ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Zea mays subsp. parviglumis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008332	AG	7	104	116	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_008332	AG	7	2838	2850	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_008332	AATG	3	3789	3801	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_008332	CTCTA	5	4498	4522	25	20 %	40 %	0 %	40 %	8 %	Non-Coding
5	NC_008332	TGAAA	4	4518	4542	25	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_008332	TGGT	3	4634	4645	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_008332	ATAG	3	4766	4776	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_008332	ATTTC	4	5257	5277	21	20 %	60 %	0 %	20 %	9 %	Non-Coding
9	NC_008332	ACGAG	3	5400	5414	15	40 %	0 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008332	AAAT	3	7218	7228	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_008332	GAT	5	8195	8209	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_008332	GCT	4	9530	9541	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_008332	AACC	3	9726	9737	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
14	NC_008332	TACAG	3	9943	9957	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
15	NC_008332	TC	8	10104	10118	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
16	NC_008332	AATA	3	11204	11215	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_008332	TG	6	11981	11991	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_008332	GAATA	3	12266	12279	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_008332	CCAT	3	13309	13319	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
20	NC_008332	TTA	4	13949	13960	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_008332	TAG	4	14306	14317	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_008332	ATCT	3	14455	14466	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
23	NC_008332	AAGA	3	15120	15131	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_008332	ACA	4	17006	17017	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_008332	TGGAT	3	18298	18312	15	20 %	40 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008332	GA	6	19277	19287	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_008332	ATCC	3	21001	21013	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
28	NC_008332	AATTG	3	21377	21390	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_008332	TTCT	3	21519	21529	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_008332	AAAG	3	21650	21661	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_008332	TAACA	3	22791	22805	15	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008332	TAGG	4	22965	22980	16	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_008332	TTAGT	4	23465	23484	20	20 %	60 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_008332	A	12	25031	25042	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008332	AATT	3	25125	25136	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_008332	GATT	3	26244	26255	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_008332	GA	6	26843	26853	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_008332	CTAT	3	27342	27354	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
39	NC_008332	GAATGG	4	27413	27436	24	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_008332	CAAC	3	28550	28560	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
41	NC_008332	TAAG	3	28997	29008	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008332	TGAA	3	30172	30184	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_008332	ATT	4	30813	30823	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_008332	TCTT	3	30928	30939	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008332	TATT	4	31139	31154	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_008332	CAAT	3	32600	32610	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
47	NC_008332	GAAA	3	33289	33299	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_008332	ATGA	3	33394	33405	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_008332	TCT	4	33604	33614	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
50	NC_008332	TAAGT	5	34131	34155	25	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008332	GAA	4	34867	34877	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_008332	AGGA	3	35259	35269	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_008332	CAAC	3	35352	35363	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
54	NC_008332	AGAA	3	36510	36521	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_008332	TAC	4	36744	36754	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_008332	GAAG	3	37196	37206	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_008332	CT	6	37272	37282	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
58	NC_008332	AG	6	38233	38244	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_008332	AGC	4	39104	39116	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
60	NC_008332	TTA	4	40129	40140	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_008332	AAG	4	41499	41509	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_008332	GACT	3	41657	41668	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008332	TCT	4	43945	43956	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_008332	TTAT	3	46127	46138	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11415163
65	NC_008332	CTTT	3	47777	47788	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_008332	TTTAG	5	49483	49507	25	20 %	60 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding
67	NC_008332	TCT	4	49715	49725	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
68	NC_008332	GAAA	4	53108	53123	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	11415164
69	NC_008332	AGA	4	53145	53157	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11415164
70	NC_008332	TCTT	3	53519	53529	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11415164
71	NC_008332	ACA	4	54279	54290	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	0 %	11415164
72	NC_008332	CT	6	54941	54951	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415164
73	NC_008332	GAA	4	55564	55574	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11415164
74	NC_008332	GAAG	3	55844	55854	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415164
75	NC_008332	TCT	5	56414	56428	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	11415164
76	NC_008332	TC	6	57559	57570	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415164
77	NC_008332	CTA	4	58436	58447	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11415164
78	NC_008332	CTG	4	59026	59037	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11415164
79	NC_008332	GTGA	3	59409	59419	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	11415164
80	NC_008332	TTC	4	60444	60456	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11415164
81	NC_008332	GAA	4	60636	60646	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11415164
82	NC_008332	ACT	4	62033	62045	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	11415164
83	NC_008332	GCAA	3	62101	62112	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	11415164
84	NC_008332	CTA	4	63330	63341	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11415164
85	NC_008332	TAC	4	63612	63622	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11415164
86	NC_008332	ACTT	3	64347	64358	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415164
87	NC_008332	CTGAC	3	65466	65479	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	11415164
88	NC_008332	TTCTA	3	66015	66029	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	11415164
89	NC_008332	CTTA	3	66095	66106	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	11415164
90	NC_008332	GCAA	3	66482	66493	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	11415164
91	NC_008332	CATTT	3	66635	66649	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	11415164
92	NC_008332	TA	7	69048	69060	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415164
93	NC_008332	ATT	4	69893	69904	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11415164
94	NC_008332	AAAT	3	70718	70729	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11415164
95	NC_008332	GGTA	3	70917	70929	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	11415164
96	NC_008332	TCCTG	3	72097	72111	15	0 %	40 %	20 %	40 %	0 %	11415164
97	NC_008332	TCTA	3	72457	72468	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415164
98	NC_008332	TC	6	73139	73150	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415164
99	NC_008332	AT	7	73550	73563	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415164
100	NC_008332	AAAT	3	74135	74145	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11415164
101	NC_008332	CAAG	3	75468	75478	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11415164
102	NC_008332	AAG	4	76201	76212	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11415164
103	NC_008332	TAGA	3	76538	76548	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11415164
104	NC_008332	AGACG	3	76760	76773	14	40 %	0 %	40 %	20 %	7 %	11415164
105	NC_008332	TATAT	9	77308	77351	44	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	11415164
106	NC_008332	ATT	5	78488	78502	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11415164
107	NC_008332	CTGA	3	78821	78831	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415164
108	NC_008332	TTCC	3	78921	78932	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415164
109	NC_008332	TCT	4	79958	79968	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11415164
110	NC_008332	ATGGA	3	80946	80960	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	11415164
111	NC_008332	ATCAA	3	81052	81066	15	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	11415164
112	NC_008332	TTGA	3	81775	81785	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11415164
113	NC_008332	TGT	4	81838	81849	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11415164
114	NC_008332	GCCA	3	84573	84583	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	11415164
115	NC_008332	AGA	5	87030	87043	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11415164
116	NC_008332	CAGT	3	89130	89141	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	11415164
117	NC_008332	CAG	4	89194	89205	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11415164
118	NC_008332	CTGT	3	89964	89975	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	11415164
119	NC_008332	TTAGT	3	90438	90452	15	20 %	60 %	20 %	0 %	0 %	11415164
120	NC_008332	AG	7	91736	91748	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11415164
121	NC_008332	AATG	3	92687	92699	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	11415164
122	NC_008332	CTCTA	5	93396	93420	25	20 %	40 %	0 %	40 %	8 %	11415164
123	NC_008332	TGAAA	4	93416	93440	25	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	11415164
124	NC_008332	TGGT	3	93532	93543	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	11415164
125	NC_008332	ATAG	3	93664	93674	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11415164
126	NC_008332	ATTTC	4	94155	94175	21	20 %	60 %	0 %	20 %	9 %	11415164
127	NC_008332	ACGAG	3	94298	94312	15	40 %	0 %	40 %	20 %	0 %	11415164
128	NC_008332	TGGC	4	96867	96882	16	0 %	25 %	50 %	25 %	6 %	11415164
129	NC_008332	AATT	3	97269	97280	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415164
130	NC_008332	CCA	4	99331	99342	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11415164
131	NC_008332	AAGTC	3	100771	100785	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	11415164
132	NC_008332	TTGAG	3	102055	102069	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	11415164
133	NC_008332	CT	6	102882	102893	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415164
134	NC_008332	CT	6	102904	102915	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415164
135	NC_008332	CGTAAA	3	102993	103011	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	11415164
136	NC_008332	GAA	4	103446	103457	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11415164
137	NC_008332	CAG	4	103638	103649	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11415164
138	NC_008332	CTT	4	104281	104291	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11415164
139	NC_008332	AT	7	104353	104366	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415164
140	NC_008332	AAAGAA	3	104754	104772	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	11415164
141	NC_008332	AAAGA	3	105185	105198	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	11415164
142	NC_008332	CAAT	5	105324	105345	22	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11415164
143	NC_008332	ATGG	3	105481	105493	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	11415164
144	NC_008332	CTTT	4	105594	105609	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	11415164
145	NC_008332	GCC	4	109338	109349	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	11415164
146	NC_008332	ATACTA	4	110465	110488	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	11415164
147	NC_008332	AAG	4	110607	110618	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	11415164
148	NC_008332	GATC	3	110711	110722	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	11415164
149	NC_008332	TCTTTA	3	111289	111306	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	0 %	11415164
150	NC_008332	GGAG	3	111697	111709	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	11415164
151	NC_008332	ATC	4	112003	112013	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11415164
152	NC_008332	AGGG	3	114468	114479	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	11415163
153	NC_008332	AGA	4	115911	115922	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11415163
154	NC_008332	TGGAT	3	116646	116660	15	20 %	40 %	40 %	0 %	0 %	11415163
155	NC_008332	AGA	4	117637	117649	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11415163
156	NC_008332	A	13	118162	118174	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11415163
157	NC_008332	TTTA	3	118815	118826	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11415163
158	NC_008332	ACC	4	119877	119889	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	11415163
159	NC_008332	CATT	3	120327	120337	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11415163
160	NC_008332	ACTTAG	4	121686	121708	23	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	8 %	11415163
161	NC_008332	TATAGA	3	122578	122595	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	0 %	11415163
162	NC_008332	ATCC	3	122630	122640	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	11415163
163	NC_008332	CTC	4	122772	122782	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	11415163
164	NC_008332	CCTT	3	122896	122908	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11415163
165	NC_008332	TCC	4	123071	123082	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	11415163
166	NC_008332	GGGAGA	3	123479	123497	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10 %	11415163
167	NC_008332	ACTTT	3	124291	124305	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	11415163
168	NC_008332	GAAA	3	124596	124607	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	11415163
169	NC_008332	CTTA	3	124684	124695	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415163
170	NC_008332	TC	6	125957	125967	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415163
171	NC_008332	AAG	4	127511	127521	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11415163
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174	NC_008332	AGCT	3	129645	129655	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415163
175	NC_008332	TCTAT	3	129863	129876	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	11415163
176	NC_008332	CTAT	6	130312	130334	23	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415163
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234	NC_008332	TAGTAA	7	165068	165109	42	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	9 %	11415163
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239	NC_008332	GTGG	3	168798	168809	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	11415163
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242	NC_008332	TTCT	3	171205	171217	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	11415163
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244	NC_008332	GTC	4	171481	171492	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415163
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246	NC_008332	CT	7	172008	172021	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11415163
247	NC_008332	CTTG	3	172927	172939	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	11415163
248	NC_008332	TCCA	3	174658	174670	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	11415163
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250	NC_008332	GAAA	3	177350	177361	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415163
251	NC_008332	AAGT	3	177741	177751	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11415163
252	NC_008332	ATGAGT	3	178510	178527	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	11415163
253	NC_008332	TCAA	3	178611	178622	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11415163
254	NC_008332	TTTC	3	179382	179392	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11415163
255	NC_008332	TCT	4	181205	181215	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11415163
256	NC_008332	CCTT	3	186053	186064	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415163
257	NC_008332	GA	7	186275	186288	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	11415163
258	NC_008332	GATC	3	186406	186417	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	11415163
259	NC_008332	CTTT	3	186546	186557	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415163
260	NC_008332	CGAA	3	186933	186943	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11415163
261	NC_008332	GGAT	3	186970	186984	15	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	11415163
262	NC_008332	CTTTT	3	187481	187495	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	11415163
263	NC_008332	TTCG	3	187626	187637	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	11415163
264	NC_008332	AG	6	188364	188374	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
265	NC_008332	TAAAG	4	188511	188530	20	60 %	20 %	20 %	0 %	10 %	11415163
266	NC_008332	TCTT	3	189662	189673	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415163
267	NC_008332	CTTG	3	189824	189834	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	11415163
268	NC_008332	AGGA	3	190112	190123	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415163
269	NC_008332	CTT	4	190946	190956	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11415163
270	NC_008332	CTCG	3	191399	191409	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	11415163
271	NC_008332	TCCA	3	192158	192169	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11415163
272	NC_008332	AGA	4	192237	192247	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11415163
273	NC_008332	CTT	4	192448	192459	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11415163
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275	NC_008332	CGT	4	195950	195960	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11415163
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277	NC_008332	TTA	4	197043	197053	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11415163
278	NC_008332	ATTG	3	197098	197110	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11415163
279	NC_008332	TAAG	3	197277	197288	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11415163
280	NC_008332	AAAG	3	197379	197390	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	11415163
281	NC_008332	AAGA	3	197794	197804	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415163
282	NC_008332	AGTA	3	199380	199391	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11415163
283	NC_008332	AAATG	3	199527	199541	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	11415163
284	NC_008332	CTT	4	199869	199880	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11415163
285	NC_008332	CTTT	3	200411	200421	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11415163
286	NC_008332	AATA	3	200877	200888	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11415163
287	NC_008332	GTA	4	201906	201916	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11415163
288	NC_008332	TGGA	4	202082	202097	16	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	11415163
289	NC_008332	TCTA	3	202098	202109	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415163
290	NC_008332	AGA	4	203146	203157	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11415163
291	NC_008332	TTCTT	3	203630	203644	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	11415163
292	NC_008332	CCTT	3	203806	203816	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415163
293	NC_008332	AT	6	204337	204347	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415163
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295	NC_008332	TGCGT	3	204855	204868	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	11415163
296	NC_008332	GAGC	3	207177	207188	12	25 %	0 %	50 %	25 %	0 %	11415163
297	NC_008332	AGAA	3	207976	207987	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415163
298	NC_008332	CAT	4	210399	210409	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11415163
299	NC_008332	AGT	4	211217	211229	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	11415163
300	NC_008332	TCT	4	211242	211253	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11415163
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303	NC_008332	TTAAG	3	214152	214166	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	11415163
304	NC_008332	CTT	4	214706	214718	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11415163
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307	NC_008332	TTCTAT	3	217569	217586	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	0 %	11415163
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312	NC_008332	GTC	4	219767	219778	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11415163
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314	NC_008332	AAAG	3	221840	221851	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	11415163
315	NC_008332	TCTTAT	5	222169	222198	30	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	0 %	11415163
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320	NC_008332	ACTT	3	226232	226243	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415163
321	NC_008332	AGAAA	3	227702	227715	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	11415163
322	NC_008332	ATTT	3	229184	229195	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11415163
323	NC_008332	GTATTC	4	229940	229963	24	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	4 %	11415163
324	NC_008332	CTA	4	230043	230054	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11415163
325	NC_008332	TACTA	7	230187	230222	36	40 %	40 %	0 %	20 %	8 %	11415163
326	NC_008332	CTT	4	230644	230654	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11415163
327	NC_008332	TGT	4	230809	230821	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	11415163
328	NC_008332	CAGTA	3	231104	231117	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	11415163
329	NC_008332	CAT	4	231606	231616	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11415163
330	NC_008332	GCC	4	232970	232980	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	11415163
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332	NC_008332	ACC	4	233680	233692	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	11415163
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334	NC_008332	CAG	4	234462	234473	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11415163
335	NC_008332	CTGAT	3	234640	234654	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	11415163
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337	NC_008332	GGGC	3	235378	235388	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	11415163
338	NC_008332	CAAA	3	235634	235645	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11415163
339	NC_008332	CTAGCC	3	235896	235912	17	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	5 %	11415163
340	NC_008332	TTG	4	236608	236618	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11415163
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342	NC_008332	G	12	238297	238308	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	11415163
343	NC_008332	GGCA	3	238842	238852	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	11415163
344	NC_008332	CATT	3	239535	239547	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	11415163
345	NC_008332	T	12	240132	240143	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11415163
346	NC_008332	CCCGTA	3	241517	241533	17	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	5 %	11415163
347	NC_008332	AGCG	3	241536	241546	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	11415163
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350	NC_008332	AGAA	3	243709	243720	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415163
351	NC_008332	CTC	4	244864	244874	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	11415163
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353	NC_008332	ACCC	3	246832	246842	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	11415163
354	NC_008332	ACTTT	3	246880	246894	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	11415163
355	NC_008332	TAG	4	246962	246972	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11415163
356	NC_008332	TA	7	250978	250990	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11415163
357	NC_008332	TCAG	3	251313	251324	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	11415163
358	NC_008332	GTTA	3	252036	252046	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11415163
359	NC_008332	ACTT	3	254590	254601	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415163
360	NC_008332	TAT	4	254879	254891	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11415163
361	NC_008332	CATT	3	255013	255024	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	11415163
362	NC_008332	TCGA	3	255199	255211	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	11415163
363	NC_008332	AAC	4	255770	255781	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11415163
364	NC_008332	GGTAA	3	255921	255936	16	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	11415163
365	NC_008332	GAA	4	257222	257233	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11415163
366	NC_008332	GAA	4	259059	259070	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11415163
367	NC_008332	CTT	4	261140	261150	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11415163
368	NC_008332	TAGT	3	261208	261218	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11415163
369	NC_008332	CTA	4	261291	261302	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11415163
370	NC_008332	GTA	4	261621	261632	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11415163
371	NC_008332	A	13	261793	261805	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11415163
372	NC_008332	AGTC	3	262309	262319	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415163
373	NC_008332	GA	6	262532	262542	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
374	NC_008332	AGA	4	262650	262662	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11415163
375	NC_008332	GA	6	263923	263933	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
376	NC_008332	TGAC	3	264362	264374	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	11415163
377	NC_008332	AGCC	3	264404	264414	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	11415163
378	NC_008332	AGC	4	264784	264795	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11415163
379	NC_008332	TA	6	265038	265049	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415163
380	NC_008332	TCACT	3	265190	265204	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	11415163
381	NC_008332	GGAA	3	265671	265681	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415163
382	NC_008332	AAAG	3	266539	266550	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415163
383	NC_008332	TCC	4	267238	267248	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	11415163
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385	NC_008332	GAA	4	267985	267996	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11415163
386	NC_008332	TCAA	3	268347	268357	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11415163
387	NC_008332	TA	6	268534	268544	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11415163
388	NC_008332	AT	6	268921	268932	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415163
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391	NC_008332	CCAGTA	3	271388	271405	18	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	11415163
392	NC_008332	CCTT	3	273078	273088	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415163
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485	NC_008332	CTATA	3	332778	332792	15	40 %	40 %	0 %	20 %	0 %	11415163
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489	NC_008332	AAAAC	3	333839	333853	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	11415163
490	NC_008332	TCT	4	334156	334167	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11415163
491	NC_008332	ACAT	3	334411	334422	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11415163
492	NC_008332	AACTT	3	335020	335034	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	11415163
493	NC_008332	TCT	4	335145	335155	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11415163
494	NC_008332	GGCAA	3	336804	336818	15	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	11415163
495	NC_008332	AGGCA	3	337105	337119	15	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	11415163
496	NC_008332	TACG	3	337247	337258	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	11415163
497	NC_008332	TCT	4	338069	338079	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11415163
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499	NC_008332	TAGA	3	339492	339504	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	11415163
500	NC_008332	GAAAG	3	339634	339648	15	60 %	0 %	40 %	0 %	0 %	11415163
501	NC_008332	AGAA	3	340362	340373	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415163
502	NC_008332	GTT	4	341908	341919	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11415163
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983	NC_008332	CATCT	3	634023	634036	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	11415164
984	NC_008332	ATC	4	634088	634098	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11415164
985	NC_008332	GAA	4	634172	634183	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11415164
986	NC_008332	AAT	4	634570	634582	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11415164
987	NC_008332	CTTTT	4	634944	634962	19	0 %	80 %	0 %	20 %	5 %	11415164
988	NC_008332	ATAGG	5	636194	636218	25	40 %	20 %	40 %	0 %	0 %	11415164
989	NC_008332	TCCT	3	636409	636421	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11415164
990	NC_008332	TAA	4	636431	636441	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11415164
991	NC_008332	TAAGTG	3	636502	636519	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	11415164
992	NC_008332	TTGC	3	636533	636544	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	11415164
993	NC_008332	TCAA	3	636985	636995	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11415164
994	NC_008332	CGAT	3	637196	637206	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415164
995	NC_008332	TAC	5	637957	637970	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	11415164
996	NC_008332	GTT	4	639016	639027	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11415164
997	NC_008332	TCGT	3	639456	639468	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	11415164
998	NC_008332	ATCCC	3	639683	639696	14	20 %	20 %	0 %	60 %	7 %	11415164
999	NC_008332	CGGCC	3	640243	640257	15	0 %	0 %	40 %	60 %	0 %	11415164
1000	NC_008332	AAGAAA	3	640624	640642	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	11415164
1001	NC_008332	AGA	4	641110	641121	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11415164
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1003	NC_008332	CTTG	3	642589	642600	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	11415164
1004	NC_008332	TAC	4	644756	644767	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	11415164
1005	NC_008332	ATG	4	646155	646166	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11415164
1006	NC_008332	GTGAAA	3	646978	646995	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11415164
1007	NC_008332	CAAA	3	647058	647068	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11415164
1008	NC_008332	TGC	4	647540	647550	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11415164
1009	NC_008332	CCATAG	3	651174	651190	17	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	11415164
1010	NC_008332	GAAGT	3	651653	651667	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	11415164
1011	NC_008332	GATAT	3	652854	652868	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	11415164
1012	NC_008332	ATACT	3	653093	653107	15	40 %	40 %	0 %	20 %	0 %	11415164
1013	NC_008332	CCTA	3	653461	653472	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11415164
1014	NC_008332	GAA	4	653620	653632	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11415164
1015	NC_008332	TAA	4	654021	654032	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11415164
1016	NC_008332	CTTAA	3	654052	654066	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	11415164
1017	NC_008332	TAGGGT	7	654984	655025	42	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	7 %	11415164
1018	NC_008332	TAA	5	655208	655222	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11415164
1019	NC_008332	GA	6	655353	655363	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415164
1020	NC_008332	TACTA	3	656311	656325	15	40 %	40 %	0 %	20 %	0 %	11415164
1021	NC_008332	TATGA	4	656357	656375	19	40 %	40 %	20 %	0 %	5 %	11415164
1022	NC_008332	CAG	4	657876	657886	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11415164
1023	NC_008332	ACC	4	657978	657989	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	0 %	11415164
1024	NC_008332	AAGA	5	658115	658135	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415164
1025	NC_008332	GAATA	3	658332	658347	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	11415164
1026	NC_008332	TTCCTT	4	659592	659615	24	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	4 %	11415164
1027	NC_008332	TGGT	3	659796	659807	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	11415164
1028	NC_008332	GCAT	3	659968	659978	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415164
1029	NC_008332	TCCT	3	659984	659995	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415164
1030	NC_008332	AAGTA	5	660323	660346	24	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	11415164
1031	NC_008332	AAAG	3	662345	662356	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415164
1032	NC_008332	AGAAA	3	662476	662489	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	11415164
1033	NC_008332	GCCC	3	664009	664020	12	0 %	0 %	25 %	75 %	0 %	11415164
1034	NC_008332	TGC	4	664415	664426	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11415164
1035	NC_008332	CTT	4	664735	664746	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
1036	NC_008332	AGGG	3	665183	665194	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
1037	NC_008332	CT	6	665301	665311	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415165
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1039	NC_008332	TTCT	4	666422	666438	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
1040	NC_008332	TCT	4	666630	666640	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
1041	NC_008332	TACG	3	666950	666961	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
1042	NC_008332	AGA	4	668011	668022	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
1043	NC_008332	CCGA	3	668593	668605	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
1044	NC_008332	AGT	4	671067	671078	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
1045	NC_008332	CTTT	3	671494	671504	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
1046	NC_008332	ATG	4	673699	673710	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	11415162
1047	NC_008332	GTT	4	674248	674259	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11415162
1048	NC_008332	GA	6	675506	675516	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
1049	NC_008332	GCGG	3	675807	675818	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	Non-Coding
1050	NC_008332	ATTCTG	3	677031	677048	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
1051	NC_008332	T	17	677165	677181	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Zea mays subsp. parviglumis mitochondrion