ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Tetrahymena paravorax mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008338	ATA	5	199	213	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_008338	ATT	4	500	511	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008338	AAT	4	533	544	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_008338	CAG	4	1900	1910	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
5	NC_008338	TAT	7	2601	2621	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_008338	TAT	4	2717	2729	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_008338	TAT	4	2880	2890	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_008338	ATT	5	3605	3618	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432985
9	NC_008338	ATA	5	6455	6470	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432986
10	NC_008338	ATT	5	9319	9333	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432986
11	NC_008338	CAC	4	10156	10167	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11432986
12	NC_008338	ATA	5	10667	10680	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432986
13	NC_008338	ATT	4	11745	11756	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11432986
14	NC_008338	AAT	4	11906	11916	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432986
15	NC_008338	ATA	6	12676	12692	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11432987
16	NC_008338	TAA	4	12704	12715	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432987
17	NC_008338	ATT	4	12999	13009	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432987
18	NC_008338	ACC	4	13290	13301	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11432987
19	NC_008338	TTA	4	13759	13770	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11432987
20	NC_008338	TAA	4	14403	14413	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432987
21	NC_008338	TAT	4	14554	14564	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432987
22	NC_008338	ATT	4	15690	15701	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432987
23	NC_008338	TAA	4	15708	15720	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432987
24	NC_008338	TAT	4	16025	16035	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432987
25	NC_008338	ATA	4	16479	16491	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432987
26	NC_008338	TAT	4	16708	16719	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432987
27	NC_008338	TAT	4	17287	17297	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432987
28	NC_008338	ATA	7	18833	18853	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432988
29	NC_008338	TAT	4	18918	18930	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432988
30	NC_008338	AAT	4	19390	19402	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432988
31	NC_008338	AAT	4	19498	19509	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432988
32	NC_008338	TAA	7	19704	19723	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	11432988
33	NC_008338	ATA	4	21437	21448	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432988
34	NC_008338	ATA	5	21910	21923	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432988
35	NC_008338	AAT	5	22270	22284	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432988
36	NC_008338	TAT	4	22867	22877	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432988
37	NC_008338	AAT	4	23530	23541	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432988
38	NC_008338	ATA	4	24591	24602	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432988
39	NC_008338	ATT	4	24896	24907	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
40	NC_008338	TAT	4	25246	25257	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
41	NC_008338	AAT	4	25319	25331	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432988
42	NC_008338	TAT	5	25415	25429	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432988
43	NC_008338	ATA	5	25495	25509	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432988
44	NC_008338	TTA	4	25540	25550	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432988
45	NC_008338	ATT	4	25634	25645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
46	NC_008338	ATT	4	25670	25680	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432988
47	NC_008338	TAT	5	25729	25744	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432988
48	NC_008338	AGA	5	27231	27244	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11432988
49	NC_008338	AAT	4	27996	28007	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432988
50	NC_008338	TAA	4	28384	28395	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432988
51	NC_008338	ATT	4	28513	28524	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
52	NC_008338	AAT	4	28526	28537	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11432988
53	NC_008338	ATT	4	28778	28789	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
54	NC_008338	TTA	4	28853	28864	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
55	NC_008338	TTA	4	30382	30393	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
56	NC_008338	ATA	7	31371	31391	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	11432989
57	NC_008338	ATA	4	31455	31466	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432989
58	NC_008338	ATA	5	31515	31529	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432989
59	NC_008338	TAA	4	31699	31710	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432989
60	NC_008338	ATT	4	34341	34351	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432989
61	NC_008338	TAT	5	34447	34461	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432989
62	NC_008338	AAT	4	34526	34536	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432989
63	NC_008338	TAA	4	34843	34854	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432989
64	NC_008338	TAA	4	35074	35085	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432989
65	NC_008338	TTA	5	35083	35097	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432989
66	NC_008338	TAT	4	35236	35246	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432989
67	NC_008338	ATT	4	36051	36061	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432989
68	NC_008338	ATA	4	36351	36362	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432989
69	NC_008338	TAA	5	36496	36509	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432989
70	NC_008338	TAT	5	36953	36968	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432989
71	NC_008338	TAT	5	37023	37038	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432989
72	NC_008338	TAT	4	37764	37775	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432989
73	NC_008338	TAT	4	39588	39599	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432989
74	NC_008338	ATT	4	39689	39699	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432989
75	NC_008338	GCA	4	40315	40326	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11432989
76	NC_008338	TTA	4	40802	40813	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432989
77	NC_008338	TAT	4	41083	41095	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432989
78	NC_008338	TAT	4	41479	41490	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432989
79	NC_008338	ATT	4	42964	42975	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432990
80	NC_008338	ATA	5	44909	44922	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_008338	ATA	4	45068	45080	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_008338	ATA	7	45176	45196	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_008338	ATT	4	47323	47333	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Tetrahymena paravorax mitochondrion