ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Zea mays subsp. parviglumis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008332	AG	7	104	116	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_008332	AG	7	2838	2850	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_008332	TC	8	10104	10118	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
4	NC_008332	TG	6	11981	11991	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_008332	GA	6	19277	19287	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_008332	GA	6	26843	26853	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_008332	CT	6	37272	37282	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_008332	AG	6	38233	38244	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_008332	CT	6	54941	54951	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415164
10	NC_008332	TC	6	57559	57570	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415164
11	NC_008332	TA	7	69048	69060	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415164
12	NC_008332	TC	6	73139	73150	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415164
13	NC_008332	AT	7	73550	73563	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415164
14	NC_008332	AG	7	91736	91748	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11415164
15	NC_008332	CT	6	102882	102893	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415164
16	NC_008332	CT	6	102904	102915	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415164
17	NC_008332	AT	7	104353	104366	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415164
18	NC_008332	TC	6	125957	125967	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415163
19	NC_008332	TC	6	131760	131771	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415163
20	NC_008332	TA	6	140026	140037	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415163
21	NC_008332	TG	8	140534	140549	16	0 %	50 %	50 %	0 %	6 %	11415163
22	NC_008332	GA	6	160153	160164	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415163
23	NC_008332	AT	7	164957	164971	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11415163
24	NC_008332	GA	6	167268	167279	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415163
25	NC_008332	GA	6	171896	171906	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
26	NC_008332	CT	7	172008	172021	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11415163
27	NC_008332	GA	7	186275	186288	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11415163
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29	NC_008332	AT	6	204337	204347	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415163
30	NC_008332	AG	8	204462	204476	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	11415163
31	NC_008332	AG	6	218133	218143	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
32	NC_008332	TA	11	224384	224406	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415163
33	NC_008332	TC	6	233362	233373	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415163
34	NC_008332	TA	6	234136	234146	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415163
35	NC_008332	TA	7	250978	250990	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415163
36	NC_008332	GA	6	262532	262542	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
37	NC_008332	GA	6	263923	263933	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
38	NC_008332	TA	6	265038	265049	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415163
39	NC_008332	TA	6	268534	268544	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415163
40	NC_008332	AT	6	268921	268932	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415163
41	NC_008332	GA	6	274295	274305	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
42	NC_008332	AT	7	274800	274812	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415163
43	NC_008332	TA	7	285179	285192	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415163
44	NC_008332	TA	7	285202	285215	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415163
45	NC_008332	AT	6	306172	306182	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415163
46	NC_008332	TG	7	306573	306585	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	11415163
47	NC_008332	CT	6	314574	314584	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415163
48	NC_008332	TC	6	316353	316363	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415163
49	NC_008332	AG	6	333828	333838	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
50	NC_008332	TC	6	347932	347943	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415163
51	NC_008332	AT	6	348724	348734	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415163
52	NC_008332	AC	6	351601	351612	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	11415163
53	NC_008332	CT	6	355409	355419	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415163
54	NC_008332	GA	6	361916	361926	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
55	NC_008332	AT	6	383255	383265	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415163
56	NC_008332	AT	6	383372	383382	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415163
57	NC_008332	AT	7	384931	384943	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415163
58	NC_008332	TA	6	388820	388830	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415163
59	NC_008332	TA	7	393542	393555	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415163
60	NC_008332	GA	6	399245	399257	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11415163
61	NC_008332	AG	7	407740	407753	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11415163
62	NC_008332	TA	7	410134	410147	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415163
63	NC_008332	TC	6	411139	411149	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415163
64	NC_008332	AG	6	425518	425528	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
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91	NC_008332	GA	6	621293	621303	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
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97	NC_008332	GA	6	675506	675516	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding

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