ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ostreococcus tauri mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008290	ATTT	3	553	564	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11317047
2	NC_008290	CAAG	3	881	891	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11317047
3	NC_008290	ATA	4	2636	2646	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11317047
4	NC_008290	TTTTG	3	5448	5461	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	11317048
5	NC_008290	AAT	4	11399	11410	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11317049
6	NC_008290	T	12	11754	11765	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_008290	A	12	13105	13116	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11317049
8	NC_008290	AC	7	13175	13187	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	11317049
9	NC_008290	TAAA	3	13917	13927	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11317049
10	NC_008290	AT	6	14098	14108	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11317049
11	NC_008290	TTAT	3	15358	15368	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11317049
12	NC_008290	TA	8	15717	15732	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_008290	TTC	4	15861	15872	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11317049
14	NC_008290	TTGT	3	16065	16076	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11317049
15	NC_008290	T	12	16704	16715	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_008290	AAGG	3	17026	17036	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_008290	GACA	5	19196	19215	20	50 %	0 %	25 %	25 %	10 %	Non-Coding
18	NC_008290	CGCT	3	21010	21020	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	11317049
19	NC_008290	TTC	4	21346	21357	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11317049
20	NC_008290	CCAT	3	21903	21914	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11317049
21	NC_008290	CA	6	22176	22187	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
22	NC_008290	AAAT	3	23321	23332	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11317050
23	NC_008290	GCT	4	24679	24690	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11317050
24	NC_008290	TTTC	3	25408	25419	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11317050
25	NC_008290	CTTT	3	25806	25817	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11317050
26	NC_008290	TTTTA	3	25997	26011	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11317050
27	NC_008290	GAAA	3	26274	26285	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_008290	T	12	26315	26326	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11317050
29	NC_008290	TTG	4	27838	27849	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11317050
30	NC_008290	TGG	4	27879	27889	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	11317050
31	NC_008290	TAA	4	28752	28762	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11317050
32	NC_008290	GAA	4	29828	29839	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11317050
33	NC_008290	AGAC	3	30913	30924	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	11317050
34	NC_008290	TAA	4	31039	31050	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11317050
35	NC_008290	ATC	4	31559	31569	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11317050
36	NC_008290	CAT	4	31864	31875	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11317050
37	NC_008290	AGA	4	31968	31978	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11317050
38	NC_008290	A	13	33127	33139	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_008290	TAA	4	33331	33342	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11317051
40	NC_008290	TAAA	3	33760	33770	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11317051
41	NC_008290	ATGG	3	34120	34131	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	11317051
42	NC_008290	AAG	4	34678	34689	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11317051
43	NC_008290	AGCG	3	35014	35024	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	11317051
44	NC_008290	CCTT	3	38998	39008	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
45	NC_008290	ACAA	3	39958	39969	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11317051
46	NC_008290	GAA	4	40162	40173	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11317051
47	NC_008290	AT	6	40305	40318	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_008290	AGA	4	40514	40525	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11317051
49	NC_008290	AATA	3	40665	40675	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11317051
50	NC_008290	AT	6	41926	41936	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11317051
51	NC_008290	AT	6	42100	42111	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11317051
52	NC_008290	GT	7	42848	42861	14	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	11317051
53	NC_008290	T	14	42920	42933	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11317051

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ostreococcus tauri mitochondrion