ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ostreococcus tauri chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008289	CAG	4	63	74	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	193735620
2	NC_008289	AGA	4	109	119	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	193735620
3	NC_008289	ACC	4	757	768	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	193735620
4	NC_008289	CAC	4	840	851	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	193735620
5	NC_008289	GAA	4	1874	1884	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	113170413
6	NC_008289	AAG	4	2153	2164	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	113170413
7	NC_008289	GAAG	3	2202	2213	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	113170413
8	NC_008289	AAT	4	2316	2326	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	113170413
9	NC_008289	TAAT	3	2439	2449	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_008289	CTA	4	2493	2504	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_008289	GAA	5	2894	2907	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	113170415
12	NC_008289	ATTT	3	7144	7155	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008289	TAA	4	7451	7462	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_008289	ATTT	3	7464	7474	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_008289	GCT	4	8502	8513	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	113170420
16	NC_008289	ACTT	3	8975	8986	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	113170421
17	NC_008289	TGAG	3	9995	10005	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	113170421
18	NC_008289	TGA	4	10274	10284	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	113170421
19	NC_008289	GTG	4	10495	10505	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	113170421
20	NC_008289	TCTT	3	12113	12124	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	113170421
21	NC_008289	AATT	4	14057	14071	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_008289	TTAT	3	14102	14112	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_008289	TAAC	3	14221	14232	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_008289	TTAA	4	14492	14506	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_008289	TTAA	3	14775	14786	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	113170423
26	NC_008289	GTTT	3	15826	15837	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	113170425
27	NC_008289	AAT	4	21575	21587	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	113170431
28	NC_008289	TTTA	3	22527	22537	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	113170432
29	NC_008289	TTTA	3	31312	31322	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	113170438
30	NC_008289	AATTC	3	31394	31408	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	113170438
31	NC_008289	ATT	4	33624	33635	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	113170439
32	NC_008289	TAA	4	33720	33731	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	113170439
33	NC_008289	TGT	4	34488	34499	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113170439
34	NC_008289	TGGGC	3	35594	35608	15	0 %	20 %	60 %	20 %	6 %	Non-Coding
35	NC_008289	GA	6	37170	37180	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_008289	AGCG	3	37666	37676	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_008289	CTGA	3	39248	39258	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
38	NC_008289	AACA	3	40535	40546	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
39	NC_008289	AGA	4	40556	40567	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_008289	TCT	4	41234	41245	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	113170441
41	NC_008289	AAAC	3	42067	42077	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
42	NC_008289	GAAA	3	42078	42089	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_008289	AAAC	3	42160	42170	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
44	NC_008289	ATTTT	3	42294	42308	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_008289	GTG	4	43472	43482	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	113170444
46	NC_008289	GAA	4	46704	46715	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	113170450
47	NC_008289	ATTT	3	49183	49194	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	113170454
48	NC_008289	AAAG	3	50133	50143	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	113170455
49	NC_008289	GTA	4	50272	50283	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	113170455
50	NC_008289	GAA	4	51443	51453	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	113170457
51	NC_008289	TTACC	3	54493	54506	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	113170460
52	NC_008289	TGC	4	54583	54594	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	113170460
53	NC_008289	TAAA	3	54991	55001	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_008289	TG	6	58279	58289	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	113170462
55	NC_008289	TG	6	58568	58578	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	113170462
56	NC_008289	AAT	4	58653	58665	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	113170462
57	NC_008289	ATAA	3	61317	61327	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_008289	AAACTG	3	62845	62862	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	113170470
59	NC_008289	GTTT	3	64768	64778	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_008289	GTTT	3	64861	64871	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_008289	AAG	4	65695	65705	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	113170472
62	NC_008289	AAAT	3	66632	66642	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_008289	TCAG	3	67679	67689	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
64	NC_008289	AACT	3	67699	67710	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_008289	TAA	4	68059	68069	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_008289	TC	6	69757	69767	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
67	NC_008289	AGCCC	3	71328	71342	15	20 %	0 %	20 %	60 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ostreococcus tauri chloroplast