ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Tetrahymena pigmentosa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008339	AAAT	4	361	376	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_008339	TAT	4	456	467	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008339	CTAT	3	1223	1234	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_008339	AAT	4	1235	1245	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_008339	ATT	5	1244	1257	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_008339	ATAG	3	1352	1362	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_008339	CAG	4	1448	1458	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
8	NC_008339	CT	6	1662	1672	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
9	NC_008339	ATTT	3	2064	2076	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_008339	TTA	4	2242	2253	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_008339	ATT	4	2888	2898	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_008339	AATT	3	2957	2967	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_008339	TATAAA	3	3086	3104	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	11432990
14	NC_008339	T	14	3401	3414	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11432990
15	NC_008339	TAAA	3	4471	4481	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11432990
16	NC_008339	AT	6	4924	4934	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_008339	ATTT	3	5037	5048	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11432990
18	NC_008339	TTTA	3	5204	5214	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432990
19	NC_008339	TAAAT	3	5663	5676	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	11432990
20	NC_008339	AAT	4	5854	5864	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432990
21	NC_008339	TTTA	3	5882	5892	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432990
22	NC_008339	TTTAA	4	6120	6138	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	11432990
23	NC_008339	T	18	6258	6275	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	11432990
24	NC_008339	T	15	6295	6309	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11432990
25	NC_008339	T	12	6458	6469	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11432990
26	NC_008339	ATTTAT	3	7081	7098	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11432990
27	NC_008339	TCT	4	7352	7363	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11432990
28	NC_008339	TTTTA	3	8097	8110	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11432990
29	NC_008339	TA	6	8447	8457	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432990
30	NC_008339	TA	9	8663	8679	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11432991
31	NC_008339	AAATT	4	8680	8699	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	11432991
32	NC_008339	AATT	3	8932	8943	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432991
33	NC_008339	TTA	5	9104	9117	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432991
34	NC_008339	TAA	4	9296	9307	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432991
35	NC_008339	TA	8	10078	10092	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11432991
36	NC_008339	TAATAT	3	10102	10118	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11432991
37	NC_008339	TAA	4	10545	10556	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432991
38	NC_008339	TATG	3	10879	10890	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	11432991
39	NC_008339	ATT	4	11399	11410	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11432991
40	NC_008339	ATA	4	11531	11542	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432991
41	NC_008339	ATA	7	11548	11569	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432991
42	NC_008339	AT	7	12002	12015	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432991
43	NC_008339	AAAAT	3	12318	12332	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	11432991
44	NC_008339	ATT	4	12363	12374	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432991
45	NC_008339	TAA	5	12445	12459	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432991
46	NC_008339	TAA	4	12514	12524	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432991
47	NC_008339	TTA	4	12651	12661	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432991
48	NC_008339	ATA	4	12715	12725	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432991
49	NC_008339	TTTTAA	3	12866	12884	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11432991
50	NC_008339	T	12	12928	12939	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11432991
51	NC_008339	ACC	4	12945	12956	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11432991
52	NC_008339	TAAT	3	13567	13578	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432991
53	NC_008339	TTA	4	13627	13638	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432991
54	NC_008339	AAAATT	3	13713	13730	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11432991
55	NC_008339	TAAAT	3	13947	13960	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	11432991
56	NC_008339	ATA	4	14042	14052	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432991
57	NC_008339	TAAA	3	14529	14539	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11432991
58	NC_008339	ATA	4	14669	14679	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432991
59	NC_008339	AT	6	14983	14994	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432992
60	NC_008339	TATTT	3	15062	15076	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11432992
61	NC_008339	TA	6	15231	15241	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432992
62	NC_008339	TAAT	3	15497	15508	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	11432992
63	NC_008339	ATTTT	3	15733	15746	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11432992
64	NC_008339	AAT	4	15954	15966	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432992
65	NC_008339	AAAAT	3	16002	16015	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11432992
66	NC_008339	ATT	4	16130	16141	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432992
67	NC_008339	TAT	4	16161	16171	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432992
68	NC_008339	A	13	16242	16254	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11432992
69	NC_008339	TA	6	16312	16323	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432992
70	NC_008339	ATT	4	16360	16371	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432992
71	NC_008339	A	12	16430	16441	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	11432992
72	NC_008339	TTATA	3	16485	16498	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	11432992
73	NC_008339	ATT	5	16522	16536	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432992
74	NC_008339	TAT	4	16732	16742	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432992
75	NC_008339	TTAT	3	16752	16763	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11432992
76	NC_008339	ATT	4	16954	16965	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11432992
77	NC_008339	ATTTT	3	17064	17078	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	11432992
78	NC_008339	TAATC	3	17736	17749	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	11432992
79	NC_008339	T	15	17860	17874	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	11432992
80	NC_008339	ATT	7	17869	17889	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432992
81	NC_008339	TA	7	18099	18114	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_008339	ATT	4	18144	18154	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432992
83	NC_008339	TA	7	18168	18181	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432992
84	NC_008339	AT	7	18184	18197	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432992
85	NC_008339	AT	11	18208	18231	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432992
86	NC_008339	TAT	5	18225	18240	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432992
87	NC_008339	TA	7	18352	18364	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432992
88	NC_008339	TTATAG	3	18468	18485	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	11432992
89	NC_008339	TAAA	3	18635	18646	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432992
90	NC_008339	AAAAT	3	18652	18666	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	11432992
91	NC_008339	TAAA	3	18758	18769	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432992
92	NC_008339	AT	6	18839	18850	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432992
93	NC_008339	TAT	4	19207	19218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432992
94	NC_008339	AATA	3	19353	19364	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432992
95	NC_008339	TA	6	19535	19545	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432992
96	NC_008339	ATAA	3	19587	19598	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	11432992
97	NC_008339	TAT	4	19933	19943	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432992
98	NC_008339	ATT	5	20135	20149	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432992
99	NC_008339	TAAA	3	20166	20177	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432992
100	NC_008339	AT	6	20189	20201	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432992
101	NC_008339	TAAAAA	3	20556	20573	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	11432992
102	NC_008339	TGTT	3	20740	20751	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11432992
103	NC_008339	TA	6	21011	21022	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432992
104	NC_008339	CCAA	3	21121	21131	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	11432992
105	NC_008339	TAT	4	21303	21314	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
106	NC_008339	AAT	4	21888	21899	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432993
107	NC_008339	ATA	4	22032	22043	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432993
108	NC_008339	ATTT	3	22211	22222	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_008339	ATT	4	22529	22541	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432993
110	NC_008339	AT	6	23888	23898	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
111	NC_008339	ATTTTT	4	24177	24199	23	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	4 %	11432993
112	NC_008339	TAT	4	24254	24265	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
113	NC_008339	TA	6	24278	24288	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
114	NC_008339	TAT	4	24388	24399	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
115	NC_008339	TAT	8	24404	24426	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
116	NC_008339	AT	11	24448	24468	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
117	NC_008339	ATTAT	3	24471	24486	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	11432993
118	NC_008339	AATTT	4	24627	24646	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	11432993
119	NC_008339	TTA	5	24660	24674	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432993
120	NC_008339	TTTATA	3	24683	24700	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11432993
121	NC_008339	TAT	4	24742	24753	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
122	NC_008339	T	13	24794	24806	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11432993
123	NC_008339	AT	6	24843	24855	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432993
124	NC_008339	TATT	3	24881	24892	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11432993
125	NC_008339	ATATA	4	25001	25019	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	11432993
126	NC_008339	TAT	7	25067	25087	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432993
127	NC_008339	TAT	5	25096	25109	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432993
128	NC_008339	AT	12	25131	25152	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432993
129	NC_008339	AT	8	25161	25176	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11432993
130	NC_008339	TTAT	3	25177	25188	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11432993
131	NC_008339	AT	13	25192	25216	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432993
132	NC_008339	TAAT	3	25271	25282	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432993
133	NC_008339	TA	6	25328	25340	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432993
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137	NC_008339	ATTTAT	3	25550	25567	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11432993
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238	NC_008339	ATAG	3	45802	45813	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
239	NC_008339	ATA	4	46572	46583	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
240	NC_008339	ATTT	4	46660	46675	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Tetrahymena pigmentosa mitochondrion