Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Trichoplax adhaerens mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008151CCGG3130141120 %0 %50 %50 %8 %Non-Coding
2NC_008151AAAT32732831175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
3NC_008151AAGGC3260326171540 %0 %40 %20 %6 %Non-Coding
4NC_008151GACC5283128491925 %0 %25 %50 %10 %Non-Coding
5NC_008151GCGCC330323046150 %0 %40 %60 %6 %Non-Coding
6NC_008151TA6465446641150 %50 %0 %0 %9 %254032034
7NC_008151ATT4466646771233.33 %66.67 %0 %0 %8 %254032034
8NC_008151ATCG4486248771625 %25 %25 %25 %6 %Non-Coding
9NC_008151CGCA8565856893225 %0 %25 %50 %9 %Non-Coding
10NC_008151AAAG3634363531175 %0 %25 %0 %9 %254032038
11NC_008151GAAA3715171621275 %0 %25 %0 %8 %254032039
12NC_008151CGGGG390239037150 %0 %80 %20 %6 %254032033
13NC_008151CGGG31026210274130 %0 %75 %25 %7 %254032033
14NC_008151ACCG310459104701225 %0 %25 %50 %8 %254032033
15NC_008151GCGGAG310502105191816.67 %0 %66.67 %16.67 %5 %254032033
16NC_008151TTG41173911750120 %66.67 %33.33 %0 %8 %254032033
17NC_008151ACAA312792128031275 %0 %0 %25 %8 %254032033
18NC_008151GTTC51356913588200 %50 %25 %25 %5 %254032033
19NC_008151ATT414109141201233.33 %66.67 %0 %0 %8 %254032033
20NC_008151CAT420437204481233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %254032033
21NC_008151CGTAC1523216232897420 %20 %20 %40 %2 %254032033
22NC_008151CTTT32343423444110 %75 %0 %25 %9 %254032033
23NC_008151TGGC52365323672200 %25 %50 %25 %5 %254032033
24NC_008151CTGA723692237192825 %25 %25 %25 %7 %254032033
25NC_008151AAGA324208242201375 %0 %25 %0 %7 %254032033
26NC_008151ATT724403244232133.33 %66.67 %0 %0 %9 %254032033
27NC_008151ATT424512245241333.33 %66.67 %0 %0 %7 %254032033
28NC_008151TAT626238262551833.33 %66.67 %0 %0 %5 %254032033
29NC_008151CAA427455274671366.67 %0 %0 %33.33 %7 %254032033
30NC_008151ATTG327501275121225 %50 %25 %0 %8 %254032033
31NC_008151CCGA328153281631125 %0 %25 %50 %9 %254032033
32NC_008151ATA428365283751166.67 %33.33 %0 %0 %9 %254032033
33NC_008151TCCGGC32951929536180 %16.67 %33.33 %50 %5 %254032033
34NC_008151A12297552976612100 %0 %0 %0 %8 %254032033
35NC_008151TTAAAA330544305621966.67 %33.33 %0 %0 %10 %254032033
36NC_008151ACCG330877308881225 %0 %25 %50 %8 %254032033
37NC_008151ACA431319313301266.67 %0 %0 %33.33 %8 %254032033
38NC_008151AAAT331603316141275 %25 %0 %0 %8 %254032033
39NC_008151TTTAT332089321021420 %80 %0 %0 %7 %254032033
40NC_008151TTTATT332918329361916.67 %83.33 %0 %0 %10 %254032033
41NC_008151CAA533450334641566.67 %0 %0 %33.33 %6 %254032033
42NC_008151TAT433824338351233.33 %66.67 %0 %0 %8 %254032033
43NC_008151TATT334273342831125 %75 %0 %0 %9 %254032033
44NC_008151AACC335541355521250 %0 %0 %50 %8 %254032033
45NC_008151CAAAC1235595356546060 %0 %0 %40 %8 %254032033
46NC_008151CTAGT1035650356995020 %40 %20 %20 %6 %254032033
47NC_008151TAA436288362981166.67 %33.33 %0 %0 %9 %254032033
48NC_008151AAAT336369363791175 %25 %0 %0 %9 %254032033
49NC_008151ACAA336560365711275 %0 %0 %25 %8 %254032033
50NC_008151ATAA336928369381175 %25 %0 %0 %9 %254032033
51NC_008151TTGA337263372741225 %50 %25 %0 %8 %254032033
52NC_008151CCCG33788937900120 %0 %25 %75 %0 %254032033
53NC_008151TAT438569385811333.33 %66.67 %0 %0 %7 %254032033
54NC_008151GCCCG63885038879300 %0 %40 %60 %6 %254032033
55NC_008151AGGG339043390531125 %0 %75 %0 %9 %254032033
56NC_008151CGGAGG439148391712416.67 %0 %66.67 %16.67 %8 %254032033
57NC_008151ATT439254392651233.33 %66.67 %0 %0 %8 %254032033
58NC_008151TAA439667396781266.67 %33.33 %0 %0 %8 %254032033
59NC_008151AAATAT340245402631966.67 %33.33 %0 %0 %10 %254032033
60NC_008151CCCT34058540595110 %25 %0 %75 %9 %254032033
61NC_008151CTC44099941010120 %33.33 %0 %66.67 %8 %254032033
62NC_008151AAAG341107411181275 %0 %25 %0 %8 %254032033
63NC_008151GGCGGA442038420612416.67 %0 %66.67 %16.67 %0 %Non-Coding
64NC_008151GACCCG343010430271816.67 %0 %33.33 %50 %5 %Non-Coding