ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Morus indica chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008359	TAA	4	215	227	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_008359	CAG	4	926	937	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	114804245
3	NC_008359	ATA	4	14647	14657	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_008359	TTA	4	15201	15213	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_008359	GTT	4	24783	24794	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	114804256
6	NC_008359	ATA	4	28372	28383	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_008359	TTA	4	28593	28603	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_008359	AAT	4	31423	31434	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_008359	TTC	4	31548	31558	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_008359	TAT	4	33177	33187	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_008359	TAA	4	38133	38143	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_008359	GAA	4	38699	38709	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_008359	ATG	4	40676	40686	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	114804264
14	NC_008359	GCA	4	42574	42585	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	114804265
15	NC_008359	TTA	4	53734	53745	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_008359	TAG	4	56721	56732	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	114804272
17	NC_008359	ATA	4	67887	67897	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_008359	TAA	9	68605	68632	28	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
19	NC_008359	ATA	4	69720	69730	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_008359	TTA	4	70457	70468	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_008359	TCT	4	70543	70554	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_008359	GAA	4	71435	71446	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_008359	TCT	4	77018	77028	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	114804288
24	NC_008359	CAA	4	84029	84040	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	114804288
25	NC_008359	GAT	4	87967	87977	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	114804288
26	NC_008359	GAT	4	89355	89365	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	114804288
27	NC_008359	GAT	4	92421	92432	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	114804288
28	NC_008359	GAA	5	112213	112227	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	114804287
29	NC_008359	AAT	4	113717	113728	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	114804287
30	NC_008359	TAT	4	113797	113809	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	114804287
31	NC_008359	TAA	4	115395	115405	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	114804287
32	NC_008359	TAA	5	116511	116525	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	114804287
33	NC_008359	TAT	7	116896	116915	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	114804287
34	NC_008359	TAT	4	117424	117434	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	114804287
35	NC_008359	AAT	4	120090	120101	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	114804287
36	NC_008359	TTC	5	124378	124392	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	114804287
37	NC_008359	AAT	4	127895	127906	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	114804287
38	NC_008359	TTA	5	130225	130239	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	114804287
39	NC_008359	TCT	4	131488	131499	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	114804287
40	NC_008359	ATT	4	131781	131792	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	114804287
41	NC_008359	TAA	4	132242	132253	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	114804287
42	NC_008359	TTC	6	133640	133658	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	114804287
43	NC_008359	AAG	4	144126	144137	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	114804287
44	NC_008359	ATC	4	153439	153450	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	114804324
45	NC_008359	ATC	4	156506	156516	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_008359	ATC	4	157894	157904	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	114804326

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Morus indica chloroplast