ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Mesostigma viride mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008240	TTA	4	450	461	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_008240	AT	7	1257	1270	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_008240	TTTTA	3	1484	1498	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_008240	GAAA	3	1538	1549	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_008240	A	12	1988	1999	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_008240	TGTA	3	2677	2687	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_008240	TA	6	3822	3832	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_008240	TATT	3	4178	4193	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_008240	T	12	4213	4224	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008240	AGC	4	4285	4296	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11022567
11	NC_008240	AGAA	3	4623	4634	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008240	TTAT	3	5930	5940	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_008240	ACTA	3	6046	6056	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_008240	TTTA	3	6398	6409	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_008240	TAT	4	6567	6578	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_008240	GCA	4	7966	7977	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11022568
17	NC_008240	AATA	3	9275	9287	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11022568
18	NC_008240	GAAA	3	10079	10089	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11022568
19	NC_008240	TTTC	3	11252	11263	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11022568
20	NC_008240	AGAA	3	11354	11364	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11022568
21	NC_008240	TAT	4	11686	11697	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11022568
22	NC_008240	T	14	11883	11896	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_008240	AAG	4	11916	11926	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11022568
24	NC_008240	GAA	4	12467	12477	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11022568
25	NC_008240	AATT	3	12513	12523	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11022568
26	NC_008240	TAA	4	12773	12783	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11022568
27	NC_008240	AAT	4	12819	12830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11022568
28	NC_008240	AAT	4	13322	13333	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11022568
29	NC_008240	AAAAT	3	13357	13370	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11022568
30	NC_008240	AAG	4	14430	14440	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11022568
31	NC_008240	TAA	4	16022	16032	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11022568
32	NC_008240	AAAT	3	16067	16077	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11022568
33	NC_008240	ATTT	3	16094	16104	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11022568
34	NC_008240	A	12	16408	16419	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11022568
35	NC_008240	TTCA	3	16519	16530	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11022568
36	NC_008240	A	13	16697	16709	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11022568
37	NC_008240	TAAA	3	16795	16805	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11022568
38	NC_008240	AGAAAA	3	17027	17044	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	11022568
39	NC_008240	T	16	17767	17782	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	11022568
40	NC_008240	AAAT	3	18354	18364	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11022568
41	NC_008240	AAATA	3	18495	18508	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11022568
42	NC_008240	CCAA	3	18576	18587	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	11022568
43	NC_008240	TAAAA	3	19101	19114	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11022568
44	NC_008240	TTG	4	22259	22270	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11022568
45	NC_008240	TAT	4	22379	22391	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11022568
46	NC_008240	TAA	4	23596	23607	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11022568
47	NC_008240	TAA	4	24024	24034	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11022568
48	NC_008240	GAAA	3	25167	25177	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11022568
49	NC_008240	AT	6	25239	25249	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11022568
50	NC_008240	AAATT	3	25273	25287	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	11022568
51	NC_008240	CTACCC	3	26009	26027	19	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	10 %	11022568
52	NC_008240	CCTC	3	26028	26038	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	11022568
53	NC_008240	TGG	4	26247	26258	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	11022568
54	NC_008240	AT	6	26768	26778	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11022568
55	NC_008240	T	12	27046	27057	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11022568
56	NC_008240	TAAA	3	29219	29230	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11022568
57	NC_008240	TTAAT	3	30104	30118	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	11022568
58	NC_008240	T	12	30249	30260	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11022568
59	NC_008240	AGCA	4	30533	30547	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	11022568
60	NC_008240	AAG	4	30666	30676	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11022568
61	NC_008240	TCTT	3	30816	30826	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11022568
62	NC_008240	CTT	4	30874	30885	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11022568
63	NC_008240	AAAG	3	31264	31275	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11022568
64	NC_008240	ATTT	3	31370	31382	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11022568
65	NC_008240	TAAA	3	31407	31419	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11022568
66	NC_008240	TCT	4	31792	31804	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	11022568
67	NC_008240	TTA	4	32239	32250	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11022568
68	NC_008240	AAAT	3	32257	32267	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11022568
69	NC_008240	AT	6	32759	32769	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11022568
70	NC_008240	AT	6	33213	33225	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11022568
71	NC_008240	TCT	4	35179	35189	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11022568
72	NC_008240	GAT	4	35962	35972	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11022568
73	NC_008240	CTT	4	36157	36167	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11022568
74	NC_008240	G	14	37067	37080	14	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	11022568
75	NC_008240	AAAT	4	39403	39417	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	11022568
76	NC_008240	AAAG	3	39765	39775	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11022568
77	NC_008240	A	15	39847	39861	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	11022568
78	NC_008240	AAAT	3	39907	39917	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11022568
79	NC_008240	AGTAAA	3	40408	40425	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	11022568
80	NC_008240	ATTT	3	41153	41164	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11022568
81	NC_008240	AATT	3	41732	41743	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11022568
82	NC_008240	ATTT	3	41825	41835	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11022568
83	NC_008240	T	13	42231	42243	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Mesostigma viride mitochondrion