ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Platanus occidentalis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008335TGAAA3213121441460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
2NC_008335GGATG3326132741420 %20 %60 %0 %7 %114329727
3NC_008335TCTCT357675780140 %60 %0 %40 %7 %114329728
4NC_008335AGTGT330396304111620 %40 %40 %0 %6 %Non-Coding
5NC_008335ATAGA434493345111960 %20 %20 %0 %5 %Non-Coding
6NC_008335ATTAG335088351031640 %40 %20 %0 %6 %Non-Coding
7NC_008335AAAAT336466364801580 %20 %0 %0 %0 %Non-Coding
8NC_008335TATAA336523365361460 %40 %0 %0 %7 %Non-Coding
9NC_008335TATTT339898399121520 %80 %0 %0 %0 %Non-Coding
10NC_008335GTAAT340835408481440 %40 %20 %0 %7 %Non-Coding
11NC_008335TTCCT34622146234140 %60 %0 %40 %7 %Non-Coding
12NC_008335AATTA358189582041660 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
13NC_008335TAATA463715637331960 %40 %0 %0 %5 %Non-Coding
14NC_008335TGAAA367546675601560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
15NC_008335AAAAG370756707701580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
16NC_008335TTATT478526785462120 %80 %0 %0 %9 %114329770
17NC_008335ATTTT390618906321520 %80 %0 %0 %6 %114329770
18NC_008335TCCGG3102164102178150 %20 %40 %40 %6 %114329770
19NC_008335TTTCG3104767104780140 %60 %20 %20 %7 %114329770
20NC_008335TAAAA31282551282691580 %20 %0 %0 %6 %114329771
21NC_008335ATTTT31323091323231520 %80 %0 %0 %6 %114329771
22NC_008335TCTTT3134077134091150 %80 %0 %20 %6 %114329771
23NC_008335ACCGG31517631517771520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
24NC_008335AAAAG31617311617451580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding