ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Tetrahymena pigmentosa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008339	TAT	4	456	467	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_008339	AAT	4	1235	1245	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_008339	ATT	5	1244	1257	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_008339	CAG	4	1448	1458	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_008339	TTA	4	2242	2253	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_008339	ATT	4	2888	2898	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_008339	AAT	4	5854	5864	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432990
8	NC_008339	TCT	4	7352	7363	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11432990
9	NC_008339	TTA	5	9104	9117	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432991
10	NC_008339	TAA	4	9296	9307	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432991
11	NC_008339	TAA	4	10545	10556	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432991
12	NC_008339	ATT	4	11399	11410	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11432991
13	NC_008339	ATA	4	11531	11542	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432991
14	NC_008339	ATA	7	11548	11569	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432991
15	NC_008339	ATT	4	12363	12374	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432991
16	NC_008339	TAA	5	12445	12459	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432991
17	NC_008339	TAA	4	12514	12524	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432991
18	NC_008339	TTA	4	12651	12661	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432991
19	NC_008339	ATA	4	12715	12725	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432991
20	NC_008339	ACC	4	12945	12956	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11432991
21	NC_008339	TTA	4	13627	13638	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432991
22	NC_008339	ATA	4	14042	14052	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432991
23	NC_008339	ATA	4	14669	14679	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432991
24	NC_008339	AAT	4	15954	15966	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432992
25	NC_008339	ATT	4	16130	16141	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432992
26	NC_008339	TAT	4	16161	16171	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432992
27	NC_008339	ATT	4	16360	16371	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432992
28	NC_008339	ATT	5	16522	16536	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432992
29	NC_008339	TAT	4	16732	16742	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432992
30	NC_008339	ATT	4	16954	16965	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11432992
31	NC_008339	ATT	7	17869	17889	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432992
32	NC_008339	ATT	4	18144	18154	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432992
33	NC_008339	TAT	5	18225	18240	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432992
34	NC_008339	TAT	4	19207	19218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432992
35	NC_008339	TAT	4	19933	19943	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432992
36	NC_008339	ATT	5	20135	20149	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432992
37	NC_008339	TAT	4	21303	21314	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
38	NC_008339	AAT	4	21888	21899	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432993
39	NC_008339	ATA	4	22032	22043	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432993
40	NC_008339	ATT	4	22529	22541	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432993
41	NC_008339	TAT	4	24254	24265	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
42	NC_008339	TAT	4	24388	24399	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
43	NC_008339	TAT	8	24404	24426	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
44	NC_008339	TTA	5	24660	24674	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432993
45	NC_008339	TAT	4	24742	24753	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
46	NC_008339	TAT	7	25067	25087	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432993
47	NC_008339	TAT	5	25096	25109	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432993
48	NC_008339	ATT	5	25424	25438	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432993
49	NC_008339	ATT	4	25487	25498	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
50	NC_008339	ATT	5	25509	25522	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432993
51	NC_008339	TAT	4	25657	25667	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432993
52	NC_008339	ATA	4	25885	25897	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432993
53	NC_008339	ATT	4	25964	25975	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
54	NC_008339	ATA	4	26486	26497	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_008339	AGA	5	26775	26788	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11432993
56	NC_008339	GTT	4	26958	26968	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11432993
57	NC_008339	ATT	4	28412	28423	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
58	NC_008339	TTA	4	28431	28442	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432993
59	NC_008339	TAC	4	30066	30076	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11432993
60	NC_008339	ATT	4	30152	30162	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432993
61	NC_008339	TAA	4	31249	31260	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432993
62	NC_008339	AAT	4	31283	31295	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432993
63	NC_008339	CAT	4	31836	31846	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11432993
64	NC_008339	ATA	5	32214	32227	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_008339	AGA	4	32708	32718	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_008339	ATT	4	33182	33193	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_008339	ATT	4	33972	33982	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432993
68	NC_008339	ATT	4	34516	34526	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432993
69	NC_008339	TAA	5	34620	34634	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432993
70	NC_008339	ATT	4	35241	35251	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432993
71	NC_008339	TAA	4	35550	35561	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11432993
72	NC_008339	ATT	4	35888	35898	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432993
73	NC_008339	TAA	4	36303	36313	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432993
74	NC_008339	TAT	4	36689	36701	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432993
75	NC_008339	TGA	4	36768	36779	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11432993
76	NC_008339	TAT	5	37386	37401	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432993
77	NC_008339	ATT	4	37402	37412	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432993
78	NC_008339	ATT	5	37495	37509	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432993
79	NC_008339	ATT	5	37653	37667	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432994
80	NC_008339	TAT	4	39084	39095	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432994
81	NC_008339	CTG	4	39195	39206	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11432994
82	NC_008339	ATT	4	39226	39236	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432994
83	NC_008339	TAC	4	39496	39507	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11432994
84	NC_008339	GTA	4	39911	39921	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11432994
85	NC_008339	GCT	4	39964	39975	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11432994
86	NC_008339	ATA	4	40894	40905	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432994
87	NC_008339	ATA	4	43641	43653	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432994
88	NC_008339	TAA	4	43855	43866	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432994
89	NC_008339	TTA	4	44773	44784	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_008339	ATT	4	45791	45801	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_008339	ATA	4	46572	46583	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Tetrahymena pigmentosa mitochondrion