ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Tetrahymena malaccensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008337	AAT	7	1228	1247	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
2	NC_008337	CAG	4	1443	1453	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_008337	CT	6	1657	1667	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_008337	ATATAA	3	1792	1808	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_008337	TA	7	1857	1869	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_008337	ATTT	3	2060	2072	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_008337	ATT	4	2884	2894	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_008337	AATT	3	2953	2963	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_008337	TATAAA	3	3082	3100	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	11432981
10	NC_008337	T	14	3397	3410	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11432981
11	NC_008337	ATA	4	3861	3871	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432981
12	NC_008337	TAAAA	3	3883	3896	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11432981
13	NC_008337	TAA	4	3922	3933	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432981
14	NC_008337	TAA	4	4808	4818	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_008337	AATT	3	4991	5002	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432981
16	NC_008337	TTTA	3	5190	5200	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432981
17	NC_008337	T	23	5246	5268	23	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	11432981
18	NC_008337	TAAA	3	5355	5366	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432981
19	NC_008337	TAAAT	3	5649	5662	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	11432981
20	NC_008337	AAAT	3	5841	5851	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11432981
21	NC_008337	TTTTA	4	5853	5871	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	11432981
22	NC_008337	ATATTT	3	5910	5927	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11432981
23	NC_008337	A	13	6081	6093	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11432981
24	NC_008337	ATTT	3	6134	6145	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11432981
25	NC_008337	AAT	4	6204	6215	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432981
26	NC_008337	T	16	6231	6246	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11432981
27	NC_008337	T	14	6269	6282	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11432981
28	NC_008337	T	16	6431	6446	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	11432981
29	NC_008337	A	12	6795	6806	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11432981
30	NC_008337	ATTTAT	3	7054	7071	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11432981
31	NC_008337	AAT	4	7174	7185	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432981
32	NC_008337	TAA	4	7347	7357	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432981
33	NC_008337	A	12	7392	7403	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	11432981
34	NC_008337	T	17	7712	7728	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	11432981
35	NC_008337	ATTT	4	7804	7819	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11432981
36	NC_008337	AATT	3	8379	8390	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432981
37	NC_008337	A	12	8498	8509	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11432981
38	NC_008337	TTAT	3	8721	8732	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11432981
39	NC_008337	T	15	9032	9046	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	11432981
40	NC_008337	TTAAA	3	9065	9079	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	11432981
41	NC_008337	TTTAAA	3	9589	9606	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11432982
42	NC_008337	CTC	4	9751	9762	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	11432982
43	NC_008337	TAA	4	10510	10520	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432982
44	NC_008337	ATT	4	11364	11375	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432982
45	NC_008337	ATA	4	11496	11506	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432982
46	NC_008337	TTTA	3	11584	11596	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11432982
47	NC_008337	AT	6	11968	11979	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432982
48	NC_008337	AAAAAT	3	11980	11997	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	11432982
49	NC_008337	TAA	4	12483	12493	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432982
50	NC_008337	A	14	12519	12532	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11432982
51	NC_008337	ACC	4	12914	12925	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11432982
52	NC_008337	ATAA	3	13102	13113	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432982
53	NC_008337	T	12	13208	13219	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11432982
54	NC_008337	TTTAT	3	13400	13414	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11432982
55	NC_008337	AATT	3	13751	13761	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432982
56	NC_008337	ATAA	5	13918	13938	21	75 %	25 %	0 %	0 %	4 %	11432982
57	NC_008337	ATA	4	14064	14075	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432982
58	NC_008337	TTA	4	14112	14122	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432982
59	NC_008337	TTTAA	3	14132	14145	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	11432982
60	NC_008337	TAT	4	14361	14372	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432982
61	NC_008337	ATATA	3	14475	14489	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_008337	AT	6	14978	14989	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432983
63	NC_008337	TA	7	15226	15239	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432983
64	NC_008337	TATTTA	3	15453	15470	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11432983
65	NC_008337	TCAAT	3	15495	15508	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	11432983
66	NC_008337	TAAA	3	15977	15988	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	11432983
67	NC_008337	TAAA	3	16012	16022	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11432983
68	NC_008337	TAAA	5	16132	16150	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	11432983
69	NC_008337	AAAT	3	16237	16248	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432983
70	NC_008337	ACAA	3	16252	16262	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11432983
71	NC_008337	TAAT	3	16514	16525	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432983
72	NC_008337	AAATA	4	16567	16587	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	11432983
73	NC_008337	TAAA	3	16814	16825	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432983
74	NC_008337	AT	6	17113	17125	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432983
75	NC_008337	ATTT	3	17236	17246	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432983
76	NC_008337	GTT	4	17371	17381	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11432983
77	NC_008337	TTTAT	3	17480	17493	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11432983
78	NC_008337	AAAT	4	17577	17592	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	11432983
79	NC_008337	ATAAAT	3	18172	18189	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11432983
80	NC_008337	AT	6	18570	18583	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432983
81	NC_008337	ATA	4	18612	18624	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432983
82	NC_008337	AAAATT	3	18734	18752	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	11432983
83	NC_008337	AAAATT	3	18942	18960	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	11432983
84	NC_008337	TAAA	3	19012	19023	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432983
85	NC_008337	TAAA	3	19026	19036	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11432983
86	NC_008337	A	12	19250	19261	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11432983
87	NC_008337	AATA	3	19272	19283	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432983
88	NC_008337	AAAAAT	3	19372	19390	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	11432983
89	NC_008337	TAAA	3	19422	19432	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11432983
90	NC_008337	TAAAA	3	19517	19531	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	11432983
91	NC_008337	T	14	19683	19696	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11432983
92	NC_008337	AAAT	3	19770	19781	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432983
93	NC_008337	TAA	4	19845	19857	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432983
94	NC_008337	ATT	4	20089	20103	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432983
95	NC_008337	TAAA	3	20131	20143	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11432983
96	NC_008337	ATGT	3	20284	20294	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11432983
97	NC_008337	TA	7	20446	20458	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432983
98	NC_008337	AAATTA	3	20506	20523	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11432983
99	NC_008337	TGTT	3	20700	20711	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11432983
100	NC_008337	TAA	4	21043	21053	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432983
101	NC_008337	TAT	5	21276	21289	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432983
102	NC_008337	TTA	4	21513	21524	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432983
103	NC_008337	TAT	4	21576	21587	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432984
104	NC_008337	AAT	5	21868	21882	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432984
105	NC_008337	AAT	4	21888	21899	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
106	NC_008337	TAT	7	22194	22214	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432984
107	NC_008337	AAT	5	22495	22509	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432984
108	NC_008337	AAT	4	22515	22526	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
109	NC_008337	AAT	4	23198	23209	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
110	NC_008337	AAATA	3	23969	23982	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11432984
111	NC_008337	TA	8	24359	24373	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11432984
112	NC_008337	ATTT	3	24759	24769	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432984
113	NC_008337	TATTTT	4	24852	24875	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
114	NC_008337	ATTTT	3	24944	24958	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11432984
115	NC_008337	TTAT	3	24964	24974	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432984
116	NC_008337	AATT	3	25098	25109	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432984
117	NC_008337	TTTA	3	25431	25443	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11432984
118	NC_008337	ATT	7	25563	25583	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432984
119	NC_008337	TA	6	25593	25603	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432984
120	NC_008337	TAT	5	25679	25693	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432984
121	NC_008337	TATTAA	3	25712	25729	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11432984
122	NC_008337	ATA	5	25832	25846	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432984
123	NC_008337	TTA	4	25904	25915	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432984
124	NC_008337	TTA	4	26024	26035	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432984
125	NC_008337	TAT	4	26076	26087	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432984
126	NC_008337	TTTA	3	26433	26443	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432984
127	NC_008337	TTTA	3	26664	26674	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432984
128	NC_008337	AATA	3	26904	26915	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_008337	AGA	5	27403	27416	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11432984
130	NC_008337	AAT	4	27912	27923	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
131	NC_008337	TTTTA	3	28122	28136	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	11432984
132	NC_008337	TATT	3	28490	28501	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11432984
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199	NC_008337	ATTAT	4	46370	46388	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Tetrahymena malaccensis mitochondrion