ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Tetrahymena malaccensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008337	AAT	7	1228	1247	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
2	NC_008337	CAG	4	1443	1453	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_008337	ATT	4	2884	2894	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_008337	ATA	4	3861	3871	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432981
5	NC_008337	TAA	4	3922	3933	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432981
6	NC_008337	TAA	4	4808	4818	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_008337	AAT	4	6204	6215	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432981
8	NC_008337	AAT	4	7174	7185	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432981
9	NC_008337	TAA	4	7347	7357	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432981
10	NC_008337	CTC	4	9751	9762	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	11432982
11	NC_008337	TAA	4	10510	10520	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432982
12	NC_008337	ATT	4	11364	11375	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432982
13	NC_008337	ATA	4	11496	11506	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432982
14	NC_008337	TAA	4	12483	12493	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432982
15	NC_008337	ACC	4	12914	12925	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11432982
16	NC_008337	ATA	4	14064	14075	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432982
17	NC_008337	TTA	4	14112	14122	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432982
18	NC_008337	TAT	4	14361	14372	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432982
19	NC_008337	GTT	4	17371	17381	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11432983
20	NC_008337	ATA	4	18612	18624	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432983
21	NC_008337	TAA	4	19845	19857	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432983
22	NC_008337	ATT	4	20089	20103	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432983
23	NC_008337	TAA	4	21043	21053	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432983
24	NC_008337	TAT	5	21276	21289	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432983
25	NC_008337	TTA	4	21513	21524	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432983
26	NC_008337	TAT	4	21576	21587	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432984
27	NC_008337	AAT	5	21868	21882	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432984
28	NC_008337	AAT	4	21888	21899	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
29	NC_008337	TAT	7	22194	22214	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432984
30	NC_008337	AAT	5	22495	22509	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432984
31	NC_008337	AAT	4	22515	22526	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
32	NC_008337	AAT	4	23198	23209	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
33	NC_008337	ATT	7	25563	25583	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432984
34	NC_008337	TAT	5	25679	25693	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432984
35	NC_008337	ATA	5	25832	25846	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432984
36	NC_008337	TTA	4	25904	25915	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432984
37	NC_008337	TTA	4	26024	26035	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432984
38	NC_008337	TAT	4	26076	26087	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432984
39	NC_008337	AGA	5	27403	27416	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11432984
40	NC_008337	AAT	4	27912	27923	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
41	NC_008337	ATT	4	29171	29185	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432984
42	NC_008337	TTA	4	30558	30569	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432984
43	NC_008337	TAA	4	31879	31890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
44	NC_008337	ATT	4	34561	34572	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432984
45	NC_008337	ATT	4	34671	34681	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432984
46	NC_008337	ATA	4	34737	34748	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
47	NC_008337	TAA	4	35008	35018	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432984
48	NC_008337	TAA	4	35365	35376	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
49	NC_008337	CAA	4	36459	36469	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	11432984
50	NC_008337	TAA	4	36760	36771	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432984
51	NC_008337	TAT	4	37281	37292	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432984
52	NC_008337	TGA	4	37363	37374	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11432984
53	NC_008337	TAT	4	37561	37573	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432984
54	NC_008337	TAT	5	38095	38109	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432984
55	NC_008337	TAT	4	39698	39709	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432985
56	NC_008337	ATT	4	39945	39955	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432985
57	NC_008337	TAT	4	41348	41360	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432985
58	NC_008337	TAT	4	41477	41487	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432985
59	NC_008337	TAT	4	41734	41744	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432985
60	NC_008337	TTA	5	41749	41763	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432985
61	NC_008337	TAT	4	43425	43435	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432985
62	NC_008337	TAA	4	44223	44235	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432985

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Tetrahymena malaccensis mitochondrion