ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Zea perennis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008331	GTAA	5	4218	4237	20	50 %	25 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
2	NC_008331	GAAA	3	4324	4335	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008331	GGAA	4	4396	4411	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_008331	AAGA	3	6372	6382	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_008331	CAAG	4	7446	7461	16	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
6	NC_008331	TTTC	3	9282	9293	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_008331	CTTG	3	15511	15522	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	11415157
8	NC_008331	TCCT	3	18199	18211	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11415157
9	NC_008331	TTGC	3	18323	18334	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	11415157
10	NC_008331	TCAA	3	18775	18785	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11415157
11	NC_008331	CGAT	3	18991	19001	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415157
12	NC_008331	TCGT	3	21248	21260	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	11415157
13	NC_008331	CTTG	3	24366	24377	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	11415157
14	NC_008331	CTTT	3	28612	28623	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415157
15	NC_008331	AAAG	3	29522	29532	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415157
16	NC_008331	AAAG	3	29923	29933	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415157
17	NC_008331	CATT	3	32670	32681	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415157
18	NC_008331	CATT	3	32917	32928	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415157
19	NC_008331	TTTC	4	37256	37271	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	11415157
20	NC_008331	TGGA	3	38089	38099	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	11415157
21	NC_008331	TTAG	3	43466	43476	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11415157
22	NC_008331	AAAG	3	47402	47413	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415157
23	NC_008331	ATCG	3	52501	52511	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415157
24	NC_008331	AGGC	3	56900	56911	12	25 %	0 %	50 %	25 %	0 %	11415157
25	NC_008331	ACTT	3	60577	60589	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	11415157
26	NC_008331	TACT	3	61475	61486	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415157
27	NC_008331	AAAG	3	62341	62351	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415157
28	NC_008331	CAAG	3	62476	62487	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	11415157
29	NC_008331	TTAC	3	62903	62913	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11415157
30	NC_008331	TGCC	3	67874	67885	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	11415157
31	NC_008331	CTGG	3	72676	72687	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	11415157
32	NC_008331	CCAC	3	73490	73501	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	11415157
33	NC_008331	ACTC	3	73858	73870	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	11415157
34	NC_008331	AAAT	3	76027	76037	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11415157
35	NC_008331	AACC	3	78555	78566	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	11415157
36	NC_008331	AATA	3	80048	80059	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11415157
37	NC_008331	AGGC	3	82838	82848	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	11415157
38	NC_008331	CTGA	3	83363	83373	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415157
39	NC_008331	CTTT	3	84034	84045	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415157
40	NC_008331	CGAG	3	84794	84804	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	11415157
41	NC_008331	GCTT	3	86127	86138	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	11415157
42	NC_008331	ATTC	3	86860	86870	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11415157
43	NC_008331	GCAT	4	89514	89528	15	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	11415157
44	NC_008331	TTCA	4	89531	89547	17	25 %	50 %	0 %	25 %	5 %	11415157
45	NC_008331	TAGA	3	94545	94556	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	11415157
46	NC_008331	CTTA	3	95175	95186	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415157
47	NC_008331	TTGA	3	95309	95320	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	11415157
48	NC_008331	CAAG	3	97053	97063	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11415157
49	NC_008331	TAGA	3	98115	98125	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11415157
50	NC_008331	CTGA	3	100411	100421	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415157
51	NC_008331	TTCC	3	100511	100522	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415157
52	NC_008331	GGAG	3	106489	106501	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	11415157
53	NC_008331	GCCC	3	107017	107028	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	11415157
54	NC_008331	AGGG	3	109258	109269	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	11415157
55	NC_008331	CTTT	4	109946	109961	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	11415157
56	NC_008331	TTTA	3	113601	113612	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11415157
57	NC_008331	CATT	3	115109	115119	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11415157
58	NC_008331	ATCC	3	117402	117412	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	11415157
59	NC_008331	CCTT	3	117677	117689	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	11415157
60	NC_008331	GAAA	3	119432	119443	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	11415157
61	NC_008331	CTTA	3	119520	119531	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415157
62	NC_008331	TTGC	3	122357	122368	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	11415157
63	NC_008331	CCGG	3	123839	123851	13	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	11415157
64	NC_008331	AGCT	3	124489	124499	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415157
65	NC_008331	GTTA	3	124932	124942	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11415157
66	NC_008331	CTAT	6	125126	125148	23	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415157
67	NC_008331	CCAC	3	125502	125513	12	25 %	0 %	0 %	75 %	0 %	11415157
68	NC_008331	TTAA	3	126482	126493	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	11415157
69	NC_008331	GTGA	3	128821	128832	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	11415157
70	NC_008331	TGAA	3	135766	135776	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11415157
71	NC_008331	CCTA	3	137212	137223	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11415157
72	NC_008331	AGGG	3	138942	138953	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	11415157
73	NC_008331	TTCT	3	142214	142226	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	11415157
74	NC_008331	GATG	3	143112	143124	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	11415157
75	NC_008331	CTTG	3	143934	143946	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	11415157
76	NC_008331	CGTA	3	148146	148157	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	11415157
77	NC_008331	AACA	3	148369	148380	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11415157
78	NC_008331	GCCT	6	153595	153618	24	0 %	25 %	25 %	50 %	4 %	11415157
79	NC_008331	AAGC	3	159664	159675	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	11415157
80	NC_008331	AACT	3	160248	160259	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11415157
81	NC_008331	AGTG	3	160793	160804	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	11415157
82	NC_008331	CGAA	3	161535	161546	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	11415157
83	NC_008331	TAGA	3	165594	165605	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11415157
84	NC_008331	TAAA	3	167308	167319	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11415157
85	NC_008331	AATT	3	167872	167883	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11415157
86	NC_008331	CTAC	4	170043	170058	16	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	11415157
87	NC_008331	TAAA	3	171418	171428	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11415157
88	NC_008331	TTCT	3	171626	171636	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11415157
89	NC_008331	AAAG	3	171785	171796	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415157
90	NC_008331	CTTC	3	172651	172662	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415157
91	NC_008331	CTCA	3	172754	172765	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	11415157
92	NC_008331	TTAC	3	174394	174404	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11415157
93	NC_008331	TAGA	3	175844	175854	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11415157
94	NC_008331	GAAA	3	176813	176825	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	11415157
95	NC_008331	CCCT	3	177448	177459	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	11415157
96	NC_008331	CTTT	3	181107	181118	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415157
97	NC_008331	AGAA	3	186825	186837	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	11415157
98	NC_008331	CTTT	3	187526	187536	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11415157
99	NC_008331	GAAA	3	188136	188148	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	11415157
100	NC_008331	GGAG	3	190204	190215	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	11415157
101	NC_008331	CTTG	4	191857	191873	17	0 %	50 %	25 %	25 %	5 %	11415157
102	NC_008331	AATA	3	192233	192244	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11415157
103	NC_008331	TACT	3	192513	192523	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11415157
104	NC_008331	GAAT	3	194371	194383	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	11415157
105	NC_008331	TCAT	3	196907	196919	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	11415157
106	NC_008331	GAAC	3	201685	201696	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	11415157
107	NC_008331	TCCA	3	201875	201885	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	11415157
108	NC_008331	CTTT	3	204998	205008	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11415157
109	NC_008331	ATTT	3	206172	206183	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11415157
110	NC_008331	GAAA	3	206647	206657	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415157
111	NC_008331	GGCA	3	206972	206982	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	11415157
112	NC_008331	CAGT	3	207860	207871	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	11415157
113	NC_008331	ATTC	3	207955	207965	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11415157
114	NC_008331	ATGC	3	208077	208087	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415157
115	NC_008331	CTAT	3	208275	208285	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11415157
116	NC_008331	AGCC	3	209289	209300	12	25 %	0 %	25 %	50 %	0 %	11415157
117	NC_008331	AAGA	3	212341	212352	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	11415157
118	NC_008331	TCTA	3	214253	214263	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11415157
119	NC_008331	AACT	3	215562	215572	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11415157
120	NC_008331	TTAG	3	215586	215598	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11415157
121	NC_008331	ACTT	3	218072	218083	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415157
122	NC_008331	AGGA	4	219965	219980	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	11415157
123	NC_008331	TTTC	5	220798	220817	20	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	11415157
124	NC_008331	AAAG	3	220932	220942	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415157
125	NC_008331	GGAT	3	221445	221457	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	11415157
126	NC_008331	TTTC	3	221648	221659	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415157
127	NC_008331	GATT	3	225110	225122	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11415157
128	NC_008331	TCTT	3	227312	227323	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415157
129	NC_008331	ATGT	3	234086	234098	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11415157
130	NC_008331	TCAG	3	234782	234792	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415157
131	NC_008331	GCCT	3	235307	235317	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	11415157
132	NC_008331	TGAT	3	238092	238102	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11415157
133	NC_008331	GGTT	3	239589	239600	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	11415157
134	NC_008331	GAGT	3	244285	244297	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	11415157
135	NC_008331	GTGG	3	244654	244665	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	11415157
136	NC_008331	CCAG	3	245468	245479	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	11415157
137	NC_008331	TACC	3	249130	249140	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	11415157
138	NC_008331	GCTT	3	249342	249353	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	11415157
139	NC_008331	TTGA	3	251549	251560	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	11415157
140	NC_008331	ACAG	4	251793	251808	16	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	11415157
141	NC_008331	TTTC	3	252315	252325	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11415157
142	NC_008331	TCTA	4	253001	253016	16	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	11415157
143	NC_008331	ATGC	3	253164	253179	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	11415157
144	NC_008331	CTTT	3	256133	256144	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	11415157
145	NC_008331	TTGA	3	260348	260358	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11415157
146	NC_008331	GAAA	4	264400	264415	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	11415157
147	NC_008331	TCTT	3	264805	264815	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11415157
148	NC_008331	GAAG	3	267114	267124	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
149	NC_008331	GTGA	3	270672	270682	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	11415157
150	NC_008331	GCAA	3	273386	273397	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	11415157
151	NC_008331	ACTT	3	275633	275644	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415157
152	NC_008331	CTTA	3	277385	277396	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	11415157
153	NC_008331	GCAA	3	277780	277791	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	11415157
154	NC_008331	TTGG	4	280812	280827	16	0 %	50 %	50 %	0 %	6 %	11415157
155	NC_008331	CTTA	3	283756	283767	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415157
156	NC_008331	AAAG	4	285393	285408	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	11415157
157	NC_008331	GATT	4	285651	285667	17	25 %	50 %	25 %	0 %	5 %	11415157
158	NC_008331	TTCT	3	287513	287524	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415157
159	NC_008331	TAAG	3	289158	289168	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11415157
160	NC_008331	TTAC	3	289898	289908	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11415157
161	NC_008331	TTGA	3	291537	291547	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11415157
162	NC_008331	CTTT	3	293355	293366	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415157
163	NC_008331	GGCT	3	295485	295495	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	11415157
164	NC_008331	CAGT	3	295523	295535	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	11415157
165	NC_008331	AGAA	3	297070	297081	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415157
166	NC_008331	ACTA	3	298673	298683	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11415157
167	NC_008331	ACTA	3	303031	303042	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11415157
168	NC_008331	TCGC	3	303584	303595	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	11415157
169	NC_008331	AAAT	3	304635	304645	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11415157
170	NC_008331	TGCT	4	305130	305144	15	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	11415157
171	NC_008331	ATTG	3	308120	308131	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	11415157
172	NC_008331	ATTT	3	309378	309389	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11415157
173	NC_008331	CTTT	3	312258	312268	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11415157
174	NC_008331	CTTT	3	314591	314602	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415157
175	NC_008331	CGAA	3	314978	314988	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11415157
176	NC_008331	GGAT	3	315015	315029	15	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	11415157
177	NC_008331	TTCG	3	315671	315682	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	11415157
178	NC_008331	TCTT	3	317717	317728	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415157
179	NC_008331	CTTG	3	317890	317900	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	11415157
180	NC_008331	AGGA	3	318161	318172	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415157
181	NC_008331	CTCG	3	319442	319452	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	11415157
182	NC_008331	TCCA	3	320193	320204	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11415157
183	NC_008331	TTTG	3	321332	321342	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11415157
184	NC_008331	ATTG	3	325106	325118	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11415157
185	NC_008331	TAAG	3	325289	325300	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11415157
186	NC_008331	AAAG	3	325399	325410	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	11415157
187	NC_008331	AAGA	3	325814	325824	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415157
188	NC_008331	TGAG	3	328352	328363	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	11415157
189	NC_008331	TCTT	3	328891	328902	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415157
190	NC_008331	TCTG	3	330453	330464	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	11415157
191	NC_008331	AGAA	3	334947	334957	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415157
192	NC_008331	TTGA	3	343337	343347	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11415157
193	NC_008331	TAAA	4	345859	345874	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	11415157
194	NC_008331	AAAG	3	346335	346345	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415157
195	NC_008331	GGAA	3	348962	348973	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415157
196	NC_008331	GCCA	3	351123	351133	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	11415157
197	NC_008331	CAGT	3	355694	355705	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	11415157
198	NC_008331	CTGT	3	356530	356541	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	11415157
199	NC_008331	GTAA	5	359682	359701	20	50 %	25 %	25 %	0 %	10 %	11415157
200	NC_008331	GAAA	3	359788	359799	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415157
201	NC_008331	GGAA	4	359860	359875	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	11415157
202	NC_008331	AAGA	3	361836	361846	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415157
203	NC_008331	CAAG	4	362910	362925	16	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	11415157
204	NC_008331	CCTA	3	367127	367139	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	11415157
205	NC_008331	CTTC	3	367466	367477	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415157
206	NC_008331	AATG	3	368079	368090	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	11415157
207	NC_008331	AAGC	3	369038	369048	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11415157
208	NC_008331	AGAA	4	369425	369440	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	11415157
209	NC_008331	TAAC	3	371070	371080	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11415157
210	NC_008331	CTGA	3	371787	371798	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	11415157
211	NC_008331	GGAA	3	372639	372649	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
212	NC_008331	TTCT	3	379408	379419	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415157
213	NC_008331	CTTT	3	379441	379451	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11415157
214	NC_008331	CATA	3	381231	381242	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11415157
215	NC_008331	AAAG	3	381712	381722	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415157
216	NC_008331	GCTA	3	382057	382069	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	11415157
217	NC_008331	AGAT	3	382697	382709	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	11415157
218	NC_008331	GATT	3	386345	386356	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	11415157
219	NC_008331	CTAT	3	387473	387485	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	11415157
220	NC_008331	CAAC	3	388681	388691	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	11415157
221	NC_008331	TAAG	3	389118	389129	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	11415157
222	NC_008331	TGAA	3	390292	390304	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	11415157
223	NC_008331	TCTT	3	391042	391053	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	11415157
224	NC_008331	TATT	4	391260	391275	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11415157
225	NC_008331	CAAT	3	392710	392720	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11415157
226	NC_008331	GAAA	3	393406	393416	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11415157
227	NC_008331	ATGA	3	393511	393522	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11415157
228	NC_008331	AGGA	3	395362	395372	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
229	NC_008331	CAAC	3	395455	395466	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	11415157
230	NC_008331	AGAA	3	396597	396608	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415157
231	NC_008331	GAAG	3	397292	397302	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
232	NC_008331	GATG	3	400013	400025	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	11415157
233	NC_008331	GACT	3	401736	401747	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	11415157
234	NC_008331	TTAT	3	406203	406214	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11415157
235	NC_008331	CTTT	3	407847	407858	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11415157
236	NC_008331	CAAA	3	408940	408950	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11415157
237	NC_008331	ATGG	3	410811	410822	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	11415157
238	NC_008331	TTTC	3	412331	412342	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
239	NC_008331	CCTT	3	420184	420195	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
240	NC_008331	GATC	3	420538	420549	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
241	NC_008331	CTTT	3	420685	420696	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
242	NC_008331	CGAA	3	421072	421082	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
243	NC_008331	GGAT	3	421109	421123	15	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
244	NC_008331	TTCG	3	421765	421776	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
245	NC_008331	TCTT	3	423811	423822	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
246	NC_008331	CTTG	3	423984	423994	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
247	NC_008331	AGGA	3	424255	424266	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
248	NC_008331	CTCG	3	425536	425546	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
249	NC_008331	TCCA	3	426287	426298	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
250	NC_008331	TTTG	3	427426	427436	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
251	NC_008331	ATTG	3	431200	431212	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
252	NC_008331	TAAG	3	431383	431394	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
253	NC_008331	AAAG	3	431493	431504	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_008331	AAGA	3	431908	431918	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
255	NC_008331	AGTA	3	433500	433511	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
256	NC_008331	CTTT	3	434531	434541	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
257	NC_008331	AATA	3	434993	435004	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
258	NC_008331	TGGA	4	436198	436213	16	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	11415157
259	NC_008331	TCTA	3	436214	436225	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415157
260	NC_008331	CCTT	3	437944	437954	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	11415157
261	NC_008331	GAGC	3	441310	441321	12	25 %	0 %	50 %	25 %	0 %	11415157
262	NC_008331	AGAA	3	442116	442127	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415157
263	NC_008331	TAAG	3	446338	446350	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	11415157
264	NC_008331	AATA	3	452643	452653	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11415157
265	NC_008331	AAAG	4	452656	452672	17	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	11415157
266	NC_008331	CCAG	3	453157	453167	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	11415157
267	NC_008331	AAAG	3	455986	455997	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	11415157
268	NC_008331	ACTT	3	460482	460493	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11415157
269	NC_008331	ATTT	3	463434	463445	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11415157
270	NC_008331	GGGC	3	469648	469658	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	11415157
271	NC_008331	CAAA	3	469904	469915	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11415157
272	NC_008331	TAGC	3	471154	471165	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	11415157
273	NC_008331	GCTG	3	471174	471185	12	0 %	25 %	50 %	25 %	0 %	11415157
274	NC_008331	GGCA	3	473129	473139	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	11415157
275	NC_008331	CATT	3	473831	473843	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	11415157
276	NC_008331	AGCG	3	475830	475840	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	11415157
277	NC_008331	ACGG	3	477052	477063	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	11415157
278	NC_008331	AGGT	3	477336	477347	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	11415157
279	NC_008331	AACG	3	478658	478669	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	11415157
280	NC_008331	GGAA	3	479633	479643	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	11415157
281	NC_008331	GACT	3	483878	483889	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	11415157
282	NC_008331	GCTT	3	486203	486214	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	11415157
283	NC_008331	CAAG	3	487436	487446	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11415157
284	NC_008331	GTAA	3	489434	489444	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11415157
285	NC_008331	TGTT	3	492803	492814	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	11415157
286	NC_008331	GAAG	3	496702	496713	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	11415157
287	NC_008331	ACAG	3	499307	499319	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	11415157
288	NC_008331	TAGC	3	500957	500969	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	11415157
289	NC_008331	CAAA	3	505133	505143	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11415157
290	NC_008331	GTTA	3	506107	506119	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11415157
291	NC_008331	CTTT	3	508311	508321	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11415157
292	NC_008331	TGCT	3	510539	510551	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	11415157
293	NC_008331	AATG	3	516528	516539	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11415157
294	NC_008331	GTTA	3	516977	516987	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11415157
295	NC_008331	CTTG	3	517175	517186	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	11415157
296	NC_008331	CCTA	3	522272	522283	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11415157
297	NC_008331	CCTA	3	531990	532001	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11415157
298	NC_008331	AAGA	6	536724	536748	25	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415157
299	NC_008331	TGGT	3	538404	538415	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	11415157
300	NC_008331	GCAT	3	538576	538586	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11415157
301	NC_008331	TCCT	3	538592	538603	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11415157
302	NC_008331	AAAG	3	540953	540964	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11415157
303	NC_008331	GCCC	3	542619	542630	12	0 %	0 %	25 %	75 %	0 %	11415157
304	NC_008331	AGGG	3	543797	543808	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
305	NC_008331	TTCT	4	545041	545057	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
306	NC_008331	GAAT	3	549195	549205	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
307	NC_008331	CTCG	3	551261	551271	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
308	NC_008331	AATA	3	551643	551654	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
309	NC_008331	AAAG	3	552020	552031	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
310	NC_008331	TCAG	3	552692	552702	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
311	NC_008331	GCCT	3	553217	553227	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
312	NC_008331	TGAT	3	556002	556012	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
313	NC_008331	GGTT	3	557499	557510	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
314	NC_008331	GGGT	3	565439	565449	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	11415155
315	NC_008331	GCGG	3	565558	565569	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	Non-Coding
316	NC_008331	CTTT	3	566924	566935	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Zea perennis mitochondrion