Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Citrus sinensis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008334TAA42682781166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
2NC_008334ATT7174317662433.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
3NC_008334ATA4183118421266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_008334ATA410764107741166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_008334ATT510785107991533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
6NC_008334ATT410812108221133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
7NC_008334AAC412263122741266.67 %0 %0 %33.33 %8 %114329641
8NC_008334ATT513432134471633.33 %66.67 %0 %0 %6 %114329642
9NC_008334TTA414097141081233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_008334TAA414734147451266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_008334TTC42391823928110 %66.67 %0 %33.33 %9 %114329647
12NC_008334GTT42486424875120 %66.67 %33.33 %0 %8 %114329647
13NC_008334TAG429613296241233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
14NC_008334TAA429851298621266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_008334TTA429889299001233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_008334TAA430762307731266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
17NC_008334TCT43224032250110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
18NC_008334AGA432452324621166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
19NC_008334ATA533778337921566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
20NC_008334CTT53810338117150 %66.67 %0 %33.33 %6 %193735607
21NC_008334TAT439325393351133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
22NC_008334ATA439357393681266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_008334ATG442011420211133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %114329655
24NC_008334TCT44522045231120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
25NC_008334CAA453949539591166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
26NC_008334ATT654513545311933.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
27NC_008334ATT454791548021233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
28NC_008334ATA457863578731166.67 %33.33 %0 %0 %9 %114329663
29NC_008334TAA462631626431366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
30NC_008334CTG47066470674110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
31NC_008334ATA570891709041466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
32NC_008334TTC47373973750120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
33NC_008334TAT583939839521433.33 %66.67 %0 %0 %7 %114329702
34NC_008334CTT48615986170120 %66.67 %0 %33.33 %8 %114329702
35NC_008334TAA487759877711366.67 %33.33 %0 %0 %7 %114329702
36NC_008334GAT488911889211133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %114329702
37NC_008334GAT490311903211133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %114329702
38NC_008334CTT49183991849110 %66.67 %0 %33.33 %9 %114329702
39NC_008334AAG497941979521266.67 %0 %33.33 %0 %0 %114329702
40NC_008334TTC4103314103325120 %66.67 %0 %33.33 %8 %114329716
41NC_008334GAA51138011138151566.67 %0 %33.33 %0 %6 %114329716
42NC_008334TAT41154351154471333.33 %66.67 %0 %0 %7 %114329716
43NC_008334ACA41187531187641266.67 %0 %0 %33.33 %8 %114329716
44NC_008334CTT4120252120263120 %66.67 %0 %33.33 %8 %114329716
45NC_008334AAT51228641228781566.67 %33.33 %0 %0 %6 %114329716
46NC_008334TCT4125620125632130 %66.67 %0 %33.33 %7 %114329716
47NC_008334TAA41284221284331266.67 %33.33 %0 %0 %8 %114329716
48NC_008334GCC4128920128931120 %0 %33.33 %66.67 %8 %114329716
49NC_008334TTC6134055134073190 %66.67 %0 %33.33 %10 %114329716
50NC_008334GAA41445491445601266.67 %0 %33.33 %0 %8 %114329716
51NC_008334CTA41487411487511133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %114329718
52NC_008334CTT4149922149933120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
53NC_008334ACC41530431530531133.33 %0 %0 %66.67 %9 %114329720
54NC_008334GAA41560241560341166.67 %0 %33.33 %0 %9 %114329720
55NC_008334ATC41575531575631133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
56NC_008334ATC41589531589631133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %114329722