ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Zea luxurians mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008333	AG	7	104	116	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_008333	AT	6	27381	27391	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_008333	GA	6	31276	31286	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_008333	CT	6	41548	41558	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
5	NC_008333	AG	6	42503	42514	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_008333	AT	6	54790	54800	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_008333	GA	7	64472	64485	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11415160
8	NC_008333	AG	6	66549	66559	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415160
9	NC_008333	AT	6	82340	82350	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415160
10	NC_008333	AG	8	82465	82479	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	11415160
11	NC_008333	AG	6	96060	96070	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415160
12	NC_008333	TA	9	102310	102326	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11415160
13	NC_008333	CA	6	107996	108006	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	11415160
14	NC_008333	AG	6	109880	109891	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415160
15	NC_008333	GA	6	116298	116308	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415160
16	NC_008333	TC	6	116363	116373	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415160
17	NC_008333	GA	6	120593	120603	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415160
18	NC_008333	CT	7	120705	120718	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11415160
19	NC_008333	CT	7	123924	123936	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11415160
20	NC_008333	CT	6	129082	129092	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415160
21	NC_008333	AG	6	133551	133562	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415160
22	NC_008333	AT	8	134748	134762	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11415160
23	NC_008333	GA	6	136001	136011	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415160
24	NC_008333	GA	6	159267	159277	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415160
25	NC_008333	TA	6	171035	171046	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415160
26	NC_008333	GA	6	179254	179265	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415160
27	NC_008333	GA	6	184977	184987	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415160
28	NC_008333	AG	6	187301	187311	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415160
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30	NC_008333	TA	7	208241	208253	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415160
31	NC_008333	AG	6	212328	212338	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415160
32	NC_008333	TA	6	224195	224205	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415160
33	NC_008333	GA	6	237891	237902	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415160
34	NC_008333	TA	6	247535	247546	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415160
35	NC_008333	TA	6	254091	254103	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415160
36	NC_008333	GA	6	263539	263549	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415160
37	NC_008333	GA	6	264926	264936	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415160
38	NC_008333	TA	6	266040	266051	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415160
39	NC_008333	AG	6	267662	267673	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415160
40	NC_008333	GA	6	282556	282567	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415160
41	NC_008333	AG	6	285119	285129	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415160
42	NC_008333	TA	6	294356	294366	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415160
43	NC_008333	CT	6	298441	298451	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415160
44	NC_008333	AT	7	304685	304698	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415160
45	NC_008333	GA	6	308518	308529	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415160
46	NC_008333	AG	7	318880	318892	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11415160
47	NC_008333	GA	6	324966	324978	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11415160
48	NC_008333	AG	6	328205	328215	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_008333	TC	6	334871	334881	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
50	NC_008333	GA	6	354708	354718	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_008333	TC	6	360847	360858	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
52	NC_008333	TA	7	367810	367823	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_008333	AG	6	369874	369884	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_008333	AT	6	383701	383711	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_008333	AT	6	383818	383828	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_008333	TA	6	389139	389149	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_008333	TA	7	393807	393820	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_008333	GA	6	399430	399442	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_008333	TA	6	403443	403454	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_008333	AT	6	409996	410006	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_008333	CT	7	411257	411269	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
62	NC_008333	AC	6	411665	411675	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_008333	GA	7	412987	413000	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_008333	CA	6	419937	419947	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_008333	GA	6	436935	436945	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_008333	TA	7	437928	437941	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_008333	CT	6	440253	440266	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
68	NC_008333	TC	6	445405	445415	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
69	NC_008333	AT	7	453537	453550	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_008333	AG	6	453947	453958	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_008333	TC	6	461202	461212	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
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80	NC_008333	TA	8	521247	521263	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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82	NC_008333	CT	6	527503	527513	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding

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Di-nucleotide Imperfect Repeats of Zea luxurians mitochondrion