ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Oltmannsiellopsis viridis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008256	TAA	4	1	11	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_008256	TAA	4	505	516	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008256	GAT	4	2972	2982	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_008256	CTT	4	4034	4046	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
5	NC_008256	TAT	4	8549	8559	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11081604
6	NC_008256	AAT	4	13955	13966	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11081607
7	NC_008256	TAT	4	16418	16428	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_008256	AGC	4	17642	17653	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_008256	TAA	4	18059	18070	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11081605
10	NC_008256	TAA	4	19361	19371	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11081605
11	NC_008256	TAA	4	20037	20048	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11081605
12	NC_008256	AAT	4	28640	28650	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_008256	AAT	4	28677	28687	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_008256	AAT	4	28751	28761	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_008256	GCT	4	29007	29018	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
16	NC_008256	TAA	4	29057	29067	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_008256	TAT	4	29818	29829	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_008256	TTA	4	32993	33004	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_008256	AGC	4	34726	34737	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11081606
20	NC_008256	TAT	5	34903	34916	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11081606
21	NC_008256	AGC	4	36165	36176	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
22	NC_008256	TAG	4	37322	37333	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11081606
23	NC_008256	ATT	4	37512	37523	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11081606
24	NC_008256	GCA	4	38747	38758	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11081606
25	NC_008256	TGC	4	39259	39270	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_008256	AAG	4	40305	40316	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11081606
27	NC_008256	TAT	4	43623	43633	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_008256	AGC	4	44391	44402	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_008256	GAA	4	45455	45466	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11081607
30	NC_008256	TTA	4	47815	47826	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11081607
31	NC_008256	TAT	4	48071	48082	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11081607
32	NC_008256	TAT	4	50966	50976	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11081607
33	NC_008256	GAA	4	51369	51380	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11081607

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Oltmannsiellopsis viridis mitochondrion