ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Perfect Repeats of Zea mays subsp. parviglumis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008332	GAATGG	3	27413	27430	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008332	TACTAG	3	110472	110489	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11415164
3	NC_008332	TCTTTA	3	111289	111306	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11415164
4	NC_008332	ACTTAG	3	121686	121703	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11415163
5	NC_008332	TATAGA	3	122578	122595	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11415163
6	NC_008332	AGTACT	3	129475	129492	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11415163
7	NC_008332	TATTAC	5	131158	131187	30	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	11415163
8	NC_008332	ATGGAA	3	131189	131206	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11415163
9	NC_008332	GTACTA	3	142373	142390	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11415163
10	NC_008332	TAGTAA	5	165075	165104	30	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11415163
11	NC_008332	ATGAGT	3	178510	178527	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415163
12	NC_008332	TTCTAT	3	217569	217586	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11415163
13	NC_008332	TCTTAT	5	222169	222198	30	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11415163
14	NC_008332	GTATTC	3	229940	229957	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11415163
15	NC_008332	ATAAGG	3	317620	317637	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11415163
16	NC_008332	CTCTCG	3	319760	319777	18	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	11415163
17	NC_008332	CAGATA	3	356673	356690	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11415163
18	NC_008332	TAGCTT	3	386183	386200	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11415163
19	NC_008332	TTCTGG	3	396364	396381	18	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	11415163
20	NC_008332	TTCCAT	3	411976	411993	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	11415163
21	NC_008332	ATGGCA	3	417117	417134	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	11415163
22	NC_008332	ACCATA	5	420635	420664	30	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	11415163
23	NC_008332	AAAGTA	3	432757	432774	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11415163
24	NC_008332	ATAAGG	3	464273	464290	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11415163
25	NC_008332	CTCTCG	3	466413	466430	18	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	11415163
26	NC_008332	CTTTAT	3	502975	502992	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11415163
27	NC_008332	TCCTTA	4	505633	505656	24	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	11415163
28	NC_008332	TATAGA	5	505984	506013	30	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11415163
29	NC_008332	CTATAA	3	515173	515190	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11415163
30	NC_008332	TTACTT	3	530715	530732	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11415163
31	NC_008332	TATGGT	5	542826	542855	30	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	11415163
32	NC_008332	TGCCAT	3	546356	546373	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	11415163
33	NC_008332	ATGGAA	3	551497	551514	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11415163
34	NC_008332	CCAGAA	3	567109	567126	18	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	11415163
35	NC_008332	AATCTA	3	580921	580938	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11415163
36	NC_008332	GAATGG	3	621863	621880	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	11415163
37	NC_008332	TAAGTG	3	636502	636519	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415164
38	NC_008332	GTGAAA	3	646978	646995	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11415164
39	NC_008332	TAGGGT	6	654984	655019	36	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	11415164
40	NC_008332	TTCCTT	3	659592	659609	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11415164

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Perfect Repeats of Zea mays subsp. parviglumis mitochondrion