Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Nandina domestica chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008336GCA5106710811533.33 %0 %33.33 %33.33 %6 %114329948
2NC_008336GAA4211121221266.67 %0 %33.33 %0 %8 %114329949
3NC_008336TAA413427134371166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
4NC_008336GTT42325323264120 %66.67 %33.33 %0 %8 %114329959
5NC_008336ATT428445284561233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_008336TTA432294323051233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_008336ATT532313323271533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_008336ATG439660396701133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %114329967
9NC_008336ACC441236412471233.33 %0 %0 %66.67 %8 %114329968
10NC_008336GCA441558415691233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %114329968
11NC_008336ATA443238432501366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
12NC_008336GTA445428454381133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
13NC_008336TAA445933459431166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_008336CAA454433544441266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
15NC_008336TAT460947609571133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
16NC_008336ATT464530645401133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
17NC_008336TAT464683646931133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
18NC_008336CTA466760667711233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
19NC_008336ATT566964669781533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
20NC_008336TTA468845688561233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_008336ATA569243692561466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_008336AAG471690717011266.67 %0 %33.33 %0 %8 %114329992
23NC_008336TCC47327573285110 %33.33 %0 %66.67 %9 %114329992
24NC_008336GGA481345813561233.33 %0 %66.67 %0 %8 %114329992
25NC_008336TTA483470834811233.33 %66.67 %0 %0 %8 %114329992
26NC_008336CTT48565785668120 %66.67 %0 %33.33 %8 %114329992
27NC_008336CTC48643186442120 %33.33 %0 %66.67 %8 %114329992
28NC_008336GAT490520905311233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %114329992
29NC_008336TGA492256922671233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %114329992
30NC_008336ATT41125321125441333.33 %66.67 %0 %0 %7 %114329993
31NC_008336TAA41129551129661266.67 %33.33 %0 %0 %8 %114329993
32NC_008336TAT41131231131341233.33 %66.67 %0 %0 %8 %114329993
33NC_008336AAG41131801131911266.67 %0 %33.33 %0 %8 %114329993
34NC_008336ATA41140271140371166.67 %33.33 %0 %0 %9 %114329993
35NC_008336ATT41141801141911233.33 %66.67 %0 %0 %8 %114329993
36NC_008336TTA41156101156201133.33 %66.67 %0 %0 %9 %114329993
37NC_008336ATT51175661175791433.33 %66.67 %0 %0 %7 %114329993
38NC_008336TAT51209681209831633.33 %66.67 %0 %0 %6 %114329993
39NC_008336TAA41255341255451266.67 %33.33 %0 %0 %0 %114329993
40NC_008336ATT41265431265551333.33 %66.67 %0 %0 %7 %114329993
41NC_008336AAG41278151278261266.67 %0 %33.33 %0 %8 %114329993
42NC_008336ATT81279441279672433.33 %66.67 %0 %0 %8 %114329993
43NC_008336CTT4128203128214120 %66.67 %0 %33.33 %8 %114329993
44NC_008336TCT4129220129231120 %66.67 %0 %33.33 %8 %114329993
45NC_008336GTA41295111295221233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %114329993
46NC_008336GTA41295471295581233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %114329993
47NC_008336GTA41295651295761233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %114329993
48NC_008336GTA41295831295941233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %114329993
49NC_008336AGT41296031296141233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %114329993
50NC_008336TCT4148366148377120 %66.67 %0 %33.33 %8 %114330032
51NC_008336ATC41515421515531233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %114330032
52NC_008336ATC41545711545811133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
53NC_008336GAA51564041564181566.67 %0 %33.33 %0 %6 %114330034