ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Liriodendron tulipifera chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008326	CAG	4	1106	1117	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	114107026
2	NC_008326	GAA	4	3026	3037	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	114107027
3	NC_008326	CAT	4	6654	6665	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_008326	AAT	4	10063	10074	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_008326	TAT	5	14281	14294	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_008326	TTA	5	14895	14910	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_008326	TGT	4	17977	17987	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	114107036
8	NC_008326	GTT	4	24876	24887	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	114107037
9	NC_008326	ATA	4	33322	33332	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_008326	GTA	4	35082	35092	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_008326	TTG	4	37381	37391	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	114107042
12	NC_008326	ATG	4	41390	41400	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	114107045
13	NC_008326	GCA	4	43288	43299	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	114107046
14	NC_008326	TAA	4	44893	44905	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_008326	ATT	4	47347	47358	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_008326	AGT	4	48263	48274	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	114107048
17	NC_008326	TAT	4	49171	49182	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_008326	ATT	4	49190	49200	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_008326	TAG	4	57891	57902	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	114107053
20	NC_008326	ATA	7	57914	57933	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	114107053
21	NC_008326	TTA	4	63270	63280	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_008326	CTT	4	67574	67586	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
23	NC_008326	TCT	4	71583	71594	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_008326	CTG	4	74010	74021	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	114107070
25	NC_008326	AAG	4	74266	74277	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	114107070
26	NC_008326	TAT	5	74744	74759	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	114107070
27	NC_008326	TCT	4	74786	74797	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	114107070
28	NC_008326	ATA	4	82864	82875	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	114107070
29	NC_008326	GGA	4	83973	83985	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	114107070
30	NC_008326	CTT	4	88249	88260	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	114107070
31	NC_008326	GAT	4	90077	90087	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	114107070
32	NC_008326	GAT	4	93102	93113	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	114107070
33	NC_008326	TGA	4	94835	94846	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	114107070
34	NC_008326	CTT	4	107401	107412	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	114107105
35	NC_008326	ATT	4	115346	115358	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	114107105
36	NC_008326	TTA	4	116861	116872	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	114107105
37	NC_008326	ATT	4	117508	117518	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	114107105
38	NC_008326	TAT	4	119393	119403	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	114107105
39	NC_008326	CTT	4	120188	120198	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	114107105
40	NC_008326	AAC	4	123281	123291	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	114107105
41	NC_008326	AAT	4	128799	128810	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	114107105
42	NC_008326	CTT	4	131387	131398	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	114107105
43	NC_008326	TTA	4	131633	131645	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	114107105
44	NC_008326	TTA	4	145057	145068	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	114107105
45	NC_008326	ATC	4	154924	154935	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	114107109
46	NC_008326	ATC	4	157950	157960	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Liriodendron tulipifera chloroplast