ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Tetrahymena pigmentosa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008339	CT	6	1662	1672	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
2	NC_008339	AT	6	4924	4934	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_008339	TA	6	8447	8457	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432990
4	NC_008339	TA	9	8663	8679	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11432991
5	NC_008339	TA	8	10078	10092	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11432991
6	NC_008339	AT	7	12002	12015	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432991
7	NC_008339	AT	6	14983	14994	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432992
8	NC_008339	TA	6	15231	15241	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432992
9	NC_008339	TA	6	16312	16323	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432992
10	NC_008339	TA	7	18099	18114	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_008339	TA	7	18168	18181	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432992
12	NC_008339	AT	7	18184	18197	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432992
13	NC_008339	AT	11	18208	18231	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432992
14	NC_008339	TA	7	18352	18364	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432992
15	NC_008339	AT	6	18839	18850	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432992
16	NC_008339	TA	6	19535	19545	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432992
17	NC_008339	AT	6	20189	20201	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432992
18	NC_008339	TA	6	21011	21022	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432992
19	NC_008339	AT	6	23888	23898	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
20	NC_008339	TA	6	24278	24288	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
21	NC_008339	AT	11	24448	24468	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
22	NC_008339	AT	6	24843	24855	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432993
23	NC_008339	AT	12	25131	25152	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
24	NC_008339	AT	8	25161	25176	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11432993
25	NC_008339	AT	13	25192	25216	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432993
26	NC_008339	TA	6	25328	25340	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432993
27	NC_008339	AT	7	25623	25635	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432993
28	NC_008339	TA	6	28033	28043	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
29	NC_008339	TA	6	28079	28089	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
30	NC_008339	TA	6	28250	28260	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
31	NC_008339	AT	6	29016	29027	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432993
32	NC_008339	TA	6	31130	31140	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
33	NC_008339	AT	6	31387	31397	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
34	NC_008339	AT	6	32011	32021	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_008339	TA	6	35075	35085	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
36	NC_008339	AT	6	36210	36220	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
37	NC_008339	AT	6	36973	36983	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
38	NC_008339	AT	6	37523	37533	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
39	NC_008339	AT	8	37541	37556	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11432993
40	NC_008339	TA	10	37577	37595	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	11432993
41	NC_008339	AT	6	43122	43132	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432994
42	NC_008339	TA	6	45185	45195	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_008339	AG	6	45364	45374	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Tetrahymena pigmentosa mitochondrion