Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Populus alba chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008235TTTA31451551125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
2NC_008235A2118520521100 %0 %0 %0 %4 %Non-Coding
3NC_008235T12263274120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
4NC_008235AAGT3102310331150 %25 %25 %0 %9 %110227060
5NC_008235TGAA3157215831250 %25 %25 %0 %0 %Non-Coding
6NC_008235TCTT322322242110 %75 %0 %25 %9 %110227061
7NC_008235AAAG3283528451175 %0 %25 %0 %9 %110227061
8NC_008235GAAAT4442844482160 %20 %20 %0 %9 %Non-Coding
9NC_008235A174708472417100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
10NC_008235AT6548854981150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
11NC_008235GATAA3619962131560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
12NC_008235TTTC365066517120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
13NC_008235A136659667113100 %0 %0 %0 %7 %110227063
14NC_008235A136780679213100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
15NC_008235TAT5702370361433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
16NC_008235ATT4706170721233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
17NC_008235ATTA4712471391650 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
18NC_008235ATT4718171911133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
19NC_008235ATTT3735773671125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
20NC_008235T1275627573120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_008235CTA4767776881233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
22NC_008235TTTTG379597972140 %80 %20 %0 %7 %Non-Coding
23NC_008235T1787088724170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
24NC_008235ATT5875387671533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
25NC_008235TAAA3958695971275 %25 %0 %0 %8 %110227064
26NC_008235T141038110394140 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
27NC_008235A15103961041015100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
28NC_008235TTTC31110111112120 %75 %0 %25 %8 %110227065
29NC_008235A16120751209016100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
30NC_008235TA612929129391150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
31NC_008235ATAG313279132901250 %25 %25 %0 %0 %Non-Coding
32NC_008235GAAA314160141711275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
33NC_008235CTTT31508015091120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
34NC_008235A14151031511614100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
35NC_008235T161738017395160 %100 %0 %0 %6 %110227069
36NC_008235AT618747187571150 %50 %0 %0 %9 %110227069
37NC_008235T131980019812130 %100 %0 %0 %7 %110227070
38NC_008235TTCA321498215091225 %50 %0 %25 %8 %110227070
39NC_008235TTC42151021520110 %66.67 %0 %33.33 %9 %110227070
40NC_008235T132152321535130 %100 %0 %0 %0 %110227070
41NC_008235GAAT321617216271150 %25 %25 %0 %9 %110227070
42NC_008235AAAATA321811218281883.33 %16.67 %0 %0 %5 %110227070
43NC_008235A18218542187118100 %0 %0 %0 %5 %110227070
44NC_008235TTC42228222293120 %66.67 %0 %33.33 %8 %110227070
45NC_008235GTT42250322514120 %66.67 %33.33 %0 %8 %110227070
46NC_008235T122512425135120 %100 %0 %0 %0 %110227071
47NC_008235A18262012621818100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
48NC_008235T172624426260170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
49NC_008235GATA326538265491250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
50NC_008235TCTATT326885269031916.67 %66.67 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
51NC_008235GCT42707527085110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
52NC_008235TAT427261272751533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
53NC_008235TTTA327880278911225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
54NC_008235T142802928042140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
55NC_008235T182827728294180 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
56NC_008235GAA428430284401166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
57NC_008235TCAT329069290801225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
58NC_008235AAACAA329229292451783.33 %0 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
59NC_008235CT62945629467120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
60NC_008235ATAAA329927299401480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
61NC_008235ATA929948299722566.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
62NC_008235T143004530058140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
63NC_008235A12303763038712100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
64NC_008235T123040830419120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_008235TAT430781307911133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
66NC_008235A12308143082512100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
67NC_008235TTA431237312471133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
68NC_008235AATG331249312591150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
69NC_008235CAAT331306313181350 %25 %0 %25 %7 %Non-Coding
70NC_008235CTTT33144231452110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
71NC_008235TGGG33374133751110 %25 %75 %0 %9 %110227075
72NC_008235GAAA333905339161275 %0 %25 %0 %8 %110227075
73NC_008235GGA434107341181233.33 %0 %66.67 %0 %8 %110227075
74NC_008235TTGC33430634316110 %50 %25 %25 %9 %110227075
75NC_008235AG635110351201150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
76NC_008235TA1535321353513150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
77NC_008235AT735371353841450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
78NC_008235ATG438658386681133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %110227078
79NC_008235AATG340151401621250 %25 %25 %0 %8 %110227079
80NC_008235GCA440556405671233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %110227079
81NC_008235TG64059340603110 %50 %50 %0 %9 %110227079
82NC_008235AACAAA342338423561983.33 %0 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
83NC_008235TAAA342360423701175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
84NC_008235TAA1442716427564166.67 %33.33 %0 %0 %9 %110227080
85NC_008235TAA742720427412266.67 %33.33 %0 %0 %9 %110227080
86NC_008235GTAA344253442631150 %25 %25 %0 %9 %110227080
87NC_008235AT644779447891150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
88NC_008235A14461094612214100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
89NC_008235A18463294634618100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
90NC_008235ATA446643466541266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
91NC_008235AGAA346976469861175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
92NC_008235TATTT347094471081520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
93NC_008235AATT547117471351950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
94NC_008235ATA447139471501266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
95NC_008235A12471474715812100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
96NC_008235T154748147495150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
97NC_008235T144761447627140 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
98NC_008235AAAG347951479611175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
99NC_008235T144798848001140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
100NC_008235T124835848369120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
101NC_008235AGT449186491971233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %110227083
102NC_008235T164976949784160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
103NC_008235TAA450519505291166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
104NC_008235AT750610506221350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
105NC_008235ATA550654506671466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
106NC_008235AT1050841508591950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
107NC_008235TAATT450860508781940 %60 %0 %0 %10 %Non-Coding
108NC_008235AAAG350957509671175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
109NC_008235A16513035131816100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
110NC_008235ACAA451393514071575 %0 %0 %25 %6 %Non-Coding
111NC_008235T135143851450130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
112NC_008235ATTTT351457514711520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
113NC_008235AATA352578525891275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
114NC_008235ATA454559545711366.67 %33.33 %0 %0 %7 %110227086
115NC_008235TAAA354774547851275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
116NC_008235T195499255010190 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
117NC_008235TAT459248592581133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
118NC_008235AATA359570595811275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
119NC_008235AAAC360079600901275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
120NC_008235T196075760775190 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
121NC_008235TA760824608361350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
122NC_008235CTTT36153461546130 %75 %0 %25 %7 %110227091
123NC_008235AT662081620911150 %50 %0 %0 %9 %110227092
124NC_008235TTCTT36299863012150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
125NC_008235CTTTTG36307763093170 %66.67 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
126NC_008235A13635506356213100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
127NC_008235AT1463566635912650 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
128NC_008235TAT463811638221233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
129NC_008235TTTTAA364181641991933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
130NC_008235TAA465063650741266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
131NC_008235T186536465381180 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
132NC_008235AAAT465487655021675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
133NC_008235ATT465622656321133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
134NC_008235A13660476605913100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
135NC_008235T126606066071120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
136NC_008235TA766598666101350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
137NC_008235ATA566614666291666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
138NC_008235AAGT366723667331150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
139NC_008235ATA466952669621166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
140NC_008235TACA367150671611250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
141NC_008235AGTA367258672681150 %25 %25 %0 %9 %110227099
142NC_008235TACA367999680101250 %25 %0 %25 %8 %110227100
143NC_008235AT668121681321250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
144NC_008235TAAA368671686821275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
145NC_008235TTTC36922669238130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
146NC_008235CTG47037070381120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %110227125
147NC_008235A12706237063412100 %0 %0 %0 %8 %110227125
148NC_008235AAAG370869708791175 %0 %25 %0 %9 %110227125
149NC_008235T147088970902140 %100 %0 %0 %7 %110227125
150NC_008235TAA470919709291166.67 %33.33 %0 %0 %9 %110227125
151NC_008235TTTC47114371157150 %75 %0 %25 %6 %110227125
152NC_008235TTTCA371872718861520 %60 %0 %20 %6 %110227125
153NC_008235TGAA372616726261150 %25 %25 %0 %9 %110227125
154NC_008235A12727587276912100 %0 %0 %0 %0 %110227125
155NC_008235TCT47426274273120 %66.67 %0 %33.33 %8 %110227125
156NC_008235TAA474895749061266.67 %33.33 %0 %0 %8 %110227125
157NC_008235AAT474904749151266.67 %33.33 %0 %0 %8 %110227125
158NC_008235TTTC37533975350120 %75 %0 %25 %0 %110227125
159NC_008235TTTC37600076010110 %75 %0 %25 %9 %110227125
160NC_008235ATC476013760241233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %110227125
161NC_008235TTTCTA376826768431816.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %110227125
162NC_008235TTTA477319773351725 %75 %0 %0 %5 %110227125
163NC_008235A15776347764815100 %0 %0 %0 %6 %110227125
164NC_008235TCT47878978799110 %66.67 %0 %33.33 %9 %110227125
165NC_008235TTCT37947379484120 %75 %0 %25 %8 %110227125
166NC_008235T128055280563120 %100 %0 %0 %8 %110227125
167NC_008235A13809138092513100 %0 %0 %0 %0 %110227125
168NC_008235T128114981160120 %100 %0 %0 %8 %110227125
169NC_008235TTTTAT381171811891916.67 %83.33 %0 %0 %5 %110227125
170NC_008235A14817688178114100 %0 %0 %0 %7 %110227125
171NC_008235TA782450824621350 %50 %0 %0 %7 %110227125
172NC_008235TTA582588826021533.33 %66.67 %0 %0 %6 %110227125
173NC_008235TC68305983070120 %50 %0 %50 %8 %110227125
174NC_008235T158330683320150 %100 %0 %0 %6 %110227125
175NC_008235ATTC383412834231225 %50 %0 %25 %8 %110227125
176NC_008235AAAG383441834521275 %0 %25 %0 %8 %110227125
177NC_008235AATG383476834881350 %25 %25 %0 %7 %110227125
178NC_008235TA684181841911150 %50 %0 %0 %9 %110227125
179NC_008235AT684306843161150 %50 %0 %0 %9 %110227125
180NC_008235TAGA384608846191250 %25 %25 %0 %8 %110227125
181NC_008235TCTTAA384684847011833.33 %50 %0 %16.67 %5 %110227125
182NC_008235TAA584753847681666.67 %33.33 %0 %0 %6 %110227125
183NC_008235T168513185146160 %100 %0 %0 %0 %110227125
184NC_008235CTT48522985240120 %66.67 %0 %33.33 %8 %110227125
185NC_008235GAT485697857071133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %110227125
186NC_008235ATATG387029870431540 %40 %20 %0 %6 %110227125
187NC_008235GAT487072870821133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %110227125
188NC_008235TTCT38877888788110 %75 %0 %25 %9 %110227125
189NC_008235CTTT38996889978110 %75 %0 %25 %9 %110227125
190NC_008235GAT490123901341233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %110227125
191NC_008235CTT49133591346120 %66.67 %0 %33.33 %8 %110227125
192NC_008235TGAT391790918021325 %50 %25 %0 %7 %110227125
193NC_008235TGAT391832918441325 %50 %25 %0 %7 %110227125
194NC_008235AATA392682926941375 %25 %0 %0 %7 %110227125
195NC_008235AATA394532945431275 %25 %0 %0 %8 %110227125
196NC_008235CATT495031950451525 %50 %0 %25 %6 %110227125
197NC_008235TCCGG39568795701150 %20 %40 %40 %6 %110227125
198NC_008235TTTCG39826898281140 %60 %20 %20 %7 %110227125
199NC_008235TAGATA398371983881850 %33.33 %16.67 %0 %5 %110227125
200NC_008235TTTGTT39869898716190 %83.33 %16.67 %0 %10 %110227125
201NC_008235ATAAGA3999971000141866.67 %16.67 %16.67 %0 %5 %110227103
202NC_008235TATTAG31006591006812333.33 %50 %16.67 %0 %8 %110227103
203NC_008235ATTAGT41006811007032333.33 %50 %16.67 %0 %8 %110227103
204NC_008235ATCC31039851039961225 %25 %0 %50 %8 %110227103
205NC_008235AAGG31045191045291150 %0 %50 %0 %9 %110227103
206NC_008235GAGG31072341072451225 %0 %75 %0 %8 %110227103
207NC_008235AGGT31074461074571225 %25 %50 %0 %8 %110227103
208NC_008235TAAG31085661085761150 %25 %25 %0 %9 %110227103
209NC_008235A1410919810921114100 %0 %0 %0 %0 %110227103
210NC_008235T14109637109650140 %100 %0 %0 %7 %110227103
211NC_008235TTCTAT51104761105063116.67 %66.67 %0 %16.67 %9 %110227103
212NC_008235GAA51107241107381566.67 %0 %33.33 %0 %6 %110227103
213NC_008235AAG51123751123891566.67 %0 %33.33 %0 %6 %110227103
214NC_008235ATTT31126521126621125 %75 %0 %0 %9 %110227103
215NC_008235TAA41130411130521266.67 %33.33 %0 %0 %8 %110227103
216NC_008235CAAAA31131031131161480 %0 %0 %20 %7 %110227103
217NC_008235ATT71131321131532233.33 %66.67 %0 %0 %9 %110227103
218NC_008235AAG41137981138091266.67 %0 %33.33 %0 %8 %110227103
219NC_008235AAAT31139721139821175 %25 %0 %0 %9 %110227103
220NC_008235TTA41146631146741233.33 %66.67 %0 %0 %8 %110227103
221NC_008235A1211467811468912100 %0 %0 %0 %0 %110227103
222NC_008235AATC31147451147561250 %25 %0 %25 %8 %110227103
223NC_008235A1311475711476913100 %0 %0 %0 %0 %110227103
224NC_008235T15116617116631150 %100 %0 %0 %6 %110227103
225NC_008235ATA41166321166441366.67 %33.33 %0 %0 %7 %110227103
226NC_008235T14118242118255140 %100 %0 %0 %7 %110227103
227NC_008235ATT51182531182671533.33 %66.67 %0 %0 %6 %110227103
228NC_008235T15118590118604150 %100 %0 %0 %0 %110227103
229NC_008235ATGA31186621186731250 %25 %25 %0 %8 %110227103
230NC_008235AAT41195461195571266.67 %33.33 %0 %0 %8 %110227103
231NC_008235T14119925119938140 %100 %0 %0 %0 %110227103
232NC_008235A1212024212025312100 %0 %0 %0 %8 %110227103
233NC_008235TTC5121304121318150 %66.67 %0 %33.33 %6 %110227103
234NC_008235AT71222101222251650 %50 %0 %0 %6 %110227103
235NC_008235AATA31224431224541275 %25 %0 %0 %8 %110227103
236NC_008235CT6123858123869120 %50 %0 %50 %8 %110227103
237NC_008235TGGG3124215124225110 %25 %75 %0 %9 %110227103
238NC_008235A1512436612438015100 %0 %0 %0 %6 %110227103
239NC_008235TAA41247131247251366.67 %33.33 %0 %0 %7 %110227103
240NC_008235T14124826124839140 %100 %0 %0 %7 %110227103
241NC_008235TTA41252931253041233.33 %66.67 %0 %0 %8 %110227103
242NC_008235ATTT31260581260691225 %75 %0 %0 %8 %110227103
243NC_008235T14126244126257140 %100 %0 %0 %7 %110227103
244NC_008235CATT31267841267951225 %50 %0 %25 %0 %110227103
245NC_008235AT71272041272171450 %50 %0 %0 %7 %110227103
246NC_008235TTAG31273371273481225 %50 %25 %0 %8 %110227103
247NC_008235GATT31275231275331125 %50 %25 %0 %9 %110227103
248NC_008235ATTT41276221276361525 %75 %0 %0 %6 %110227103
249NC_008235GTTT3127668127678110 %75 %25 %0 %9 %110227103
250NC_008235TTTC3127702127712110 %75 %0 %25 %9 %110227103
251NC_008235GAA41296821296931266.67 %0 %33.33 %0 %8 %110227103
252NC_008235TTC6130382130400190 %66.67 %0 %33.33 %10 %110227103
253NC_008235ATAGAA51306181306483166.67 %16.67 %16.67 %0 %9 %110227103
254NC_008235A1313137013138213100 %0 %0 %0 %7 %110227103
255NC_008235A1413147813149114100 %0 %0 %0 %7 %110227103
256NC_008235T14131913131926140 %100 %0 %0 %0 %110227103
257NC_008235CTTA31325481325581125 %50 %0 %25 %9 %110227103
258NC_008235CCTT3136595136605110 %50 %0 %50 %9 %110227103
259NC_008235GGAT31371281371391225 %25 %50 %0 %8 %110227103
260NC_008235ACTAAT41404211404432350 %33.33 %0 %16.67 %8 %110227103
261NC_008235CTAATA41404431404652350 %33.33 %0 %16.67 %8 %110227103
262NC_008235ATCTAT31427371427541833.33 %50 %0 %16.67 %0 %Non-Coding
263NC_008235A1314299114300313100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
264NC_008235ACCGG31454221454361520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
265NC_008235AATG41460791460931550 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
266NC_008235CATAC31467771467901440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
267NC_008235TGAT31494171494291325 %50 %25 %0 %7 %110227139
268NC_008235ACC41495171495271133.33 %0 %0 %66.67 %9 %110227139
269NC_008235ATC41509901510011233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %110227139
270NC_008235AAAG31511461511561175 %0 %25 %0 %9 %110227139
271NC_008235TATT31522081522191225 %75 %0 %0 %8 %110227139
272NC_008235ATC41540421540521133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
273NC_008235ATC41554171554271133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %110227141
274NC_008235GAA51558831558971566.67 %0 %33.33 %0 %6 %110227141
275NC_008235A1815597815599518100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
276NC_008235TTA51563561563711633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
277NC_008235TTTA31563731563831125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
278NC_008235TAAGAG31564241564411850 %16.67 %33.33 %0 %5 %Non-Coding
279NC_008235AGAA31564681564781175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding