Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Zea perennis mitochondrion
Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Start | End | Tract Length | A% | T% | G% | C% | Imperfection % | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_008331 | CATCT | 3 | 15854 | 15867 | 14 | 20 % | 40 % | 0 % | 40 % | 7 % | 11415157 |
2 | NC_008331 | CTTTT | 4 | 16770 | 16788 | 19 | 0 % | 80 % | 0 % | 20 % | 5 % | 11415157 |
3 | NC_008331 | CTTTA | 20 | 38826 | 38925 | 100 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 2 % | 11415157 |
4 | NC_008331 | CCTTT | 4 | 40123 | 40143 | 21 | 0 % | 60 % | 0 % | 40 % | 9 % | 11415157 |
5 | NC_008331 | ATTCC | 3 | 47226 | 47239 | 14 | 20 % | 40 % | 0 % | 40 % | 7 % | 11415157 |
6 | NC_008331 | GTATA | 3 | 47454 | 47468 | 15 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
7 | NC_008331 | ATAGT | 3 | 51768 | 51782 | 15 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
8 | NC_008331 | TTCAC | 3 | 53072 | 53086 | 15 | 20 % | 40 % | 0 % | 40 % | 6 % | 11415157 |
9 | NC_008331 | TGGAA | 3 | 54911 | 54925 | 15 | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
10 | NC_008331 | GCGTA | 3 | 58239 | 58253 | 15 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
11 | NC_008331 | CTAGG | 3 | 60012 | 60026 | 15 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
12 | NC_008331 | TACTT | 3 | 61778 | 61797 | 20 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 5 % | 11415157 |
13 | NC_008331 | CTATA | 5 | 67823 | 67847 | 25 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 8 % | 11415157 |
14 | NC_008331 | TACAG | 3 | 78772 | 78786 | 15 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 6 % | 11415157 |
15 | NC_008331 | TTTGA | 10 | 82684 | 82731 | 48 | 20 % | 60 % | 20 % | 0 % | 8 % | 11415157 |
16 | NC_008331 | TATAG | 3 | 89119 | 89133 | 15 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
17 | NC_008331 | ATAGA | 4 | 90473 | 90492 | 20 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 5 % | 11415157 |
18 | NC_008331 | AGACG | 3 | 98337 | 98350 | 14 | 40 % | 0 % | 40 % | 20 % | 7 % | 11415157 |
19 | NC_008331 | TATAT | 13 | 98878 | 98945 | 68 | 40 % | 60 % | 0 % | 0 % | 8 % | 11415157 |
20 | NC_008331 | CATCA | 3 | 104193 | 104206 | 14 | 40 % | 20 % | 0 % | 40 % | 7 % | 11415157 |
21 | NC_008331 | TGGAT | 3 | 111429 | 111443 | 15 | 20 % | 40 % | 40 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
22 | NC_008331 | ACTTT | 13 | 119072 | 119136 | 65 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
23 | NC_008331 | TCTAT | 3 | 124707 | 124720 | 14 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 7 % | 11415157 |
24 | NC_008331 | ACTGT | 3 | 126209 | 126222 | 14 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 7 % | 11415157 |
25 | NC_008331 | TCATA | 3 | 141644 | 141658 | 15 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
26 | NC_008331 | GATAG | 6 | 147056 | 147085 | 30 | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | 6 % | 11415157 |
27 | NC_008331 | TGCCT | 3 | 148281 | 148295 | 15 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 6 % | 11415157 |
28 | NC_008331 | TGTTT | 3 | 151547 | 151561 | 15 | 0 % | 80 % | 20 % | 0 % | 6 % | 11415157 |
29 | NC_008331 | GTATA | 3 | 152603 | 152617 | 15 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
30 | NC_008331 | ACCCA | 17 | 153001 | 153085 | 85 | 40 % | 0 % | 0 % | 60 % | 0 % | 11415157 |
31 | NC_008331 | ACTAT | 10 | 154799 | 154847 | 49 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 2 % | 11415157 |
32 | NC_008331 | AAAAG | 3 | 158198 | 158212 | 15 | 80 % | 0 % | 20 % | 0 % | 6 % | 11415157 |
33 | NC_008331 | TCCAA | 5 | 158583 | 158607 | 25 | 40 % | 20 % | 0 % | 40 % | 8 % | 11415157 |
34 | NC_008331 | GAAAT | 3 | 169518 | 169532 | 15 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
35 | NC_008331 | TTGAA | 3 | 177488 | 177502 | 15 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
36 | NC_008331 | TCCTA | 3 | 179273 | 179287 | 15 | 20 % | 40 % | 0 % | 40 % | 6 % | 11415157 |
37 | NC_008331 | TGAAA | 4 | 179453 | 179472 | 20 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 10 % | 11415157 |
38 | NC_008331 | TTTCA | 3 | 185000 | 185013 | 14 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 7 % | 11415157 |
39 | NC_008331 | TTTAC | 3 | 193077 | 193091 | 15 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
40 | NC_008331 | CTAAC | 4 | 200277 | 200296 | 20 | 40 % | 20 % | 0 % | 40 % | 0 % | 11415157 |
41 | NC_008331 | TCCTT | 8 | 203276 | 203315 | 40 | 0 % | 60 % | 0 % | 40 % | 5 % | 11415157 |
42 | NC_008331 | ATACA | 3 | 213866 | 213880 | 15 | 60 % | 20 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
43 | NC_008331 | TACTA | 9 | 214073 | 214116 | 44 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 9 % | 11415157 |
44 | NC_008331 | CCTAT | 28 | 218191 | 218328 | 138 | 20 % | 40 % | 0 % | 40 % | 2 % | 11415157 |
45 | NC_008331 | TCAAT | 3 | 221072 | 221085 | 14 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 7 % | 11415157 |
46 | NC_008331 | ACTTT | 3 | 228829 | 228843 | 15 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
47 | NC_008331 | CTTTA | 3 | 231391 | 231404 | 14 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 7 % | 11415157 |
48 | NC_008331 | TCAAA | 10 | 235424 | 235471 | 48 | 60 % | 20 % | 0 % | 20 % | 8 % | 11415157 |
49 | NC_008331 | TACTT | 7 | 249020 | 249055 | 36 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 8 % | 11415157 |
50 | NC_008331 | ATAGT | 12 | 249559 | 249616 | 58 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 6 % | 11415157 |
51 | NC_008331 | AGCTT | 3 | 251112 | 251126 | 15 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 6 % | 11415157 |
52 | NC_008331 | ATCAA | 3 | 259625 | 259639 | 15 | 60 % | 20 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
53 | NC_008331 | CTGAC | 3 | 276761 | 276774 | 14 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 7 % | 11415157 |
54 | NC_008331 | CATTT | 3 | 277933 | 277947 | 15 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 6 % | 11415157 |
55 | NC_008331 | TCATT | 3 | 280921 | 280934 | 14 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 7 % | 11415157 |
56 | NC_008331 | ACCTT | 3 | 281189 | 281203 | 15 | 20 % | 40 % | 0 % | 40 % | 0 % | 11415157 |
57 | NC_008331 | CCCCA | 3 | 284551 | 284565 | 15 | 20 % | 0 % | 0 % | 80 % | 0 % | 11415157 |
58 | NC_008331 | AACTT | 3 | 288386 | 288400 | 15 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 6 % | 11415157 |
59 | NC_008331 | ACTCA | 3 | 288896 | 288910 | 15 | 40 % | 20 % | 0 % | 40 % | 6 % | 11415157 |
60 | NC_008331 | TTTAC | 3 | 289507 | 289521 | 15 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 6 % | 11415157 |
61 | NC_008331 | CCTTG | 3 | 290175 | 290189 | 15 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 6 % | 11415157 |
62 | NC_008331 | TGGGA | 5 | 292536 | 292560 | 25 | 20 % | 20 % | 60 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
63 | NC_008331 | TGAAG | 3 | 294682 | 294696 | 15 | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | 6 % | 11415157 |
64 | NC_008331 | TTTCA | 3 | 305041 | 305055 | 15 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
65 | NC_008331 | CTAAG | 4 | 310706 | 310724 | 19 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 5 % | 11415157 |
66 | NC_008331 | TAAAG | 3 | 311475 | 311489 | 15 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 6 % | 11415157 |
67 | NC_008331 | ACTAT | 3 | 312038 | 312052 | 15 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
68 | NC_008331 | ATACA | 4 | 313256 | 313275 | 20 | 60 % | 20 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
69 | NC_008331 | ATTTC | 3 | 314365 | 314380 | 16 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 6 % | 11415157 |
70 | NC_008331 | CTTTT | 3 | 315526 | 315540 | 15 | 0 % | 80 % | 0 % | 20 % | 6 % | 11415157 |
71 | NC_008331 | TAAAG | 4 | 316558 | 316577 | 20 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 10 % | 11415157 |
72 | NC_008331 | CTACA | 3 | 323192 | 323206 | 15 | 40 % | 20 % | 0 % | 40 % | 0 % | 11415157 |
73 | NC_008331 | TTGGA | 3 | 326394 | 326408 | 15 | 20 % | 40 % | 40 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
74 | NC_008331 | TATAG | 3 | 343601 | 343615 | 15 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
75 | NC_008331 | ATTTT | 3 | 348800 | 348813 | 14 | 20 % | 80 % | 0 % | 0 % | 7 % | 11415157 |
76 | NC_008331 | TTAGT | 3 | 357004 | 357018 | 15 | 20 % | 60 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
77 | NC_008331 | TTACC | 3 | 367167 | 367182 | 16 | 20 % | 40 % | 0 % | 40 % | 6 % | 11415157 |
78 | NC_008331 | TAATA | 3 | 375612 | 375626 | 15 | 60 % | 40 % | 0 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
79 | NC_008331 | AAAGT | 3 | 376246 | 376260 | 15 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
80 | NC_008331 | TCAAA | 3 | 383492 | 383506 | 15 | 60 % | 20 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
81 | NC_008331 | TAAGT | 3 | 394253 | 394267 | 15 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
82 | NC_008331 | CTAAT | 3 | 402572 | 402586 | 15 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
83 | NC_008331 | TTAGT | 4 | 410345 | 410364 | 20 | 20 % | 60 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
84 | NC_008331 | TATAG | 3 | 413249 | 413268 | 20 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 5 % | Non-Coding |
85 | NC_008331 | TATAT | 3 | 414065 | 414079 | 15 | 40 % | 60 % | 0 % | 0 % | 0 % | Non-Coding |
86 | NC_008331 | AACAA | 5 | 419513 | 419536 | 24 | 80 % | 0 % | 0 % | 20 % | 8 % | Non-Coding |
87 | NC_008331 | CTTTT | 3 | 421620 | 421634 | 15 | 0 % | 80 % | 0 % | 20 % | 6 % | Non-Coding |
88 | NC_008331 | TAAAG | 4 | 422652 | 422671 | 20 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 10 % | Non-Coding |
89 | NC_008331 | CTACA | 3 | 429286 | 429300 | 15 | 40 % | 20 % | 0 % | 40 % | 0 % | Non-Coding |
90 | NC_008331 | AAATG | 3 | 433647 | 433661 | 15 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 6 % | Non-Coding |
91 | NC_008331 | TCTTT | 3 | 437719 | 437733 | 15 | 0 % | 80 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
92 | NC_008331 | TTCTT | 3 | 437764 | 437778 | 15 | 0 % | 80 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
93 | NC_008331 | TGCGT | 3 | 438993 | 439006 | 14 | 0 % | 40 % | 40 % | 20 % | 7 % | 11415157 |
94 | NC_008331 | TTAAG | 3 | 448294 | 448308 | 15 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
95 | NC_008331 | TAGCC | 3 | 451990 | 452004 | 15 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 0 % | 11415157 |
96 | NC_008331 | AGAAA | 3 | 461947 | 461960 | 14 | 80 % | 0 % | 20 % | 0 % | 7 % | 11415157 |
97 | NC_008331 | TACTA | 13 | 464432 | 464497 | 66 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 4 % | 11415157 |
98 | NC_008331 | CAGTA | 3 | 465379 | 465392 | 14 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 7 % | 11415157 |
99 | NC_008331 | CTGAT | 3 | 468910 | 468924 | 15 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 6 % | 11415157 |
100 | NC_008331 | ATACA | 3 | 469973 | 469987 | 15 | 60 % | 20 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
101 | NC_008331 | AGTCT | 3 | 484714 | 484728 | 15 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 6 % | 11415157 |
102 | NC_008331 | AGTTA | 4 | 485530 | 485549 | 20 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 5 % | 11415157 |
103 | NC_008331 | TATAG | 4 | 503591 | 503610 | 20 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
104 | NC_008331 | CTCTG | 3 | 507831 | 507844 | 14 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 7 % | 11415157 |
105 | NC_008331 | TTACA | 3 | 507892 | 507906 | 15 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 6 % | 11415157 |
106 | NC_008331 | GTAGA | 3 | 508655 | 508669 | 15 | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | 0 % | 11415157 |
107 | NC_008331 | AGGAA | 3 | 509806 | 509820 | 15 | 60 % | 0 % | 40 % | 0 % | 6 % | 11415157 |
108 | NC_008331 | CCGAT | 7 | 515438 | 515472 | 35 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 0 % | 11415157 |
109 | NC_008331 | CTATA | 17 | 516102 | 516184 | 83 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 7 % | 11415157 |
110 | NC_008331 | ACTAA | 4 | 518158 | 518177 | 20 | 60 % | 20 % | 0 % | 20 % | 5 % | 11415157 |
111 | NC_008331 | TACTA | 6 | 518874 | 518903 | 30 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 3 % | 11415157 |
112 | NC_008331 | TCTCT | 4 | 523320 | 523340 | 21 | 0 % | 60 % | 0 % | 40 % | 9 % | 11415157 |
113 | NC_008331 | ATTTC | 3 | 523878 | 523891 | 14 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 7 % | 11415157 |
114 | NC_008331 | TTCTC | 3 | 524803 | 524817 | 15 | 0 % | 60 % | 0 % | 40 % | 0 % | 11415157 |
115 | NC_008331 | GCAAA | 3 | 525143 | 525157 | 15 | 60 % | 0 % | 20 % | 20 % | 6 % | 11415157 |
116 | NC_008331 | GAAGT | 3 | 530188 | 530202 | 15 | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | 6 % | 11415157 |
117 | NC_008331 | CTTAA | 3 | 532581 | 532595 | 15 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 6 % | 11415157 |
118 | NC_008331 | TACTA | 3 | 534910 | 534929 | 20 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 0 % | 11415157 |
119 | NC_008331 | TATGA | 4 | 534961 | 534979 | 19 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 5 % | 11415157 |
120 | NC_008331 | GAATA | 3 | 536949 | 536964 | 16 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 6 % | 11415157 |
121 | NC_008331 | AAGTA | 5 | 538936 | 538959 | 24 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 8 % | 11415157 |
122 | NC_008331 | AGAAA | 3 | 541077 | 541090 | 14 | 80 % | 0 % | 20 % | 0 % | 7 % | 11415157 |
123 | NC_008331 | GAAAT | 4 | 547646 | 547666 | 21 | 60 % | 20 % | 20 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
124 | NC_008331 | ATTTC | 4 | 548380 | 548399 | 20 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 5 % | Non-Coding |
125 | NC_008331 | GTAGA | 9 | 548400 | 548444 | 45 | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
126 | NC_008331 | TCAAA | 10 | 553334 | 553381 | 48 | 60 % | 20 % | 0 % | 20 % | 8 % | Non-Coding |