ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Perfect Repeats of Zea mays subsp. parviglumis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Protein ID
1NC_008332CTCTA4449845172020 %40 %0 %40 %Non-Coding
2NC_008332AAATG4452045392060 %20 %20 %0 %Non-Coding
3NC_008332ATTTC3525752711520 %60 %0 %20 %Non-Coding
4NC_008332ACGAG3540054141540 %0 %40 %20 %Non-Coding
5NC_008332TGGAT318298183121520 %40 %40 %0 %Non-Coding
6NC_008332TAACA322791228051560 %20 %0 %20 %Non-Coding
7NC_008332TTAGT323465234791520 %60 %20 %0 %Non-Coding
8NC_008332TAAGT534131341552540 %40 %20 %0 %Non-Coding
9NC_008332TTTAG449483495022020 %60 %20 %0 %Non-Coding
10NC_008332TTCTA366015660291520 %60 %0 %20 %11415164
11NC_008332TCCTG37209772111150 %40 %20 %40 %11415164
12NC_008332TATAT777313773473540 %60 %0 %0 %11415164
13NC_008332ATCAA381052810661560 %20 %0 %20 %11415164
14NC_008332TTAGT390438904521520 %60 %20 %0 %11415164
15NC_008332CTCTA493396934152020 %40 %0 %40 %11415164
16NC_008332AAATG493418934372060 %20 %20 %0 %11415164
17NC_008332ATTTC394155941691520 %60 %0 %20 %11415164
18NC_008332ACGAG394298943121540 %0 %40 %20 %11415164
19NC_008332CCAAT31053361053501540 %20 %0 %40 %11415164
20NC_008332TGGAT31166461166601520 %40 %40 %0 %11415163
21NC_008332ACTTT31242911243051520 %60 %0 %20 %11415163
22NC_008332AATTC31429291429431540 %40 %0 %20 %11415163
23NC_008332TACTT31489401489541520 %60 %0 %20 %11415163
24NC_008332ATAGT31494681494821540 %40 %20 %0 %11415163
25NC_008332GTGCC3156076156090150 %20 %40 %40 %11415163
26NC_008332ACCTT41577201577392020 %40 %0 %40 %11415163
27NC_008332TCATA61706201706493040 %40 %0 %20 %11415163
28NC_008332CTACA31951841951981540 %20 %0 %40 %11415163
29NC_008332TTCTT3203630203644150 %80 %0 %20 %11415163
30NC_008332TTAAG32141522141661540 %40 %20 %0 %11415163
31NC_008332ATCTT52236702236942520 %60 %0 %20 %11415163
32NC_008332TACTA62301872302163040 %40 %0 %20 %11415163
33NC_008332ACTTT32468802468941520 %60 %0 %20 %11415163
34NC_008332GCAAA32707502707641560 %0 %20 %20 %11415163
35NC_008332CTATA32843562843701540 %40 %0 %20 %11415163
36NC_008332TAAGT32871192871331540 %40 %20 %0 %11415163
37NC_008332TGGAT32900452900591520 %40 %40 %0 %11415163
38NC_008332CTATA32908352908491540 %40 %0 %20 %11415163
39NC_008332TCAAA32972482972621560 %20 %0 %20 %11415163
40NC_008332CTTTA32981802981941520 %60 %0 %20 %11415163
41NC_008332CTATA32996802996941540 %40 %0 %20 %11415163
42NC_008332GAAAT33001563001701560 %20 %20 %0 %11415163
43NC_008332ACTAA33017173017311560 %20 %0 %20 %11415163
44NC_008332TACTA43024263024452040 %40 %0 %20 %11415163
45NC_008332TATAG33223163223301540 %40 %20 %0 %11415163
46NC_008332ACTAA33317913318051560 %20 %0 %20 %11415163
47NC_008332CTATA33327783327921540 %40 %0 %20 %11415163
48NC_008332GAAAG33396343396481560 %0 %40 %0 %11415163
49NC_008332TCTAT33600233600371520 %60 %0 %20 %11415163
50NC_008332TATAG43642663642852040 %40 %20 %0 %11415163
51NC_008332CCTGG3364997365011150 %20 %40 %40 %11415163
52NC_008332ATAGT43756853757042040 %40 %20 %0 %11415163
53NC_008332ATTCC33799423799561520 %40 %0 %40 %11415163
54NC_008332TATAG33950153950291540 %40 %20 %0 %11415163
55NC_008332GTAAA53960143960382560 %20 %20 %0 %11415163
56NC_008332CTCCA33995323995461520 %20 %0 %60 %11415163
57NC_008332TTAGT44051144051332020 %60 %20 %0 %11415163
58NC_008332ATAGT54051344051582540 %40 %20 %0 %11415163
59NC_008332ATAGG104073394073885040 %20 %40 %0 %11415163
60NC_008332TATAG54115054115292540 %40 %20 %0 %11415163
61NC_008332GTTAG34252444252581520 %40 %40 %0 %11415163
62NC_008332GTAAA34324604324741560 %20 %20 %0 %11415163
63NC_008332TCAAA34439014439151560 %20 %0 %20 %11415163
64NC_008332CTTTA34448334448471520 %60 %0 %20 %11415163
65NC_008332CTATA34463334463471540 %40 %0 %20 %11415163
66NC_008332GAAAT34468094468231560 %20 %20 %0 %11415163
67NC_008332ACTAA34483704483841560 %20 %0 %20 %11415163
68NC_008332TACTA44490794490982040 %40 %0 %20 %11415163
69NC_008332TATAG34689694689831540 %40 %20 %0 %11415163
70NC_008332ACTAA34784444784581560 %20 %0 %20 %11415163
71NC_008332CTATA34794314794451540 %40 %0 %20 %11415163
72NC_008332GAAAG34862874863011560 %0 %40 %0 %11415163
73NC_008332TTGAA34944574944711540 %40 %20 %0 %11415163
74NC_008332TCTAC35022505022641520 %40 %0 %40 %11415163
75NC_008332TAGTA45099985100172040 %40 %20 %0 %11415163
76NC_008332GCAGG45102045102232020 %0 %60 %20 %11415163
77NC_008332GGGAA85151915152304040 %0 %60 %0 %11415163
78NC_008332CTACG35196545196681520 %20 %20 %40 %11415163
79NC_008332TTTAC35310165310301520 %60 %0 %20 %11415163
80NC_008332CTAAC35382325382461540 %20 %0 %40 %11415163
81NC_008332TACTA55519595519832540 %40 %0 %20 %11415163
82NC_008332CCTAT105561025561515020 %40 %0 %40 %11415163
83NC_008332TACTA65583315583603040 %40 %0 %20 %11415163
84NC_008332AACTA35583615583751560 %20 %0 %20 %11415163
85NC_008332TGGAG35639445639581520 %20 %60 %0 %11415163
86NC_008332CTTTA55674515674752520 %60 %0 %20 %11415163
87NC_008332CTATA35684615684751540 %40 %0 %20 %11415163
88NC_008332ACTAT45804565804752040 %40 %0 %20 %11415163
89NC_008332TATAG35806015806151540 %40 %20 %0 %11415163
90NC_008332CCTTT3581989582003150 %60 %0 %40 %11415163
91NC_008332CTACA35916565916701540 %20 %0 %40 %11415163
92NC_008332TAATA36098966099101560 %40 %0 %0 %11415163
93NC_008332AAAGT36105406105541560 %20 %20 %0 %11415163
94NC_008332CGGGG3615292615306150 %0 %80 %20 %11415163
95NC_008332ATAGG56361946362182540 %20 %40 %0 %11415164
96NC_008332CGGCC3640243640257150 %0 %40 %60 %11415164
97NC_008332GATAT36528546528681540 %40 %20 %0 %11415164
98NC_008332ATACT36530936531071540 %40 %0 %20 %11415164
99NC_008332TACTA36563116563251540 %40 %0 %20 %11415164
100NC_008332TATGA36563616563751540 %40 %20 %0 %11415164
101NC_008332AAGTA46603236603422060 %20 %20 %0 %11415164