ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Zea mays subsp. parviglumis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008332	CTCTA	4	4498	4517	20	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_008332	AAATG	4	4520	4539	20	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008332	ATTTC	3	5257	5271	15	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008332	ACGAG	3	5400	5414	15	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008332	GAT	4	8195	8206	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008332	TGGAT	3	18298	18312	15	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008332	TAACA	3	22791	22805	15	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008332	TAGG	3	22965	22976	12	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008332	TTAGT	3	23465	23479	15	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008332	A	12	25031	25042	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008332	GAATGG	3	27413	27430	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008332	TAAG	3	28997	29008	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008332	TCTT	3	30928	30939	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008332	TATT	3	31139	31150	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008332	TAAGT	5	34131	34155	25	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008332	GACT	3	41657	41668	12	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008332	TTTAG	4	49483	49502	20	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008332	GAAA	3	53112	53123	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415164
19	NC_008332	ACA	4	54279	54290	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11415164
20	NC_008332	TCT	4	56414	56425	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11415164
21	NC_008332	GCAA	3	62101	62112	12	50 %	0 %	25 %	25 %	11415164
22	NC_008332	TTCTA	3	66015	66029	15	20 %	60 %	0 %	20 %	11415164
23	NC_008332	CTTA	3	66095	66106	12	25 %	50 %	0 %	25 %	11415164
24	NC_008332	TCCTG	3	72097	72111	15	0 %	40 %	20 %	40 %	11415164
25	NC_008332	TATAT	7	77313	77347	35	40 %	60 %	0 %	0 %	11415164
26	NC_008332	ATT	4	78488	78499	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11415164
27	NC_008332	ATCAA	3	81052	81066	15	60 %	20 %	0 %	20 %	11415164
28	NC_008332	AGA	4	87030	87041	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11415164
29	NC_008332	CAGT	3	89130	89141	12	25 %	25 %	25 %	25 %	11415164
30	NC_008332	CTGT	3	89964	89975	12	0 %	50 %	25 %	25 %	11415164
31	NC_008332	TTAGT	3	90438	90452	15	20 %	60 %	20 %	0 %	11415164
32	NC_008332	CTCTA	4	93396	93415	20	20 %	40 %	0 %	40 %	11415164
33	NC_008332	AAATG	4	93418	93437	20	60 %	20 %	20 %	0 %	11415164
34	NC_008332	ATTTC	3	94155	94169	15	20 %	60 %	0 %	20 %	11415164
35	NC_008332	ACGAG	3	94298	94312	15	40 %	0 %	40 %	20 %	11415164
36	NC_008332	TGGC	3	96867	96878	12	0 %	25 %	50 %	25 %	11415164
37	NC_008332	CAAT	3	105324	105335	12	50 %	25 %	0 %	25 %	11415164
38	NC_008332	CCAAT	3	105336	105350	15	40 %	20 %	0 %	40 %	11415164
39	NC_008332	TACTAG	3	110472	110489	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11415164
40	NC_008332	AAG	4	110607	110618	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11415164
41	NC_008332	TCTTTA	3	111289	111306	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11415164
42	NC_008332	TGGAT	3	116646	116660	15	20 %	40 %	40 %	0 %	11415163
43	NC_008332	ACTTAG	3	121686	121703	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11415163
44	NC_008332	TATAGA	3	122578	122595	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11415163
45	NC_008332	ACTTT	3	124291	124305	15	20 %	60 %	0 %	20 %	11415163
46	NC_008332	GAAA	3	124596	124607	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415163
47	NC_008332	TTGC	3	127525	127536	12	0 %	50 %	25 %	25 %	11415163
48	NC_008332	AGTACT	3	129475	129492	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11415163
49	NC_008332	TATTAC	5	131158	131187	30	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	11415163
50	NC_008332	ATGGAA	3	131189	131206	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11415163
51	NC_008332	GTGA	3	133971	133982	12	25 %	25 %	50 %	0 %	11415163
52	NC_008332	GTACTA	3	142373	142390	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11415163
53	NC_008332	AATTC	3	142929	142943	15	40 %	40 %	0 %	20 %	11415163
54	NC_008332	GATA	3	144384	144395	12	50 %	25 %	25 %	0 %	11415163
55	NC_008332	TACTT	3	148940	148954	15	20 %	60 %	0 %	20 %	11415163
56	NC_008332	ATAGT	3	149468	149482	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415163
57	NC_008332	ACAG	3	151696	151707	12	50 %	0 %	25 %	25 %	11415163
58	NC_008332	TCTA	4	152900	152915	16	25 %	50 %	0 %	25 %	11415163
59	NC_008332	TGAG	3	155989	156000	12	25 %	25 %	50 %	0 %	11415163
60	NC_008332	GTGCC	3	156076	156090	15	0 %	20 %	40 %	40 %	11415163
61	NC_008332	ACCTT	4	157720	157739	20	20 %	40 %	0 %	40 %	11415163
62	NC_008332	AAGC	3	159581	159592	12	50 %	0 %	25 %	25 %	11415163
63	NC_008332	GAA	6	160612	160629	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11415163
64	NC_008332	CTT	4	163098	163109	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11415163
65	NC_008332	TAGTAA	5	165075	165104	30	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11415163
66	NC_008332	TCATA	6	170620	170649	30	40 %	40 %	0 %	20 %	11415163
67	NC_008332	GTC	4	171481	171492	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11415163
68	NC_008332	CT	6	172008	172019	12	0 %	50 %	0 %	50 %	11415163
69	NC_008332	TAGC	3	175334	175345	12	25 %	25 %	25 %	25 %	11415163
70	NC_008332	ATGAGT	3	178510	178527	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415163
71	NC_008332	GGAT	3	186973	186984	12	25 %	25 %	50 %	0 %	11415163
72	NC_008332	CTACA	3	195184	195198	15	40 %	20 %	0 %	40 %	11415163
73	NC_008332	AAAG	3	197379	197390	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415163
74	NC_008332	TTCTT	3	203630	203644	15	0 %	80 %	0 %	20 %	11415163
75	NC_008332	AG	6	204462	204473	12	50 %	0 %	50 %	0 %	11415163
76	NC_008332	GAGC	3	207177	207188	12	25 %	0 %	50 %	25 %	11415163
77	NC_008332	TTAAG	3	214152	214166	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415163
78	NC_008332	TTCTAT	3	217569	217586	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11415163
79	NC_008332	AAAG	3	221840	221851	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415163
80	NC_008332	TCTTAT	5	222169	222198	30	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11415163
81	NC_008332	ATCTT	5	223670	223694	25	20 %	60 %	0 %	20 %	11415163
82	NC_008332	TA	6	224384	224395	12	50 %	50 %	0 %	0 %	11415163
83	NC_008332	GTATTC	3	229940	229957	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11415163
84	NC_008332	TACTA	6	230187	230216	30	40 %	40 %	0 %	20 %	11415163
85	NC_008332	TAGC	3	236879	236890	12	25 %	25 %	25 %	25 %	11415163
86	NC_008332	ACTTT	3	246880	246894	15	20 %	60 %	0 %	20 %	11415163
87	NC_008332	TCAG	3	251313	251324	12	25 %	25 %	25 %	25 %	11415163
88	NC_008332	CATT	3	255013	255024	12	25 %	50 %	0 %	25 %	11415163
89	NC_008332	GCAAA	3	270750	270764	15	60 %	0 %	20 %	20 %	11415163
90	NC_008332	CTATA	3	284356	284370	15	40 %	40 %	0 %	20 %	11415163
91	NC_008332	TAAGT	3	287119	287133	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415163
92	NC_008332	TCGT	3	288686	288697	12	0 %	50 %	25 %	25 %	11415163
93	NC_008332	TGGAT	3	290045	290059	15	20 %	40 %	40 %	0 %	11415163
94	NC_008332	TGAA	3	290426	290437	12	50 %	25 %	25 %	0 %	11415163
95	NC_008332	CTATA	3	290835	290849	15	40 %	40 %	0 %	20 %	11415163
96	NC_008332	T	12	293211	293222	12	0 %	100 %	0 %	0 %	11415163
97	NC_008332	GAA	4	296532	296543	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11415163
98	NC_008332	TCAAA	3	297248	297262	15	60 %	20 %	0 %	20 %	11415163
99	NC_008332	CTTTA	3	298180	298194	15	20 %	60 %	0 %	20 %	11415163
100	NC_008332	CTC	4	299603	299614	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11415163
101	NC_008332	CTATA	3	299680	299694	15	40 %	40 %	0 %	20 %	11415163
102	NC_008332	GAAAT	3	300156	300170	15	60 %	20 %	20 %	0 %	11415163
103	NC_008332	ACTAA	3	301717	301731	15	60 %	20 %	0 %	20 %	11415163
104	NC_008332	TACTA	4	302426	302445	20	40 %	40 %	0 %	20 %	11415163
105	NC_008332	TGTT	3	311516	311527	12	0 %	75 %	25 %	0 %	11415163
106	NC_008332	ATAAGG	3	317620	317637	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11415163
107	NC_008332	CTCTCG	3	319760	319777	18	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	11415163
108	NC_008332	ACT	4	322128	322139	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11415163
109	NC_008332	TATAG	3	322316	322330	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415163
110	NC_008332	TAG	4	322432	322443	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415163
111	NC_008332	TCGC	3	324849	324860	12	0 %	25 %	25 %	50 %	11415163
112	NC_008332	ATA	5	331462	331476	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11415163
113	NC_008332	TAT	4	331492	331503	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11415163
114	NC_008332	ACTAA	3	331791	331805	15	60 %	20 %	0 %	20 %	11415163
115	NC_008332	CTATA	3	332778	332792	15	40 %	40 %	0 %	20 %	11415163
116	NC_008332	GAAAG	3	339634	339648	15	60 %	0 %	40 %	0 %	11415163
117	NC_008332	CTCA	3	343064	343075	12	25 %	25 %	0 %	50 %	11415163
118	NC_008332	AGA	4	348435	348446	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11415163
119	NC_008332	TAGA	3	353388	353399	12	50 %	25 %	25 %	0 %	11415163
120	NC_008332	AGAA	3	355526	355537	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415163
121	NC_008332	CAGATA	3	356673	356690	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11415163
122	NC_008332	TCTAT	3	360023	360037	15	20 %	60 %	0 %	20 %	11415163
123	NC_008332	TATAG	4	364266	364285	20	40 %	40 %	20 %	0 %	11415163
124	NC_008332	CCTGG	3	364997	365011	15	0 %	20 %	40 %	40 %	11415163
125	NC_008332	TAAA	3	366535	366546	12	75 %	25 %	0 %	0 %	11415163
126	NC_008332	AGT	4	367196	367207	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415163
127	NC_008332	ATAGT	4	375685	375704	20	40 %	40 %	20 %	0 %	11415163
128	NC_008332	GCCT	3	377957	377968	12	0 %	25 %	25 %	50 %	11415163
129	NC_008332	ATTCC	3	379942	379956	15	20 %	40 %	0 %	40 %	11415163
130	NC_008332	TAGCTT	3	386183	386200	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11415163
131	NC_008332	ACT	4	390740	390751	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11415163
132	NC_008332	TA	6	393542	393553	12	50 %	50 %	0 %	0 %	11415163
133	NC_008332	TATAG	3	395015	395029	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415163
134	NC_008332	GTAAA	5	396014	396038	25	60 %	20 %	20 %	0 %	11415163
135	NC_008332	TTCTGG	3	396364	396381	18	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	11415163
136	NC_008332	AGAA	3	397596	397607	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415163
137	NC_008332	CTCCA	3	399532	399546	15	20 %	20 %	0 %	60 %	11415163
138	NC_008332	CTA	6	401789	401806	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11415163
139	NC_008332	TTTG	3	403378	403389	12	0 %	75 %	25 %	0 %	11415163
140	NC_008332	TTTC	3	403492	403503	12	0 %	75 %	0 %	25 %	11415163
141	NC_008332	ATT	4	404045	404056	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11415163
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144	NC_008332	TCCT	3	405677	405688	12	0 %	50 %	0 %	50 %	11415163
145	NC_008332	ATAGG	10	407339	407388	50	40 %	20 %	40 %	0 %	11415163
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147	NC_008332	TATAG	5	411505	411529	25	40 %	40 %	20 %	0 %	11415163
148	NC_008332	TTCCAT	3	411976	411993	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	11415163
149	NC_008332	TCTT	3	413251	413262	12	0 %	75 %	0 %	25 %	11415163
150	NC_008332	ATGGCA	3	417117	417134	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	11415163
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153	NC_008332	GTAAA	3	432460	432474	15	60 %	20 %	20 %	0 %	11415163
154	NC_008332	AAAGTA	3	432757	432774	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11415163
155	NC_008332	CAAG	3	433690	433701	12	50 %	0 %	25 %	25 %	11415163
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157	NC_008332	CTTT	3	437375	437386	12	0 %	75 %	0 %	25 %	11415163
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163	NC_008332	GAAAT	3	446809	446823	15	60 %	20 %	20 %	0 %	11415163
164	NC_008332	ACTAA	3	448370	448384	15	60 %	20 %	0 %	20 %	11415163
165	NC_008332	TACTA	4	449079	449098	20	40 %	40 %	0 %	20 %	11415163
166	NC_008332	TGTT	3	458169	458180	12	0 %	75 %	25 %	0 %	11415163
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230	NC_008332	TAATA	3	609896	609910	15	60 %	40 %	0 %	0 %	11415163
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238	NC_008332	TTGC	3	636533	636544	12	0 %	50 %	25 %	25 %	11415164
239	NC_008332	CGGCC	3	640243	640257	15	0 %	0 %	40 %	60 %	11415164
240	NC_008332	TAC	4	644756	644767	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11415164
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243	NC_008332	ATACT	3	653093	653107	15	40 %	40 %	0 %	20 %	11415164
244	NC_008332	TAGGGT	6	654984	655019	36	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	11415164
245	NC_008332	TAA	4	655211	655222	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11415164
246	NC_008332	TACTA	3	656311	656325	15	40 %	40 %	0 %	20 %	11415164
247	NC_008332	TATGA	3	656361	656375	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415164
248	NC_008332	ACC	4	657978	657989	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11415164
249	NC_008332	AAGA	3	658115	658126	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415164
250	NC_008332	TTCCTT	3	659592	659609	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11415164
251	NC_008332	TGGT	3	659796	659807	12	0 %	50 %	50 %	0 %	11415164
252	NC_008332	AAGTA	4	660323	660342	20	60 %	20 %	20 %	0 %	11415164
253	NC_008332	GCCC	3	664009	664020	12	0 %	0 %	25 %	75 %	11415164
254	NC_008332	ATG	4	673699	673710	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415162
255	NC_008332	T	12	677165	677176	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Zea mays subsp. parviglumis mitochondrion