT	3	60249	60259	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11527854
31	NC_008360	TCAA	3	60293	60303	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11527854
32	NC_008360	CTGA	4	62750	62766	17	25 %	25 %	25 %	25 %	5 %	11527854
33	NC_008360	ACTC	3	63167	63179	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	11527854
34	NC_008360	CAAA	3	64350	64360	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11527854
35	NC_008360	CAAG	3	68106	68116	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11527854
36	NC_008360	CATA	3	70259	70270	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11527854
37	NC_008360	AACC	3	74712	74722	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	11527854
38	NC_008360	CCTA	3	75851	75862	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11527854
39	NC_008360	TTTC	4	76023	76039	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	11527854
40	NC_008360	TACG	3	77616	77627	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	11527854
41	NC_008360	GAAA	3	79653	79665	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	11527854
42	NC_008360	TCAC	3	82590	82601	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11527854
43	NC_008360	TTCC	3	82818	82828	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11527854
44	NC_008360	TCTT	3	84151	84161	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11527854
45	NC_008360	TCTA	3	86266	86278	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	11527854
46	NC_008360	TTTG	3	88640	88650	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11527854
47	NC_008360	TTCT	3	88808	88818	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11527854
48	NC_008360	TGTC	3	90395	90406	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	11527854
49	NC_008360	CGAA	3	96204	96215	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	11527854
50	NC_008360	CATC	3	96845	96856	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	11527854
51	NC_008360	GATC	3	97438	97449	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	11527854
52	NC_008360	CTTC	3	98892	98903	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11527854
53	NC_008360	CATT	3	98911	98923	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	11527854
54	NC_008360	CTTT	3	99496	99508	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	11527854
55	NC_008360	TTTC	3	99687	99698	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11527854
56	NC_008360	CGTA	3	100558	100568	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11527854
57	NC_008360	TATT	3	103042	103052	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11527854
58	NC_008360	AGAA	3	103335	103346	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11527854
59	NC_008360	ACTT	3	103721	103731	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11527854
60	NC_008360	AACA	3	105558	105569	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11527854
61	NC_008360	CTTA	3	109814	109825	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11527854
62	NC_008360	AAAG	3	110274	110284	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11527854
63	NC_008360	ACCT	4	110940	110954	15	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	11527854
64	NC_008360	TGGA	3	117904	117915	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	11527854
65	NC_008360	ATAG	3	121757	121767	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11527854
66	NC_008360	TCTA	3	122727	122738	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	11527854
67	NC_008360	CAGA	3	125745	125755	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11527854
68	NC_008360	TTTC	3	126565	126575	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11527854
69	NC_008360	AGTA	3	129694	129704	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11527854
70	NC_008360	TAAG	3	133027	133038	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11527854
71	NC_008360	TTTC	3	133589	133600	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11527854
72	NC_008360	GAAT	3	136003	136013	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11527854
73	NC_008360	AAAG	3	138625	138636	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11527854
74	NC_008360	AATT	3	141807	141818	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11527854
75	NC_008360	TTTC	3	147636	147646	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11527854
76	NC_008360	AATC	3	148887	148898	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11527854
77	NC_008360	AAGC	3	150174	150185	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	11527854
78	NC_008360	GGAG	3	153023	153035	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	11527854
79	NC_008360	TCAT	6	154134	154157	24	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11527854
80	NC_008360	CATT	3	161690	161700	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11527854
81	NC_008360	ATCC	3	163695	163705	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	11527854
82	NC_008360	CCTT	3	163970	163982	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11527854
83	NC_008360	GCTT	3	167421	167433	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	11527854
84	NC_008360	AACT	3	167561	167571	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11527854
85	NC_008360	TTAG	3	167585	167597	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11527854
86	NC_008360	GCCT	3	170368	170379	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	11527854
87	NC_008360	TTCC	3	171896	171908	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11527854
88	NC_008360	AGAA	3	173388	173399	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11527854
89	NC_008360	GGAG	3	174698	174709	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	11527854
90	NC_008360	CCTA	3	175674	175685	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11527854
91	NC_008360	AAAG	3	177651	177661	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11527854
92	NC_008360	ATCC	3	178515	178527	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	11527854
93	NC_008360	GCCA	3	182555	182565	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	11527854
94	NC_008360	CAGT	3	186997	187008	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	11527854
95	NC_008360	CCAT	3	187995	188007	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	11527854
96	NC_008360	AATG	3	188906	188917	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11527854
97	NC_008360	AAAT	3	189675	189687	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11527854
98	NC_008360	ATGA	3	192893	192904	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11527854
99	NC_008360	TTCC	4	194288	194303	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	11527854
100	NC_008360	AAAG	3	194831	194843	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	11527854
101	NC_008360	GAAA	3	200022	200032	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11527854
102	NC_008360	AAAT	3	202182	202194	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11527854
103	NC_008360	GTAA	3	204062	204072	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11527854
104	NC_008360	ATGG	3	204245	204256	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	11527854
105	NC_008360	TTAT	3	209836	209847	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11527854
106	NC_008360	CTTT	3	211488	211499	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11527854
107	NC_008360	ATGG	3	214430	214441	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	11527854
108	NC_008360	TTTC	3	216067	216078	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11527854
109	NC_008360	CTTC	3	221193	221204	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11527854
110	NC_008360	GTTC	3	222229	222240	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	11527854
111	NC_008360	TAGC	5	229863	229883	21	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11527854
112	NC_008360	TGAA	3	231087	231097	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11527854
113	NC_008360	GTGA	3	231526	231536	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	11527854
114	NC_008360	TTGG	3	232633	232643	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	11527854
115	NC_008360	TCCG	3	232832	232842	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	11527854
116	NC_008360	AAGG	3	235797	235808	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	11527854
117	NC_008360	TAGG	3	235936	235947	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	11527854
118	NC_008360	GGGA	3	238225	238236	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	11527854
119	NC_008360	TCAA	3	239551	239562	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11527854
120	NC_008360	GCTC	3	241107	241118	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	11527854
121	NC_008360	GAAA	3	243518	243528	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11527854
122	NC_008360	AAGG	3	244491	244501	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11527854
123	NC_008360	ATAG	3	246164	246175	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11527854
124	NC_008360	ATCC	4	246176	246191	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	11527854
125	NC_008360	TCCA	3	249982	249992	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	11527854
126	NC_008360	CGGT	3	256137	256148	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	11527854
127	NC_008360	TTCC	3	257140	257151	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11527854
128	NC_008360	GTTA	3	257952	257962	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11527854
129	NC_008360	AAGA	3	259275	259285	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11527854
130	NC_008360	GCTC	3	261920	261932	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	11527854
131	NC_008360	TTTC	4	264592	264607	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	11527854
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232	NC_008360	ATGG	3	463669	463680	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
233	NC_008360	TTTC	3	465306	465317	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Sorghum bicolor mitochondrion