ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Populus alba chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008235	TAT	5	7023	7036	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_008235	ATT	4	7061	7072	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008235	ATT	4	7181	7191	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_008235	CTA	4	7677	7688	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_008235	ATT	5	8753	8767	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_008235	TTC	4	21510	21520	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	110227070
7	NC_008235	TTC	4	22282	22293	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	110227070
8	NC_008235	GTT	4	22503	22514	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	110227070
9	NC_008235	GCT	4	27075	27085	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_008235	TAT	4	27261	27275	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_008235	GAA	4	28430	28440	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_008235	ATA	9	29948	29972	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_008235	TAT	4	30781	30791	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_008235	TTA	4	31237	31247	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_008235	GGA	4	34107	34118	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	110227075
16	NC_008235	ATG	4	38658	38668	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	110227078
17	NC_008235	GCA	4	40556	40567	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	110227079
18	NC_008235	TAA	14	42716	42756	41	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	110227080
19	NC_008235	TAA	7	42720	42741	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	110227080
20	NC_008235	ATA	4	46643	46654	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_008235	ATA	4	47139	47150	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_008235	AGT	4	49186	49197	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	110227083
23	NC_008235	TAA	4	50519	50529	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_008235	ATA	5	50654	50667	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_008235	ATA	4	54559	54571	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	110227086
26	NC_008235	TAT	4	59248	59258	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_008235	TAT	4	63811	63822	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_008235	TAA	4	65063	65074	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_008235	ATT	4	65622	65632	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_008235	ATA	5	66614	66629	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_008235	ATA	4	66952	66962	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_008235	CTG	4	70370	70381	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	110227125
33	NC_008235	TAA	4	70919	70929	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	110227125
34	NC_008235	TCT	4	74262	74273	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	110227125
35	NC_008235	TAA	4	74895	74906	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	110227125
36	NC_008235	AAT	4	74904	74915	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	110227125
37	NC_008235	ATC	4	76013	76024	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	110227125
38	NC_008235	TCT	4	78789	78799	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	110227125
39	NC_008235	TTA	5	82588	82602	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	110227125
40	NC_008235	TAA	5	84753	84768	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	110227125
41	NC_008235	CTT	4	85229	85240	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	110227125
42	NC_008235	GAT	4	85697	85707	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	110227125
43	NC_008235	GAT	4	87072	87082	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	110227125
44	NC_008235	GAT	4	90123	90134	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	110227125
45	NC_008235	CTT	4	91335	91346	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	110227125
46	NC_008235	GAA	5	110724	110738	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	110227103
47	NC_008235	AAG	5	112375	112389	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	110227103
48	NC_008235	TAA	4	113041	113052	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	110227103
49	NC_008235	ATT	7	113132	113153	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	110227103
50	NC_008235	AAG	4	113798	113809	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	110227103
51	NC_008235	TTA	4	114663	114674	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	110227103
52	NC_008235	ATA	4	116632	116644	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	110227103
53	NC_008235	ATT	5	118253	118267	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	110227103
54	NC_008235	AAT	4	119546	119557	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	110227103
55	NC_008235	TTC	5	121304	121318	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	110227103
56	NC_008235	TAA	4	124713	124725	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	110227103
57	NC_008235	TTA	4	125293	125304	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	110227103
58	NC_008235	GAA	4	129682	129693	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	110227103
59	NC_008235	TTC	6	130382	130400	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	110227103
60	NC_008235	ACC	4	149517	149527	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	110227139
61	NC_008235	ATC	4	150990	151001	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	110227139
62	NC_008235	ATC	4	154042	154052	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
63	NC_008235	ATC	4	155417	155427	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	110227141
64	NC_008235	GAA	5	155883	155897	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	110227141
65	NC_008235	TTA	5	156356	156371	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Populus alba chloroplast