ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Oltmannsiellopsis viridis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008256	TAA	4	1	11	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_008256	TAAA	3	381	392	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008256	TAA	4	505	516	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_008256	TAATAT	4	1516	1539	24	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
5	NC_008256	AATT	3	2770	2781	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_008256	GAT	4	2972	2982	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_008256	CTT	4	4034	4046	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
8	NC_008256	ATTTT	3	4522	4536	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_008256	AATA	3	7339	7350	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008256	TATTT	3	7381	7395	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008256	TAT	4	8549	8559	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11081604
12	NC_008256	AGTT	3	11378	11389	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_008256	TTTA	3	13290	13301	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008256	AAT	4	13955	13966	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11081607
15	NC_008256	ATTC	3	14407	14417	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11081607
16	NC_008256	AAAT	4	16293	16308	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_008256	TAT	4	16418	16428	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_008256	ATAAAT	3	16441	16458	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_008256	ATAAAT	3	16477	16494	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_008256	ATAAAT	3	16513	16530	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_008256	AAATAT	3	16541	16558	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_008256	TATAAA	4	16713	16736	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
23	NC_008256	TAAAA	3	16845	16860	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_008256	AGC	4	17642	17653	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_008256	CT	6	17823	17834	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	11081605
26	NC_008256	TAA	4	18059	18070	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11081605
27	NC_008256	TTTG	3	18322	18332	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11081605
28	NC_008256	TATT	4	18837	18852	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_008256	TTAA	3	19301	19312	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008256	TAA	4	19361	19371	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11081605
31	NC_008256	TTTG	3	19763	19773	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11081605
32	NC_008256	AAAT	3	19791	19802	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11081605
33	NC_008256	TAA	4	20037	20048	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11081605
34	NC_008256	AAAGAA	3	20110	20128	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	11081605
35	NC_008256	TAAA	3	20129	20139	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11081605
36	NC_008256	TCCA	3	22423	22434	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	11081605
37	NC_008256	AACT	3	22477	22488	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11081605
38	NC_008256	AT	7	25665	25678	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_008256	AT	7	25715	25727	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_008256	TTAAT	3	26053	26066	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_008256	TTAA	3	26106	26117	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_008256	TATT	3	26357	26368	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008256	CTGC	3	26515	26525	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
44	NC_008256	TTTG	4	27326	27340	15	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_008256	AAGT	3	28368	28379	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11081605
46	NC_008256	AAT	4	28640	28650	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_008256	AAT	4	28677	28687	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_008256	AAAT	3	28713	28725	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_008256	AAT	4	28751	28761	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_008256	TA	6	28764	28774	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_008256	ATTTAT	3	28816	28832	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_008256	GCT	4	29007	29018	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_008256	TAA	4	29057	29067	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_008256	TAT	4	29818	29829	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_008256	TTA	4	32993	33004	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_008256	ATTT	3	33458	33469	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_008256	AGC	4	34726	34737	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11081606
58	NC_008256	TAT	5	34903	34916	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11081606
59	NC_008256	AAAGT	3	35411	35424	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	11081606
60	NC_008256	AGC	4	36165	36176	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_008256	ATGT	3	36463	36474	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	11081606
62	NC_008256	ACAA	3	36936	36947	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11081606
63	NC_008256	TAG	4	37322	37333	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11081606
64	NC_008256	ATT	4	37512	37523	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11081606
65	NC_008256	GCA	4	38747	38758	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11081606
66	NC_008256	TGC	4	39259	39270	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_008256	TAAAT	4	39696	39714	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
68	NC_008256	AAG	4	40305	40316	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11081606
69	NC_008256	TTAA	3	41017	41028	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_008256	ACGT	3	41124	41134	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_008256	AAAAT	3	41712	41727	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	11081606
72	NC_008256	TATC	3	42258	42268	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11081606
73	NC_008256	TCTT	3	43152	43162	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11081606
74	NC_008256	TAAT	3	43473	43484	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	11081606
75	NC_008256	TATT	3	43564	43575	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_008256	TAT	4	43623	43633	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_008256	AGC	4	44391	44402	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
78	NC_008256	TTAA	3	45070	45080	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11081607
79	NC_008256	GAA	4	45455	45466	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11081607
80	NC_008256	ACTT	3	47139	47150	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11081607
81	NC_008256	TTA	4	47815	47826	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11081607
82	NC_008256	TAT	4	48071	48082	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11081607
83	NC_008256	TTAAA	3	48752	48765	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	11081607
84	NC_008256	ATTT	3	50036	50048	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11081607
85	NC_008256	TAT	4	50966	50976	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11081607
86	NC_008256	GAA	4	51369	51380	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11081607
87	NC_008256	TAAA	3	52992	53003	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11081607

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