ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Populus alba chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008235	AAAATA	3	21811	21828	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	110227070
2	NC_008235	TCTATT	3	26885	26903	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
3	NC_008235	AAACAA	3	29229	29245	17	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
4	NC_008235	AACAAA	3	42338	42356	19	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
5	NC_008235	CTTTTG	3	63077	63093	17	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
6	NC_008235	TTTTAA	3	64181	64199	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
7	NC_008235	TTTCTA	3	76826	76843	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	110227125
8	NC_008235	TTTTAT	3	81171	81189	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	110227125
9	NC_008235	TCTTAA	3	84684	84701	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	110227125
10	NC_008235	TAGATA	3	98371	98388	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	110227125
11	NC_008235	TTTGTT	3	98698	98716	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	110227125
12	NC_008235	ATAAGA	3	99997	100014	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	110227103
13	NC_008235	TATTAG	3	100659	100681	23	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	110227103
14	NC_008235	ATTAGT	4	100681	100703	23	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	110227103
15	NC_008235	TTCTAT	5	110476	110506	31	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	9 %	110227103
16	NC_008235	ATAGAA	5	130618	130648	31	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	9 %	110227103
17	NC_008235	ACTAAT	4	140421	140443	23	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	110227103
18	NC_008235	CTAATA	4	140443	140465	23	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	110227103
19	NC_008235	ATCTAT	3	142737	142754	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008235	TAAGAG	3	156424	156441	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Populus alba chloroplast