ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Liriodendron tulipifera chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008326	A	18	245	262	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_008326	A	13	310	322	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_008326	GAAA	4	368	384	17	75 %	0 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_008326	CAG	4	1106	1117	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	114107026
5	NC_008326	AAGT	3	1212	1222	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	114107026
6	NC_008326	A	12	1771	1782	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_008326	GATA	3	1873	1885	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_008326	GAA	4	3026	3037	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	114107027
9	NC_008326	A	23	4432	4454	23	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_008326	T	13	4626	4638	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008326	TCTCT	3	5227	5240	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	114107028
12	NC_008326	ATTTT	3	5808	5822	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	114107028
13	NC_008326	CAT	4	6654	6665	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_008326	TAAAG	3	7183	7198	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_008326	C	14	7219	7232	14	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008326	TATTTT	3	7528	7544	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_008326	GATAA	3	8724	8738	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_008326	GA	6	9305	9316	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_008326	TA	6	9487	9498	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_008326	AAT	4	10063	10074	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_008326	T	12	10739	10750	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_008326	ATCT	3	10778	10789	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
23	NC_008326	GTTT	3	11362	11373	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	114107031
24	NC_008326	A	25	12804	12828	25	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_008326	A	16	13922	13937	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	114107032
26	NC_008326	T	14	14196	14209	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_008326	TAT	5	14281	14294	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_008326	AAAT	3	14857	14868	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_008326	TTA	5	14895	14910	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_008326	TGAA	3	15540	15552	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_008326	T	14	15588	15601	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_008326	T	13	15893	15905	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008326	A	14	15907	15920	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_008326	TGT	4	17977	17987	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	114107036
35	NC_008326	TCAA	3	18070	18081	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	114107036
36	NC_008326	T	14	19833	19846	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	114107036
37	NC_008326	TTCA	3	23925	23936	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	114107037
38	NC_008326	GAAT	3	24024	24034	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	114107037
39	NC_008326	GTT	4	24876	24887	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	114107037
40	NC_008326	GAAA	3	27522	27534	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	114107038
41	NC_008326	TCAT	3	28182	28192	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
42	NC_008326	GTCTT	3	28406	28419	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
43	NC_008326	GT	6	29126	29136	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_008326	A	15	29258	29272	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_008326	C	12	32527	32538	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	Non-Coding
46	NC_008326	ATA	4	33322	33332	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_008326	TGTA	3	33921	33932	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_008326	T	15	34522	34536	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_008326	TAAAG	3	34906	34921	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_008326	TA	6	35065	35076	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_008326	GTA	4	35082	35092	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_008326	GAAA	3	36976	36987	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	114107042
53	NC_008326	TTG	4	37381	37391	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	114107042
54	NC_008326	TATT	6	38060	38084	25	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_008326	AG	6	38181	38191	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_008326	TC	6	38785	38795	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	114107043
57	NC_008326	A	14	38953	38966	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008326	AT	11	39033	39052	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
59	NC_008326	GAAT	3	41035	41045	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	114107045
60	NC_008326	ATG	4	41390	41400	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	114107045
61	NC_008326	AATG	3	42883	42894	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	114107046
62	NC_008326	GCA	4	43288	43299	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	114107046
63	NC_008326	TG	6	43325	43335	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	114107046
64	NC_008326	TTCCT	3	44597	44610	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
65	NC_008326	TTTA	3	44632	44643	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_008326	TAA	4	44893	44905	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_008326	ATATCT	3	44917	44934	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
68	NC_008326	ATCA	3	45499	45509	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	114107047
69	NC_008326	TCTT	4	45988	46003	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	114107047
70	NC_008326	TCTT	3	46905	46915	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	114107047
71	NC_008326	TAAA	4	46958	46973	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	114107047
72	NC_008326	A	24	46967	46990	24	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	114107047
73	NC_008326	ATT	4	47347	47358	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_008326	AGT	4	48263	48274	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	114107048
75	NC_008326	T	15	48532	48546	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_008326	AAAG	3	48793	48803	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_008326	ATTAAT	3	49005	49023	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_008326	TAT	4	49171	49182	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_008326	ATT	4	49190	49200	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_008326	TATTA	3	49319	49332	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_008326	GAAA	3	49430	49441	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_008326	GA	7	49493	49506	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_008326	TTGA	3	49763	49775	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_008326	T	13	51232	51244	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_008326	GTTT	3	53218	53230	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_008326	T	12	53553	53564	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008326	T	14	55700	55713	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_008326	TTGTT	3	55912	55925	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_008326	TAG	4	57891	57902	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	114107053
90	NC_008326	ATA	7	57914	57933	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	114107053
91	NC_008326	ATCCA	3	58047	58061	15	40 %	20 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
92	NC_008326	TA	6	60254	60265	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_008326	GTTA	3	60648	60658	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_008326	TATTTT	3	62373	62390	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
95	NC_008326	TTA	4	63270	63280	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_008326	T	12	64356	64367	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_008326	A	15	64743	64757	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_008326	AATG	3	65557	65568	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	114107058
99	NC_008326	G	12	67286	67297	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_008326	A	16	67347	67362	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_008326	T	14	67449	67462	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008326	CTT	4	67574	67586	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
103	NC_008326	A	13	69885	69897	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_008326	TTGCA	3	70556	70569	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
105	NC_008326	GAAT	3	71225	71236	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_008326	CTAT	3	71556	71566	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_008326	TCT	4	71583	71594	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
108	NC_008326	TA	8	71887	71902	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_008326	A	13	72389	72401	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_008326	T	12	72421	72432	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008326	ATTT	3	73061	73071	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_008326	ATAA	4	73164	73179	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
113	NC_008326	CTG	4	74010	74021	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	114107070
114	NC_008326	AAG	4	74266	74277	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	114107070
115	NC_008326	TTTA	3	74459	74470	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	114107070
116	NC_008326	T	12	74536	74547	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	114107070
117	NC_008326	TAT	5	74744	74759	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	114107070
118	NC_008326	TCT	4	74786	74797	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	114107070
119	NC_008326	T	14	75521	75534	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	114107070
120	NC_008326	TGAA	3	76135	76145	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	114107070
121	NC_008326	T	14	77960	77973	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	114107070
122	NC_008326	CATTC	3	79143	79156	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	114107070
123	NC_008326	ATA	4	82864	82875	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	114107070
124	NC_008326	T	12	82882	82893	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	114107070
125	NC_008326	TACG	3	82994	83006	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	114107070
126	NC_008326	GGA	4	83973	83985	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	114107070
127	NC_008326	T	18	84511	84528	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	114107070
128	NC_008326	GTTA	3	86439	86449	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	114107070
129	NC_008326	TC	7	87314	87327	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	114107070
130	NC_008326	TC	10	87335	87354	20	0 %	50 %	0 %	50 %	10 %	114107070
131	NC_008326	ACAT	3	87726	87737	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	114107070
132	NC_008326	CTT	4	88249	88260	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	114107070
133	NC_008326	GAT	4	90077	90087	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	114107070
134	NC_008326	TTCT	3	91760	91770	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	114107070
135	NC_008326	CTTT	3	92947	92957	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	114107070
136	NC_008326	GAT	4	93102	93113	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	114107070
137	NC_008326	TGAT	3	94784	94796	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	114107070
138	NC_008326	TGA	4	94835	94846	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	114107070
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141	NC_008326	TCTA	3	97755	97765	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	114107070
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165	NC_008326	TATT	3	117072	117083	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	114107105
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195	NC_008326	CTTA	3	136533	136543	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	114107105
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197	NC_008326	A	13	140944	140956	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	114107105
198	NC_008326	GGAT	3	141110	141121	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	114107105
199	NC_008326	ACTAAT	4	144386	144408	23	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	4 %	114107105
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201	NC_008326	CGAAA	3	146769	146782	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
202	NC_008326	ACCGG	3	149365	149379	15	20 %	0 %	40 %	40 %	6 %	Non-Coding
203	NC_008326	CATAC	3	150698	150711	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
204	NC_008326	TGAA	3	152290	152301	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	114107109
205	NC_008326	ATCA	3	153241	153253	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	114107109
206	NC_008326	TGAT	3	153336	153348	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	114107109
207	NC_008326	ATC	4	154924	154935	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	114107109
208	NC_008326	AAAG	3	155080	155090	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	114107109
209	NC_008326	ATTT	3	156140	156151	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	114107109
210	NC_008326	ATC	4	157950	157960	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Liriodendron tulipifera chloroplast